Hoja de repaso: Principes fondamentaux du métabolisme

📋 Plan du Cours

1. Métabolisme cellulaire : catabolisme et anabolisme
2. Structure et fonction du glycogène dans le métabolisme
3. Cycle de Krebs : réactions enzymatiques et production d’énergie
4. Principales voies métaboliques et métabolisme du glycogène
5. Réactions d’oxydo-réduction et potentiel redox standard
6. Phases et réactions clés de la glycolyse
7. Mécanismes de régulation enzymatique dans le métabolisme
8. Régulation de la pyruvate déshydrogénase et cycle du glyoxylate
9. Voie des pentoses phosphate : réactions et régulation
10. Dégradation des acides gras : β-oxydation et métabolisme associé
11. Photosynthèse bactérienne et transport électronique
12. Régulation du cycle de Calvin et activité de la Rubisco

📖 1. Métabolisme cellulaire : catabolisme et anabolisme

🔑 Notions clés & Définitions

• Anabolisme : Ensemble de réactions enzymatiques de biosynthèse qui permettent la formation de macromolécules ou de leurs précurseurs à partir de molécules simples, nécessitant un apport d'énergie généralement fourni par l'ATP et/ou le pouvoir réducteur du NAD(P)H et du FADH2.
• Acétyl-CoA : Intermédiaire commun issu de la dégradation des glucides, acides aminés et acides gras, qui entre dans le cycle de Krebs pour la production d'énergie.
• Régulation du métabolisme : Contrôle des voies métaboliques visant à équilibrer la dégradation énergétique et la biosynthèse, notamment par la régulation enzymatique et la localisation cellulaire des réactions.
• Catabolisme : Dégradation (catabolisme) des acides gras Activation des acides gras dans le cytosol Passage de l’acyl‐CoA dans la mitochondrie Les réactions de la ‐oxydation 3.

📝 Points essentiels

• Le catabolisme comprend des voies comme la glycolyse, le cycle de Krebs, la dégradation du glycogène, la phosphorylation oxydative, la voie des pentoses phosphates, la β-oxydation des acides gras et la transamination/désamination des acides aminés.
• L’anabolisme regroupe des réactions enzymatiques de biosynthèse nécessitant un apport d’énergie fourni généralement par l’ATP et/ou le pouvoir réducteur du NAD(P)H et du FADH2.
• •Voie des pentoses phosphate (pouvoir réducteur, pentoses pour acides nucléiques) •Gluconéogenèse ou néoglucogenèse (synthèse glucose) •Glycogène (synthèse et dégradation) •Biosynthèse & dégradation des acides gras •Biosynthèse & dégradation des acides aminés •Respiration mitochondriale (conversion de l’énergie chimique et synthèse de l’ATP) •Photosynthèse (conversion de l’énergie lumineuse en énergie chimique, cycle de Calvin) Les grandes voies métaboliques: •Glycolyse (1ère partie dégradation glucose) •Cycle de Krebs ou cycle de l’acide citrique (2ème partie dégradation glucose, acides gras, AA) •Voie des pentoses phosphate (pouvoir réducteur, pentoses pour acides nucléiques) •Gluconéogenèse ou néoglucogenèse (synthèse glucose) •Glycogène (synthèse et dégradation) •Biosynthèse & dégradation des acides gras •Biosynthèse & dégradation des acides aminés •Respiration mitochondriale (conversion de l’énergie chimique et synthèse de l’ATP) •Photosynthèse (conversion de l’énergie lumineuse en énergie chimique, cycle de Calvin) L’axe central du catabolisme est constitué par la glycolyse, le cycle de l’acide citrique (Krebs) et la phosphorylation oxydative (respiration). Si l’axe est parcouru dans sa totalité, on obtient des produits terminaux très simples: H 2O, CO2, NH3, ATP, NADH. Dans ces conditions les animaux ne sont pas capables d’entamer un anabolisme, mais les plantes peuvent

💡 À retenir

L’anabolisme regroupe des réactions enzymatiques de biosynthèse nécessitant un apport d’énergie fourni généralement par l’ATP et/ou le pouvoir réducteur du NAD(P)H et du FADH2.

📖 2. Structure et fonction du glycogène dans le métabolisme

🔑 Notions clés & Définitions

• RÉACTIONS D ’OXYDO - RÉDUCTIONS : Les réactions d’oxydo-réduction sont des processus électrochimiques où des électrons sont transférés d’une espèce chimique à une autre, impliquant un donneur réduit et un accepteur oxydé.
• Exemple : Pression, température, volume, altitude… Ne sont pas des fonctions d’état par exemple: distance, travail etc.;
• Potentiel Redox Standard (E0’) : Le potentiel redox standard E0’ est une grandeur mesurée à pH 7, 1 M, 25°C et 1 atm, qui quantifie la tendance d’une espèce chimique à accepter ou donner des électrons dans des conditions standardisées.
• Aox + Bred  Ared + Box E : Cette équation représente une réaction redox où l’espèce oxydée Aox capte des électrons de l’espèce réduite Bred, conduisant à la formation de Ared et Box, avec une différence de potentiel redox ΔE associée.

📝 Points essentiels

• Le potentiel redox standard E0’ est mesuré à pH 7, 1 M, 25°C, 1 atm, et sert à indiquer la capacité d’une espèce à donner ou capter des électrons.
• L’énergie libre de Gibbs ΔG0’ d’une réaction redox est liée au potentiel redox par la relation ΔG0’ = -nFΔE0’, où n est le nombre d’électrons transférés et F la constante de Faraday.
• Le potentiel redox réel dépend des concentrations des espèces oxydées et réduites selon la formule E = E0’ + (RT/nF) ln([Aox]/[Ared]).

💡 À retenir

Le potentiel redox standard E0’ est mesuré à pH 7, 1 M, 25°C, 1 atm, et sert à indiquer la capacité d’une espèce à donner ou capter des électrons.

📖 3. Cycle de Krebs : réactions enzymatiques et production d’énergie

🔑 Notions clés & Définitions

• Modification Covalente : C'est un mécanisme qui modifie l'activité enzymatique en quelques secondes à minutes via des changements structuraux.
• Contrôle allostérique : C'est une régulation de l'activité enzymatique par la liaison de produits, réactifs ou cofacteurs sur des sites spécifiques, agissant rapidement.
• Inhibition compétitive par le produit : C'est une inhibition qui se produit en moins d'une milliseconde lorsque le produit se lie au site actif, diminuant la vitesse de réaction.
• Régulation allostérique : L'ATP se fixe sur un site régulateur différent du site catalytique de l’enzyme.

📝 Points essentiels

• L’inhibition compétitive par le produit se produit en moins d’une milliseconde lorsque le produit se lie au site actif et diminue la vitesse de réaction.
• Le contrôle allostérique régule l’activité enzymatique par la liaison de produits, réactifs ou cofacteurs sur des sites spécifiques.
• Le contrôle transcriptionnel ajuste le flux métabolique en régulant l’expression génique des enzymes.

💡 À retenir

Identifier les différents niveaux et mécanismes de contrôle enzymatique qui ajustent finement le flux métabolique.

