Interactions moléculaires en biochimie

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Plan du Cours

  1. Dissymétrie chaîne latérale AA
  2. Interactions ioniques et directions
  3. Liaisons hydrogène AA
  4. Interactions dipolaires et Van der Waals
  5. Propriétés spécifiques AA
  6. Stéréochimie des liaisons hydrogène
  7. Interactions ioniques et dipolaires

1. Dissymétrie chaîne latérale AA

Notions clés & Définitions

Dissymétrie stérique : caractéristique de la chaîne latérale des acides aminés qui présente une asymétrie dans l’encombrement spatial autour de l’atome central, influençant la proximité et la force des interactions avec d’autres molécules chargées.

Côté syn : face de la chaîne latérale où l’atome d’azote est relié directement au reste de la chaîne, créant une configuration favorisant certaines interactions.

Côté anti 1 : face de la chaîne où l’atome d’azote est lié au reste de la chaîne, mais sans doublet non-liant, impliquant une disposition différente de l’encombrement.

Côté anti 2 : face où le doublet non-liant de l’azote occupe la place, rendant cette zone moins encombrante et plus accessible pour des interactions.

Projection de Newman décalée : représentation de la configuration spatiale où la dissymétrie de l’encombrement stérique influence la facilité d’accès aux sites de liaison ou d’interaction.

Points essentiels

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Quiz preview

1. Comment la dissymétrie de la chaîne latérale des acides aminés se compare-t-elle entre le côté 'anti 1' et le côté 'anti 2' ?

2. Comment est définie la direction trans dans les interactions ioniques impliquant la Lysine ?

3. Qu'est-ce qu'une interaction de Van der Waals selon la définition fournie ?

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Flashcards preview

Dissymétrie chaîne latérale

Influence la proximité et la force des interactions

Interactions ioniques — direction trans

Alignement linéaire, charge négative face à l’azote

Liaisons hydrogène — groupe hydroxyle

Agissent comme donneur et accepteur, énergie 2-7 kcal/mol

Interactions dipolaires — définition

Forces attractives entre pôles électriques opposés

Propriétés spécifiques AA — pont disulfure

Formé par oxydation de deux cystéines

Stéréochimie liaisons hydrogène — direction anti

Favorise la formation de liaisons dans le plan amide

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Frequently asked questions

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