📖 4. Principales voies métaboliques et métabolisme du glycogène

🔑 Notions clés & Définitions

• Pyruvate kinase : Enzyme catalysant la conversion du phosphoénolpyruvate en pyruvate, activée par le fructose-1,6-bisphosphate (feed-forward) et inhibée par l’ATP, avec une réaction pratiquement irréversible.
• Les grandes voies métaboliques : Ensembles cohérents de réactions biochimiques comprenant la glycolyse, le cycle de Krebs, la voie des pentoses phosphate, la néoglucogenèse, ainsi que la synthèse et dégradation des lipides et des acides aminés.
• Type : Catégorie ou nature d’une entité, non définie dans le contenu fourni.
• Hexokinase : Enzyme catalysant la phosphorylation du glucose en glucose-6-phosphate, utilisant Mg-ATP, avec une réaction pratiquement irréversible et un ΔG°’ de -16.7 kJ/mol.

📝 Points essentiels

• Les réactions catalysées par l’hexokinase, la phosphofructokinase-1 et la pyruvate kinase sont pratiquement irréversibles et déterminent le flux glycolytique.
• La phosphofructokinase-1 est une enzyme clé d’engagement de la glycolyse, inhibée par l’ATP via un site allostérique et activée par l’AMP.
• La glycolyse comporte une phase d’investissement d’énergie suivie d’une phase de récupération d’énergie avec production nette d’ATP.
• ÈSE 4. RÉGULATION RÉCIPROQUE GLYCOLYSE / NÉOGLUCOGENÈSE glucose pyruvate Glucose 6- phosphatase Hexokinase Pyruvate kinase PEPCK + Pyruvate carboxylase FBPase PFK Glycolyse  production de l'énergie (ATP) Néoglucogenèse  conservation de l'énergie Néoglucogenèse et Glycolyse se déroulent dans le cytosol et la plupart des métabolites intermédiaires leur sont communs:  Des conflits peuvent apparaître au niveau de leur utilisation.  La régulation réciproque des 2 voies s'impose de manière à les ajuster en fonction de l'état énergétique et des besoins cellulaires: l'une est inhibée lorsque l'autre est active.  Un signal important pour cette régulation est le rapport ATP/AMP. R ÉGULATION ALLOSTÉRIQUE

💡 À retenir

Les étapes irréversibles catalysées par l’hexokinase, la phosphofructokinase-1 et la pyruvate kinase sont régulées allostériquement pour contrôler le flux énergétique dans la glycolyse.

📖 5. Réactions d’oxydo-réduction et potentiel redox standard

🔑 Notions clés & Définitions

• Active T : Forme de la enzyme qui participe à la catalyse d'une réaction, souvent modifiée par phosphorylation ou déphosphorylation pour réguler son activité.
• Glycogène synthase : Enzyme qui allonge la chaîne de glycogène à partir de l'UDP-glucose, en utilisant le primer formé par la glycogénine.
• Phosphorolyse : Processus de dégradation du glycogène par clivage de la liaison α-1,4 à partir de l'extrémité non réductrice, produisant du glucose-1-phosphate.
• Standard de formation : Énergie libre standard associée à la formation d'un composé à partir de ses éléments constitutifs dans des conditions standard.
• Réactions de la ‐oxydation : pour le cerveau) ‐ les acides gras fournissent de Les 4 réactions de la ‐oxydation r1.

📝 Points essentiels

• La glycogénine initie la synthèse du glycogène en auto-glycosylant une chaîne de glucose fixée sur un résidu tyrosine.
• La dégradation du glycogène se fait par phosphorolyse, clivant la liaison α-1,4 à partir de l’extrémité non réductrice.
• La phosphorolyse produit du glucose-1-phosphate avec un ΔG°’ proche de zéro, mais la concentration élevée de Pi rend la réaction favorable.

💡 À retenir

Appréhender la synthèse et la dégradation du glycogène comme un équilibre dynamique régulé par des enzymes spécifiques.

📖 6. Phases et réactions clés de la glycolyse

🔑 Notions clés & Définitions

• Glycolyse (1ère partie dégradation glucose : Voie métabolique qui dégrade le glucose en pyruvate, en produisant de l'énergie sous forme d'ATP et de NADH, et partage des métabolites avec d'autres voies.

📝 Points essentiels

• La glycogénogenèse est la synthèse du glycogène à partir d’UDP-glucose et nécessite la glycogénine et la glycogène synthase.
• La glycogénolyse dégrade le glycogène en glucose-1-phosphate par l’action de la phosphorylase.

💡 À retenir

Les voies métaboliques clés, notamment la glycolyse et la néoglucogenèse, sont régulées pour assurer la gestion du glucose et du glycogène.

📖 7. Mécanismes de régulation enzymatique dans le métabolisme

🔑 Notions clés & Définitions

• Cycle de Krebs : Une voie métabolique mitochondriale composée de huit réactions enzymatiques qui oxyde l’acétyl-CoA en dioxyde de carbone tout en produisant des molécules riches en énergie telles que le NADH, le FADH2 et le GTP/ATP.
• Acétyl-CoA carboxylase : Une enzyme clé de la biosynthèse des acides gras qui catalyse la carboxylation de l’acétyl-CoA, régulée par des mécanismes allostériques et covalents, notamment inhibée par phosphorylation et activée par le fructose 2,6-bisphosphate.

📝 Points essentiels

• Le cycle de Krebs oxyde l’acétyl-CoA en CO2 tout en produisant NADH, FADH2 et GTP/ATP.
• Les étapes du cycle de Krebs de succinate à oxaloacétate sont similaires à celles du cycle du glyoxylate.
• L’acétyl-CoA carboxylase intervient dans la synthèse des acides gras, marquant une étape clé de régulation.

💡 À retenir

Le cycle de Krebs oxyde l’acétyl-CoA en CO2 tout en produisant NADH, FADH2 et GTP/ATP.

📖 8. Régulation de la pyruvate déshydrogénase et cycle du glyoxylate

🔑 Notions clés & Définitions

• Transporteurs : La présence des compartiments rend nécessaire une série de transporteurs sélectifs qui transportent les métabolites à travers les membranes et connectent les différentes voies métaboliques.
• Mitochondries : Organites cellulaires où se déroulent des processus clés du métabolisme énergétique, notamment le cycle de Krebs, la phosphorylation oxydative et la régulation de la production d’ATP.
• Pyruvate déshydrogénase : Complexe enzymatique mitochondrial qui catalyse la décarboxylation oxydative du pyruvate en acétyl-CoA, régulé notamment par la compétition entre NADH/Acétyl-CoA et NAD+/CoA sur ses sites enzymatiques ainsi que par des mécanismes de phosphorylation.
• Cycle du glyoxylate : Voie métabolique permettant la conversion d’acétyl-CoA en composés à quatre carbones sans libération de CO2, essentielle chez certaines bactéries et plantes pour la synthèse de glucose à partir de lipides.

📝 Points essentiels

• La régulation de la pyruvate déshydrogénase équilibre le flux entre glycolyse et cycle de Krebs.
• Le cycle du glyoxylate permet la conversion d’acétyl-CoA en composés à quatre carbones sans perte de CO2, ce qui est important chez certaines bactéries et plantes.
• 6 Pyruvate Acétyl-CoA Pyruvate déshydrogénase Cycle de l’acide citrique 1-Citrate synthase 2-Aconitase 3-Isocitrate déshydrogénase 4- -Cétoglutarate déshydrogénase 5-Succinyl-coA synthétase 6-Succinate déshydrogénase 8-Malate déshydrogénase 7-Fumarase Citrate Isocitrate Succinyl-coA Succinate Fumarate Malate Oxaloacétate -Cétoglutarate CO 2 CO 2 NAD + NADH NADH NADH NADH GTP FADH2 V UE D ’ENSEMBLE DU CYCLE DE KREBS
• 8 réactions enzymatiques nécessaires pour l’oxydation complète de l’acétyl‐CoA (C2) et la récupération de l’énergie sous forme de NADH, FADH2 et GTP
• 1 GTP = 1 ATP l'oxaloacétate (C4) est utilisé par la 1ère réaction et entièrement régénéré par la dernière.

💡 À retenir

La régulation de la pyruvate déshydrogénase équilibre le flux entre glycolyse et cycle de Krebs.

📖 9. Voie des pentoses phosphate : réactions et régulation

🔑 Notions clés & Définitions

• BILAN : Résultat global d'une voie métabolique exprimé en termes de produits formés, de cofacteurs réduits générés et de substrats consommés.
• Voie des pentoses phosphate : Présente Isoenzymes: Deux enzymes qui catalysent la même réaction dans deux compartiments différents (ou des organes différents) sont codés par des gènes différents (protéines optimisées pour les conditions spécifiques du compartiment).
• Chloroplaste : Photosynthèse, Cycle de Calvin, synthèse et dégradation de l’amidon, cycle des pentoses phosphate, glycolyse (partielle), gluconéogenèse (partielle).

📝 Points essentiels

• La voie des pentoses phosphate comprend une phase oxydative menant à la réduction du NADP+ en NADPH et la production de pentoses.
• Les réactions non oxydatives sont réversibles et impliquent des isomérisations et transferts d’unités à 2 ou 3 carbones.
• Les enzymes clés incluent la glucose-6-phosphate déshydrogénase, la transaldolase et la transcétolase.
• Le bilan global produit du ribose-5-phosphate, NADPH et interconvertit des sucres-phosphates pour la biosynthèse.
• PHOSPHATE 1. Introduction  vue d’ensemble de la voie 2. Les réactions de la voie des pentoses phosphates 3. Bilan de la voie des pentoses phosphates 4. Régulation de la voie des pentoses phosphates 11 La phase 1 comprend la fonction principale de la voie: la synthèse de NADPH Glucose-6- phosphate déshydrogénase 6-Phospho glucono lattonase 6-Phospho gluconate déshydrogénase - Les réactions 1 et 3 sont des oxydoréductions (la 3 avec décarboxylation concomitante); la réaction 2 est une réaction d’hydrolyse de la liaison ester intramoléculaire. - La première réaction de la voie (oxydation du glucose) a un G << 0 et donc la réaction est irréversible. P
• PHOSPHATE 19 M ODES DE RÉGULATION DE LA VOIE DES PENTOSES PHOSPHATE ‐ La phosphopentose isomérase et la phosphopentose épimérase catalysent la conversion du xylulose‐5P en Ribose‐5P 20 Exemple: les cellules en division rapide ont besoin de beaucoup de ribose-5P pour la synthèse d’ADN. Transcétolase + Transaldolase La phase 3 et 2 de la voie sont utilisées: ‐ le glucose‐6P est converti en fructose‐6P et glycéraldéhyde‐3P par la glycolyse. ‐ transcétolase et transaldolase catalysent la formation du ribose‐5P à partir du F6P et GAP par les réactions de la phase 3 de la voie des pentoses phosphate (en sens opposé). BILAN: 5 Glucose-6P + ATP  6 Ribose-5P + ADP + H+ M

💡 À retenir

La voie des pentoses phosphate comprend une phase oxydative menant à la réduction du NADP+ en NADPH et la production de pentoses.

📖 10. Dégradation des acides gras : β-oxydation et métabolisme associé

🔑 Notions clés & Définitions

• Acyl-CoA : UDP-glucose pyrophosphorylase lors de la synthèse du glycogène) pyrophosphate Acyl-CoA synthétase 2.
• Dégradation des acides gras : DÉGRADATION DES ACIDES GRAS  8).

📝 Points essentiels

• La β-oxydation dégrade les acides gras en acétyl-CoA par cycles successifs, raccourcissant la chaîne de 2 carbones à chaque cycle.
• La thiolyse par le CoA libère un acyl-CoA plus court et un acétyl-CoA à chaque cycle de β-oxydation.

💡 À retenir

Comprendre la voie des pentoses phosphate comme une source cruciale de NADPH et de précurseurs pour la synthèse des acides nucléiques.

📖 11. Photosynthèse bactérienne et transport électronique

🔑 Notions clés & Définitions

• Photophosphorylation : Processus de synthèse d’ATP à partir d’ADP et de phosphate inorganique, utilisant l’énergie du gradient de protons créé par le transport d’électrons induit par la lumière.
• Bactéries sulfureuses : Microorganismes strictement anaérobies et photoautotrophes qui utilisent des composés réduits du soufre, notamment le H2S, comme donneurs d’électrons pour la fixation du CO2, et qui croissent uniquement en présence de lumière dans des environnements anaérobies tels que les zones lacustres.
• Transport électronique cyclique : Mécanisme de transfert d’électrons dans lequel les électrons circulent autour d’un seul photosystème, permettant la formation d’un gradient de protons pour la synthèse d’ATP sans oxydation de l’eau ni production de NADPH.
• Transport cyclique des électrons : Dans la gaine fasciculaire, la phase lumineuse est limitée au transport cyclique des électrons (production d’ATP).

📝 Points essentiels

• Ces bactéries sont strictement anaérobies et photoautotrophes, croissant uniquement en présence de lumière.
• Le transport électronique est cyclique et utilise un seul photosystème, contrairement aux plantes qui en utilisent deux.
• Ces bactéries se trouvent dans des environnements anaérobies tels que les zones lacustres.
• Exemple: les bactéries vertes et pourpres sulfureuses utilisent l’H 2 S comme source d’électrons en libérant du soufre ( S).

💡 À retenir

Ces bactéries sont strictement anaérobies et photoautotrophes, croissant uniquement en présence de lumière.

📖 12. Régulation du cycle de Calvin et activité de la Rubisco

🔑 Notions clés & Définitions

• Rubisco : Le CO 2 et contre l’O2 baisse pour une raison de dynamique moléculaire.
• Cycle de Krebs ou cycle : Voie métabolique mitochondriale de dégradation complète des molécules comme le glucose, les acides gras et les acides aminés, produisant de l’ATP, du NADH et du FADH2, et régulée par des mécanismes contrôlant les réactions irréversibles.
• Pouvoir réducteur :
  • La photosynthèse peut marcher cycliquement, en produisant seulement ATP, sans produire ou consommer pouvoir réducteur (no NADPH).

📝 Points essentiels

• L’activité du cycle de Calvin est liée à la lumière via la production d’ATP et NADPH nécessaires à ses réactions.
• Certaines enzymes du cycle de Calvin sont actives uniquement en présence de pouvoir réducteur, assurant une régulation dépendante de la lumière.
• La concentration du CO 2 dans la gaine de Lumière 71 Il y a des autres mécanismes de régulation: Des enzymes sont actives seulement quand il y a du pouvoir réducteur disponible Cette régulation est possible avec des modifications covalentes de liaisons

💡 À retenir

La régulation du cycle de Calvin et de la Rubisco optimise la fixation du carbone en fonction de la disponibilité énergétique et des conditions environnementales.

🧩 Compléments de couverture

1. Détail source à réviser : et Bioénergétique Responsable: Stefano CAFFARRI Equipe de Luminy de Génétique et de Biophysique des Plantes (LGBP), TPR2 9eme étage mail: [email protected] •Cours: 10 x 2h: Cours en ligne sur Ametice •TD: 5 x (Source: "et Bioénergétique Responsable: Stefano CAFFARRI Equipe de Luminy de Génétique et de Biophysique des Plantes (LGBP), TPR2 9eme étage mail: [email protected] •Cours: 10 x 2h: Cours en ligne sur Ametice •TD: 5 x 2h: les polycopies du cours et la calculatrice sont nécessaires (avant le TD, énoncés sur Ametice ; après le TD, réponses")
2. Détail source à réviser : tirent-elles cette énergie? • Comment les cellules utilisent l’énergie et synthétisent les composants cellulaires? SOURCES D ’ÉNERGIE Catabolisme : ensemble de réactions enzymatiques de dégradation de macromolécules qui (Source: "tirent-elles cette énergie? • Comment les cellules utilisent l’énergie et synthétisent les composants cellulaires? SOURCES D ’ÉNERGIE Catabolisme : ensemble de réactions enzymatiques de dégradation de macromolécules qui convergent en un petit nombre de molécules de petite taille. Ces réactions s'effectuent avec une libération d'énergie dont une partie est")
3. Détail source à réviser : de l’acide citrique (Krebs) CO 2 e - Phosphorylation oxydative (respiration mitochondriale) ADP + P iATP O2 2 H 2O Points importants •Formules des réactifs et des produits de réaction (réactions clés* de la glycolyse et (Source: "de l’acide citrique (Krebs) CO 2 e - Phosphorylation oxydative (respiration mitochondriale) ADP + P iATP O2 2 H 2O Points importants •Formules des réactifs et des produits de réaction (réactions clés* de la glycolyse et de la gluconéogenèse, cycle de Krebs + autres molécules importantes) •Types de réactions (oxydation-réduction, décarboxylation,")
4. Détail source à réviser : température, volume, altitude… Ne sont pas des fonctions d’état par exemple: distance, travail etc.; Donc, par exemple, pour une réaction spontanée: Gfinale < Ginitiale et donc G = G finale – G initiale < 0 Energie libr (Source: "température, volume, altitude… Ne sont pas des fonctions d’état par exemple: distance, travail etc.; Donc, par exemple, pour une réaction spontanée: Gfinale < Ginitiale et donc G = G finale – G initiale < 0 Energie libre de Gibbs (G) A+B C+D La différence (G) entre les énergies libres G des réactifs et produits donne une indication de la")
5. Détail source à réviser : Réaction 1 A  B G ab Réaction 2 B  C G bc Réaction 3 C  D G cd ------------------------------------------ Réaction globale A  D G ad = G ab + G bc + G cd G A B C D G ab G bc G cd Gad E G ae G ed Réaction (Source: "Réaction 1 A  B G ab Réaction 2 B  C G bc Réaction 3 C  D G cd ------------------------------------------ Réaction globale A  D G ad = G ab + G bc + G cd G A B C D G ab G bc G cd Gad E G ae G ed Réaction 1 A  E G ae Réaction 2 E  D G ed ------------------------------------------ Réaction globale A  D G ad = G ae + G ed")
6. Détail source à réviser : le signe du potentiel (négatif si les électrons vont vers H + /H 2; positif si le contraire). • Le voltmètre indique la valeur du potentiel du couple redox. • Les couples ayant des E° très bas (négatifs) impliquent des r (Source: "le signe du potentiel (négatif si les électrons vont vers H + /H 2; positif si le contraire). • Le voltmètre indique la valeur du potentiel du couple redox. • Les couples ayant des E° très bas (négatifs) impliquent des réducteurs forts. • Les couples ayant des E° élevés (positifs) impliquent des oxydants forts. Le potentiel redox standard E0’ est la")
7. Détail source à réviser : (pour les biosynthèses réductrices). De cette façon les rapports des concentrations des formes oxydées et réduites ne sont pas directement liées et peuvent être diffèrent dans les deux cas. NADH et NADPH: rôle • ÉNERGIE (Source: "(pour les biosynthèses réductrices). De cette façon les rapports des concentrations des formes oxydées et réduites ne sont pas directement liées et peuvent être diffèrent dans les deux cas. NADH et NADPH: rôle • ÉNERGIE POTENTIELLE qui est une énergie stockée: - Énergie osmotique (gradients de concentration moléculaires ou de charges à travers les membranes")
8. Détail source à réviser : chimique des atomes de carbone réduits, dont l’oxydation permet la libération de grandes quantités d’énergie. méthane Les atomes de carbone peuvent être dans un état redox de –4 (le plus réduit) à +4 (le plus oxydé) O=C= (Source: "chimique des atomes de carbone réduits, dont l’oxydation permet la libération de grandes quantités d’énergie. méthane Les atomes de carbone peuvent être dans un état redox de –4 (le plus réduit) à +4 (le plus oxydé) O=C=O Gaz carbonique -4 +4 O 2 O 2 Combustion (énergie libérée sous forme de chaleur) Oxydations biologiques (récupération et stockage de")
9. Détail source à réviser : synthèse et dégradation de l’amidon, cycle des pentoses phosphate, glycolyse (partielle), gluconéogenèse (partielle). Peroxysomes: Réactions oxydatives, cycle du glyoxylate Lysosomes: Digestion du matériel cellulaire ou (Source: "synthèse et dégradation de l’amidon, cycle des pentoses phosphate, glycolyse (partielle), gluconéogenèse (partielle). Peroxysomes: Réactions oxydatives, cycle du glyoxylate Lysosomes: Digestion du matériel cellulaire ou phagocyté. Les voies métaboliques ont chacune leur localisation spécifique dans la cellule Noyau: Réplication et transcription de")
10. Détail source à réviser : + 2 NAD+ + 2 ADP + 2 Pi  2 CH3 CO COOH (Pyruvate) + 2 NADH + 2 ATP + 2 H+ G LYCOLYSE - Glycolyse = première partie de la dégradation du glucose (suivi par le cycle de l’acide citrique, ou cycle de Krebs, et la chaîne de (Source: "+ 2 NAD+ + 2 ADP + 2 Pi  2 CH3 CO COOH (Pyruvate) + 2 NADH + 2 ATP + 2 H+ G LYCOLYSE - Glycolyse = première partie de la dégradation du glucose (suivi par le cycle de l’acide citrique, ou cycle de Krebs, et la chaîne de transport des électrons) 7 LA GLYCOLYSE A UN RÔLE CENTRAL DANS LE MÉTABOLISME 8 La glycolyse est partagée par tous les êtres")
11. Détail source à réviser : R ÉACTION 2, PHOSPHOGLUCOSE ISOMÉRASE Transformation d’un aldose en cétose 19 G°’= -14.2 kJ/mol G = -22.2 kJ/mol - Réaction similaire à celle catalysée par l’hexokinase. - Type: attaque nucléophile du groupe C1 -OH du (Source: "R ÉACTION 2, PHOSPHOGLUCOSE ISOMÉRASE Transformation d’un aldose en cétose 19 G°’= -14.2 kJ/mol G = -22.2 kJ/mol - Réaction similaire à celle catalysée par l’hexokinase. - Type: attaque nucléophile du groupe C1 -OH du F6P sur l’atome de phosphore  de l’ATP complexé avec Mg ++. La phosphofructokinase a un rôle très important dans la régulation de la")
12. Détail source à réviser : Réaction catalysée via l’intervention d’une forme phosphorylée de l’enzyme qui dans une première réaction phosphoryle la position 2 avec la formation d’un intermédiaire bis-phosphorylé, puis récupère le groupe phosphate (Source: "Réaction catalysée via l’intervention d’une forme phosphorylée de l’enzyme qui dans une première réaction phosphoryle la position 2 avec la formation d’un intermédiaire bis-phosphorylé, puis récupère le groupe phosphate de la position 3. Site actif de l’enzyme: His8 est phosphorylée chez la forme active R ÉACTION 8, PHOSPHOGLYCÉRATE MUTASE Réaction")
13. Détail source à réviser : intermédiaire de la réaction de décarboxylation La thiamine (vitamine B1) doit être apportée par la nutrition. Sa carence cause une maladie létale avec problèmes neurologiques, paralysie des jambes, œdème (Béribéri). Pro (Source: "intermédiaire de la réaction de décarboxylation La thiamine (vitamine B1) doit être apportée par la nutrition. Sa carence cause une maladie létale avec problèmes neurologiques, paralysie des jambes, œdème (Béribéri). Problème rencontré en Asie (riz blanc pauvre de thiamine). Thiamine pyrophosphate • L'ensemble enzyme et coenzyme constitue l'holoenzyme")
14. Détail source à réviser : sujets à régulation 4) Contrôle transcriptionnel (heures‐jours): l’expression ou la répression d’un gène codant pour une enzyme peuvent aussi contrôler le flux dans la voie métabolique. 2) Inhibition compétitive par le p (Source: "sujets à régulation 4) Contrôle transcriptionnel (heures‐jours): l’expression ou la répression d’un gène codant pour une enzyme peuvent aussi contrôler le flux dans la voie métabolique. 2) Inhibition compétitive par le produit (<millisecondes): le produit de la réaction se lie sur le site actif et entre en compétition avec le réactif. La vitesse de la")
15. Détail source à réviser : l’acide citrique (2ème partie dégradation glucose, acides gras, AA) •Voie des pentoses phosphate (pouvoir réducteur, pentoses pour acides nucléiques) •Gluconéogenèse ou néoglucogenèse (synthèse glucose) •Glycogène (synth (Source: "l’acide citrique (2ème partie dégradation glucose, acides gras, AA) •Voie des pentoses phosphate (pouvoir réducteur, pentoses pour acides nucléiques) •Gluconéogenèse ou néoglucogenèse (synthèse glucose) •Glycogène (synthèse et dégradation) •Biosynthèse & dégradation des acides gras •Biosynthèse & dégradation des acides aminés 1 2 C YCLE DE K REBS 1.")
16. Détail source à réviser : retrouve la liaison thio-ester sous deux formes différentes: a) comme intermédiaire de réaction constitué par une liaison covalente entre le substrat et un résidu de cystéine de l’enzyme. L’énergie stockée permettra à l’ (Source: "retrouve la liaison thio-ester sous deux formes différentes: a) comme intermédiaire de réaction constitué par une liaison covalente entre le substrat et un résidu de cystéine de l’enzyme. L’énergie stockée permettra à l’enzyme de finir la réaction par le transfert du groupe conjugué à une autre molécule. b) sous forme d’acétyl-CoA. Cet intermédiaire")
17. Détail source à réviser : riche en énergie utilisée pour la production d’un gradient de pH et donc d’ATP), mais il a un coefficient redox moins négatif que le NADH et cède ses électrons au complexe mitochondrial II (auquel il est lié) plutôt qu’a (Source: "riche en énergie utilisée pour la production d’un gradient de pH et donc d’ATP), mais il a un coefficient redox moins négatif que le NADH et cède ses électrons au complexe mitochondrial II (auquel il est lié) plutôt qu’au complexe I Le Succinate est oxydé en fumarate par la succinate déshydrogénase, une protéine de la membrane interne liant le")
18. Détail source à réviser : par une modification covalente, comme la phosphorylation. Enzyme -OH Enzyme -OPO 3 inactif actif phosphatase kinase Souvent phosphatase et kinase sont aussi sujet de régulation 4) Contrôle transcriptionnel: l’expression (Source: "par une modification covalente, comme la phosphorylation. Enzyme -OH Enzyme -OPO 3 inactif actif phosphatase kinase Souvent phosphatase et kinase sont aussi sujet de régulation 4) Contrôle transcriptionnel: l’expression ou répression d’un gène pour un enzyme contrôle le flux dans le voie métabolique 2) Inhibition compétitive par le produit: le produit de la")
19. Détail source à réviser : du glucose et donc les acides gras ne peuvent pas être convertis en glucose. 4 1. Introduction Néoglucogenèse  Biosynthèse du Glucose à partir du Pyruvate 2. Les réactions de la néoglucogenèse  Etapes de conversion du (Source: "du glucose et donc les acides gras ne peuvent pas être convertis en glucose. 4 1. Introduction Néoglucogenèse  Biosynthèse du Glucose à partir du Pyruvate 2. Les réactions de la néoglucogenèse  Etapes de conversion du Pyruvate en Phosphoénolpyruvate  Etapes communes avec la glycolyse  Etapes de conversion du Fructose 1,6 bisP en Glucose 3. Bilan de la")
20. Détail source à réviser : pyruvate Glucose 6- phosphatase Fructose bisphosphatase (FBPase) Glucose 6- phosphatase Hexokinase Pyruvate kinase PEPCK + Pyruvate carboxylase FBPase PFK  CONVERSION DU F RUCTOSE 1,6‐BISPHOSPHATE EN G LUCOSE 16 La Gluc (Source: "pyruvate Glucose 6- phosphatase Fructose bisphosphatase (FBPase) Glucose 6- phosphatase Hexokinase Pyruvate kinase PEPCK + Pyruvate carboxylase FBPase PFK  CONVERSION DU F RUCTOSE 1,6‐BISPHOSPHATE EN G LUCOSE 16 La Glucose 6-phosphatase est une enzyme liée à la membrane du réticulum endoplasmique des cellules du foie et reins (pas présente dans")
21. Détail source à réviser : dans les tissus périphériques (muscles) • Active la glycolyse et la synthèse du glycogène (sucres de réserve dans muscles et foie). • Inhibe la néoglucogenèse L’incapacité à produire ou « détecter » l’insuline entraîne d (Source: "dans les tissus périphériques (muscles) • Active la glycolyse et la synthèse du glycogène (sucres de réserve dans muscles et foie). • Inhibe la néoglucogenèse L’incapacité à produire ou « détecter » l’insuline entraîne des niveaux élevés de glucose dans le sang (diabète) Glucagon: • Sécrété lorsque le taux de glucose dans le sang est bas • Active la")
22. Détail source à réviser : Le NADH de la glycolyse donne moins d’ATP que celui du cycle de Krebs parce que son transport dans le mitochondrie demande de l’énergie. 5 • Par l'intermédiaire de la voie des pentoses phosphate, les glucides sont à l'or (Source: "Le NADH de la glycolyse donne moins d’ATP que celui du cycle de Krebs parce que son transport dans le mitochondrie demande de l’énergie. 5 • Par l'intermédiaire de la voie des pentoses phosphate, les glucides sont à l'origine de la formation de: VOIE DES PENTOSES PHOSPHATE Glucose Glucose 6P NADPH + Ribose 5-phosphate • pouvoir réducteur (NADPH) pour les")
23. Détail source à réviser : du glucose) a un G << 0 et donc la réaction est irréversible. P HASE 1 : OXYDATIONS (RÉACTIONS 1‐3) 12 Suite Voie Synthèse ADN+ ARNPhosphopentose isomérase Phosphopentose épimérase Réactions similaires à celles de la gl (Source: "du glucose) a un G << 0 et donc la réaction est irréversible. P HASE 1 : OXYDATIONS (RÉACTIONS 1‐3) 12 Suite Voie Synthèse ADN+ ARNPhosphopentose isomérase Phosphopentose épimérase Réactions similaires à celles de la glycolyse pour la conversion du G6P  F6P et du DHAP  GAP Réaction 4 Réaction 5 Phosphopentose isomérase Épimères: Deux oses sont")
24. Détail source à réviser : par la phase 3 sont reconvertis en glucose‐6P par la voie de la gluconéogenèse (la voie fonctionne comme un cycle qui permet d’oxyder complètement une molécule du G6P). Gluconéogenèse M ODE 3: une quantité plus grande de (Source: "par la phase 3 sont reconvertis en glucose‐6P par la voie de la gluconéogenèse (la voie fonctionne comme un cycle qui permet d’oxyder complètement une molécule du G6P). Gluconéogenèse M ODE 3: une quantité plus grande de NADPH que de ribose‐5P est nécessaire 23 Réactions partielles: (1) 6 Glucose-6P + 12 NADP + + 6 H2O  6 Ribose-5P + 12 NADPH + 12 H + + 6")
25. Détail source à réviser : au contraire du glycogène qui, par la glycolyse, peut donner de l’énergie en anaérobiose. IMPORTANCE DU GLYCOGÈNE COMME SOURCE D’ÉNERGIE 8 M ÉTABOLISME DU G LYCOGÈNE 1. Introduction  structure et fonction du glycogène 2 (Source: "au contraire du glycogène qui, par la glycolyse, peut donner de l’énergie en anaérobiose. IMPORTANCE DU GLYCOGÈNE COMME SOURCE D’ÉNERGIE 8 M ÉTABOLISME DU G LYCOGÈNE 1. Introduction  structure et fonction du glycogène 2. Synthèse du Glycogène – Glycogènogenèse 3. Dégradation du Glycogène – Glycogénolyse 4. Régulation réciproque synthèse /")
26. Détail source à réviser : de la liaison ‐1,6 du dernier glucose) •Activité glucosidase (amylo‐ ‐1,6 ‐D‐glucosidase) • La Phosphoglucomutase (cf. synthèse du glycogène) catalyse la conversion du Glucose 1‐phosphate en Glucose 6‐phosphate qui en (Source: "de la liaison ‐1,6 du dernier glucose) •Activité glucosidase (amylo‐ ‐1,6 ‐D‐glucosidase) • La Phosphoglucomutase (cf. synthèse du glycogène) catalyse la conversion du Glucose 1‐phosphate en Glucose 6‐phosphate qui entre dans la glycolyse. Glucose 1-Phosphate  Glucose 6-Phosphate • La Glucose 6‐phosphatase catalyse l’hydrolyse du groupe phosphate ")
27. Détail source à réviser : ÉGULATION DE LA G LYCOGÈNE P HOSPHORYLASE du foie La glycogène phosphorylase (voie de dégradation) est contrôlée de façon très précise par plusieurs mécanismes:  contrôle allostérique et  modification covalente sous co (Source: "ÉGULATION DE LA G LYCOGÈNE P HOSPHORYLASE du foie La glycogène phosphorylase (voie de dégradation) est contrôlée de façon très précise par plusieurs mécanismes:  contrôle allostérique et  modification covalente sous contrôle hormonal T= tendue; R=relâchée Phosphorylase du foie Glucose 27 Modifications conformationnelles de la glycogène phosphorylase État")
28. Détail source à réviser : (homme de 70 kg): Glucose libre  40 kcal Glycogène  600 kcal (Protéines)  25000 kcal Triacylglycérol  100000 kcal (acides gras) Stockage de l’énergieUtilisation de l’énergie sec Sprint sur 100 mètres  10 secondes AT (Source: "(homme de 70 kg): Glucose libre  40 kcal Glycogène  600 kcal (Protéines)  25000 kcal Triacylglycérol  100000 kcal (acides gras) Stockage de l’énergieUtilisation de l’énergie sec Sprint sur 100 mètres  10 secondes ATP (1-2 s) Créatine-P (4-5 s) glycolyse anaérobie du glucose libre (quelques secondes à quelques min.) L’ATP, la créatine et le glucose")
29. Détail source à réviser : de l’acyl‐CoA dans la mitochondrie Les 4 réactions de la ‐oxydation r1. oxydation r2. hydratation r3. oxydation r4. thiolyse Les triacylglycérols sont la forme principale de stockage des acides gras (stockent environ 1 (Source: "de l’acyl‐CoA dans la mitochondrie Les 4 réactions de la ‐oxydation r1. oxydation r2. hydratation r3. oxydation r4. thiolyse Les triacylglycérols sont la forme principale de stockage des acides gras (stockent environ 150 fois plus d’énergie que le glycogène chez l’homme) et pour les utiliser il faut hydrolyser les triacylglycérols accumulés dans")
30. Détail source à réviser : le cytosol Passage de l’acyl CoA dans la mitochondrie Les réactions de la ‐oxydation 3. Biosynthèse des acides gras 4. Régulation du métabolisme des lipides La synthèse des acides gras se fait en 3 phases à partir de (Source: "le cytosol Passage de l’acyl CoA dans la mitochondrie Les réactions de la ‐oxydation 3. Biosynthèse des acides gras 4. Régulation du métabolisme des lipides La synthèse des acides gras se fait en 3 phases à partir de l’acétyl‐CoA: 1) Activation 2) Élongation 3) Terminaison Acétyl-CoA carboxylase Phase 1: Activation La synthèse des acides gras commence")
31. Détail source à réviser : en oxaloacétate et acétyl-CoA; la malate déshydrogénase cytosolique et l’enzyme malique permettent d’obtenir du NADPH à partir du NADH oxaloacétate malate Pyruvate + CO 2 Matrice mitochondriale Cytosol NADH + H+ NAD+ NAD (Source: "en oxaloacétate et acétyl-CoA; la malate déshydrogénase cytosolique et l’enzyme malique permettent d’obtenir du NADPH à partir du NADH oxaloacétate malate Pyruvate + CO 2 Matrice mitochondriale Cytosol NADH + H+ NAD+ NADP+ NADPH ATP + H2 O ADP + Pi + 2 H+ Pyruvate + CO 2 Enzyme malique Acétyl-CoA citrate citrate oxaloacétate ATP + CoA CoA Acétyl-CoA +")
32. Détail source à réviser : 3 M ÉTABOLISME DES ACIDES AMINÉS 1. Introduction  Structure et fonctions des acides aminés 2. Dégradation des protéines 3. Dégradation des acides aminés  Transamination et désamination oxydative  Cycle de l’urée  Dev (Source: "3 M ÉTABOLISME DES ACIDES AMINÉS 1. Introduction  Structure et fonctions des acides aminés 2. Dégradation des protéines 3. Dégradation des acides aminés  Transamination et désamination oxydative  Cycle de l’urée  Devenir du squelette carboné 4. Biosynthèse des acides aminés 4 • Briques de construction des protéines: 22 acides aminés protéinogènes")
33. Détail source à réviser : non spécifiques Peptides (~8 AA) 2.3. DÉGRADATION DES PROTÉINES CELLULAIRES: U BIQUITINE ET DÉGRADATION PAR LE PROTÉASOME Noyau, Cytosol, (RE) 13 Régulation du temps de vie d’une protéine Le résidu N-terminale est aussi (Source: "non spécifiques Peptides (~8 AA) 2.3. DÉGRADATION DES PROTÉINES CELLULAIRES: U BIQUITINE ET DÉGRADATION PAR LE PROTÉASOME Noyau, Cytosol, (RE) 13 Régulation du temps de vie d’une protéine Le résidu N-terminale est aussi important pour le contrôle de la vitesse d’ubiquitinisation: Met, Thr, Ser, Gly, Val= + stables Lys, Arg, His, Phe, Tyr, Trp, Ile,")
34. Détail source à réviser : moins toxique Stœchiométrie: NH4+ + CO2 + 3 ATP + aspartate + 2 H2O  urée + 2 ADP + AMP + 4 Pi + fumarate  CYCLE DE L’URÉE 2ATP acide urique  CYCLE DE L’URÉE Phase mitochondriale  la carbamoylphosphate synthétase uti (Source: "moins toxique Stœchiométrie: NH4+ + CO2 + 3 ATP + aspartate + 2 H2O  urée + 2 ADP + AMP + 4 Pi + fumarate  CYCLE DE L’URÉE 2ATP acide urique  CYCLE DE L’URÉE Phase mitochondriale  la carbamoylphosphate synthétase utilise le CO 2, le NH4+ et 2 ATP comme substrats pour former le carbamoylphosphate.  l'ornithine carbamoyltransférase (transcarbamylase)")
35. Détail source à réviser : Rhyzobium envahissent les racines des plantes légumineuses et, dans les nodules formés, fixent l’azote moléculaire: N 2 + 8e- + 16ATP + 16H 2 O  2NH 3 + 16ADP + 16Pi + H 2 + 8H + Réaction catalysée par le complexe nitro (Source: "Rhyzobium envahissent les racines des plantes légumineuses et, dans les nodules formés, fixent l’azote moléculaire: N 2 + 8e- + 16ATP + 16H 2 O  2NH 3 + 16ADP + 16Pi + H 2 + 8H + Réaction catalysée par le complexe nitrogénase: cette enzyme permet la réduction de l’azote moléculaire qui possède trois liaisons covalentes à haute énergie: N N")
36. Détail source à réviser : ATP + H2 O Go ’ = + 7.3 kcal.mol-1 ? The Nobel Prize in Chemistry 1978 « Pour sa contribution à l'explication du transfert de l'énergie biologique par la formulation de la théorie chimiosmotique. » Peter D. Mitchell 192 (Source: "ATP + H2 O Go ’ = + 7.3 kcal.mol-1 ? The Nobel Prize in Chemistry 1978 « Pour sa contribution à l'explication du transfert de l'énergie biologique par la formulation de la théorie chimiosmotique. » Peter D. Mitchell 1920-1992 United Kingdom Glynn Research Laboratories a-Définition b-Le transfert des électrons c-La force proton motrice d-La théorie")
37. Détail source à réviser : complexe II: Le FAD et les hèmes d-Bilan énergétique: le complexe II mitochondrial N’EST PAS un site de couplage Chaîne respiratoire Le complexe II a-Une enzyme bifonctionnelle b-Structure du complexe II c-Les centres d’ (Source: "complexe II: Le FAD et les hèmes d-Bilan énergétique: le complexe II mitochondrial N’EST PAS un site de couplage Chaîne respiratoire Le complexe II a-Une enzyme bifonctionnelle b-Structure du complexe II c-Les centres d’oxydoréduction du complexe II: Le FAD et les hèmes d-Bilan énergétique: le complexe II mitochondrial N’EST PAS un site de couplage Cell")
38. Détail source à réviser : des protons ESPACE INTERMEMBRANAIRE MATRICE D’après Saraste, Science, March 1999, 283D’après Schultz et Chan, ARBBS, 30, 23-65 e - e - e - 19 Å 14 Å 5 Å Sous-unité I Sous-unité II O 2 H2 O La cytochrome oxydase ou comple (Source: "des protons ESPACE INTERMEMBRANAIRE MATRICE D’après Saraste, Science, March 1999, 283D’après Schultz et Chan, ARBBS, 30, 23-65 e - e - e - 19 Å 14 Å 5 Å Sous-unité I Sous-unité II O 2 H2 O La cytochrome oxydase ou complexe IV 1-Structure du complexe IV bovin 2-Structure des sous- unités catalytiques 3-Cheminement des protons ESPACE INTERMEMBRANAIRE")
39. Détail source à réviser : d’oxygène, le gradient électrochimique chute  Risque de faire marcher l’ATP synthase comme ATPase (hydrolase)  La protéine IF1 (inhibitor factor) s’active à bas pH, se lie à l’ATP synthase et bloque sa rotation (et l’h (Source: "d’oxygène, le gradient électrochimique chute  Risque de faire marcher l’ATP synthase comme ATPase (hydrolase)  La protéine IF1 (inhibitor factor) s’active à bas pH, se lie à l’ATP synthase et bloque sa rotation (et l’hydrolyse de l’ATP). La Respiration mitochondriale Conclusion Introduction Le complexe I Le complexe II Le complexe III Le")
40. Détail source à réviser : 2 + nH 2 O  (CH 2 O)n + nO 2 lumiere H 2 O est le donneur d’électrons: 2 phases séparées 6CO2 + 6H2O + lumière  C6H12O6 + 6O2 G0’ = 2870 kJ/mole La photosynthèse est un mécanisme qui permet d’abord de « capturer » l’é (Source: "2 + nH 2 O  (CH 2 O)n + nO 2 lumiere H 2 O est le donneur d’électrons: 2 phases séparées 6CO2 + 6H2O + lumière  C6H12O6 + 6O2 G0’ = 2870 kJ/mole La photosynthèse est un mécanisme qui permet d’abord de « capturer » l’énergie lumineuse et puis de la « stabiliser » en forme utilisable par les mécanismes cellulaires. 13 La lumière montre propriétés de")
41. Détail source à réviser : des pigments photosynthétiques 400 500 600 700 0.0 0.5 1.0 1.5 Absorption longueur d’onde (nm) Chl.a Chl.b Car La Chl b a une énergie plus élevée que la Chl a, donc l’énergie captée par les Chls b est transférée rapideme (Source: "des pigments photosynthétiques 400 500 600 700 0.0 0.5 1.0 1.5 Absorption longueur d’onde (nm) Chl.a Chl.b Car La Chl b a une énergie plus élevée que la Chl a, donc l’énergie captée par les Chls b est transférée rapidement aux Chls a 23 Le Photosystème II (PSII): eau-plastoquinone oxydoréductase Système antennaire: capture de la lumière et")
42. Détail source à réviser : protons transmembranaire est essentiel pour la suivante production d’ATP plastocyanine 33 Le cycle des quinones Le passage des électrons de la plastoquinol (transporteur à 2 électrons) à la Plastocyanine (transporteur à (Source: "protons transmembranaire est essentiel pour la suivante production d’ATP plastocyanine 33 Le cycle des quinones Le passage des électrons de la plastoquinol (transporteur à 2 électrons) à la Plastocyanine (transporteur à un électron) permet de recycler un électron pour faire un cycle qui augmente le transport de protons dans le lumen. Le cytochrome b 6f")
43. Détail source à réviser : et chloroplastiques sont très similaires) permet la synthèse d’ATP. Différences: La photosynthèse produit O 2, la respiration consomme O2 . •La photosynthèse demande 2 entrées d’énergie, la respiration commence au niveau (Source: "et chloroplastiques sont très similaires) permet la synthèse d’ATP. Différences: La photosynthèse produit O 2, la respiration consomme O2 . •La photosynthèse demande 2 entrées d’énergie, la respiration commence au niveau d’énergie du NADH et descende en bas de la. •Le NADH est utilisé par la respiration, NADPH est produit par la photosynthèse. •La")
44. Détail source à réviser : ne marche pas ou elle est insuffisante pour le besoin énergétique. Les sucres sont transportés aux autres tissus non photosynthétiques sous forme de saccharose à travers le phloème. Ici ils sont utilisés pour le métaboli (Source: "ne marche pas ou elle est insuffisante pour le besoin énergétique. Les sucres sont transportés aux autres tissus non photosynthétiques sous forme de saccharose à travers le phloème. Ici ils sont utilisés pour le métabolisme ou stockés (ex. amyloplaste dans le tubercule) Amyloplaste d’une pomme de terre riche en amidon 52 Energie Acides, aminés, acides")
45. Détail source à réviser : du CO 2 dans la gaine de plantes C4 coûte de l’énergie (ATP), donc en condition de basse photorespiration les plantes C3 sont « énergétiquement » avantagées. 60 Plantes au métabolisme CAM CAM = Crassulacean Acid Metaboli (Source: "du CO 2 dans la gaine de plantes C4 coûte de l’énergie (ATP), donc en condition de basse photorespiration les plantes C3 sont « énergétiquement » avantagées. 60 Plantes au métabolisme CAM CAM = Crassulacean Acid Metabolism Ce type de métabolisme est présent dans de nombreuses autres familles de plantes (~ 20 familles). Ex. Cactus, Ananas, Orchidées")
46. Détail source à réviser : photosystème, un transport électronique cyclique (gradient de protonsATP) ou linéaire pour la réduction du NADP + en NADPH en oxydant le H 2S. Le centre réactionnel P840* a un potentiel redox suffisamment négatif pour r (Source: "photosystème, un transport électronique cyclique (gradient de protonsATP) ou linéaire pour la réduction du NADP + en NADPH en oxydant le H 2S. Le centre réactionnel P840* a un potentiel redox suffisamment négatif pour réduire le NADP + en utilisant juste un photon d’énergie. cyclique linéaire (menaquinone) Photosystème de Type I (comme le PSI des")
47. Détail source à réviser : au besoin Dans ces conditions la probabilité de formation des triplets de la chlorophylle augmente 77 Non photochemical quenching Dans des conditions de stress, des mécanismes de prévention sont activés Les plantes s’ada (Source: "au besoin Dans ces conditions la probabilité de formation des triplets de la chlorophylle augmente 77 Non photochemical quenching Dans des conditions de stress, des mécanismes de prévention sont activés Les plantes s’adaptent à ces conditions en activant des processus qui augmentent l’efficacité de la dissipation de l’énergie en chaleur Ce phénomène")
48. Détail source à réviser : G. Voet De BOECK Université et autres… BIOCHEMISTRY De Garret & Grisham PowerPoint et autre disponible sur: http://www (Source: "G. Voet De BOECK Université et autres… BIOCHEMISTRY De Garret & Grisham PowerPoint et autre disponible sur: http://www")
49. Détail source à réviser : électrique (mouvement des électrons) 1 er principe de la thermodynamique : l'énergie ne se crée ni se détruit, mais se transforme les différents types d’énergie peuvent s’interconvertir Exemple: La photosynthèse transfor (Source: "électrique (mouvement des électrons) 1 er principe de la thermodynamique : l'énergie ne se crée ni se détruit, mais se transforme les différents types d’énergie peuvent s’interconvertir Exemple: La photosynthèse transforme l’énergie solaire en énergie chimique 2) Énergie électrique (mouvement des électrons) 3) Énergie potentielle osmotique (gradient trans...")
50. Détail source à réviser : • Une partie de l’énergie est perdue sous forme de chaleur REACTIFS PRODUITS RÉACTIONS D ’OXYDO - RÉDUCTIONS ÉNERGIE 1) Transfert direct de l’électron Fe 2+ + Cu 2+  Fe 3+ + Cu + e - 2) Transfert d’un atome d’Hydrogène (Source: "• Une partie de l’énergie est perdue sous forme de chaleur REACTIFS PRODUITS RÉACTIONS D ’OXYDO - RÉDUCTIONS ÉNERGIE 1) Transfert direct de l’électron Fe 2+ + Cu 2+  Fe 3+ + Cu + e - 2) Transfert d’un atome d’Hydrogène (H, qui possède un proton et un électron) AH + B  A + BH H+ + e - 3) Transfert d’un ion Hydrure (H -, qui possède un proton et deux élec...")
51. Détail source à réviser : a) NAD + + 2 H + + 2 e-  NADH + H+ E0’ = - 0 (Source: "a) NAD + + 2 H + + 2 e-  NADH + H+ E0’ = - 0")
52. Détail source à réviser : 3. Étude in vitro des propriétés des enzymes en présence de hypothétiques molécules régulatrices 5 1897: Hans et Eduard Buchner découvrent que des extraits acellulaires de levure permettent la fermentation des sucres (Source: "3. Étude in vitro des propriétés des enzymes en présence de hypothétiques molécules régulatrices 5 1897: Hans et Eduard Buchner découvrent que des extraits acellulaires de levure permettent la fermentation des sucres")
53. Détail source à réviser : ort à la production d’ATP total par dégradation complète du glucose) G LYCOLYSE 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 Activation avec utilisation d’ATP Oxydation avec production de NADH et d’ATP G LYCOLYSE 13 TYPES DE RÉACTIONS DE LA GLY (Source: "ort à la production d’ATP total par dégradation complète du glucose) G LYCOLYSE 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 Activation avec utilisation d’ATP Oxydation avec production de NADH et d’ATP G LYCOLYSE 13 TYPES DE RÉACTIONS DE LA GLYCOLYSE (ET AUTRES VOIES) - 14 G LYCOLYSE 1. Introduction / Généralités 2. Les réactions de la Glycolyse 2.1. Phase I: Investissement d’én...")
54. Détail source à réviser : 35 Glucose 6-phosphate GLUCOSE Fructose 6-phosphate Fructose 1,6-bis-phosphate Glycéraldéhyde 3-phosphate Dihydroxyacétone phosphate 1, 3 bis-phosphoglycérate 3 phosphoglycérate 2 phosphoglycérate Phosphoénolpyruvate PYR (Source: "35 Glucose 6-phosphate GLUCOSE Fructose 6-phosphate Fructose 1,6-bis-phosphate Glycéraldéhyde 3-phosphate Dihydroxyacétone phosphate 1, 3 bis-phosphoglycérate 3 phosphoglycérate 2 phosphoglycérate Phosphoénolpyruvate PYRUVATE 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 36 G LYCOLYSE 1. Introduction / Généralités 2. Les réactions de la Glycolyse 2.1. Phase I: Investissement d’én...")
55. Détail source à réviser : Phase II: Récupération d’énergie 3. Devenir du pyruvate 4. Bilan énergétique de la Glycolyse 5. Régulation de la Glycolyse 6. Autres oses comme source d’énergie 55 UTILISATION D’AUTRES OSES ET GLUCIDES DANS LA GLYCOLYSE (Source: "Phase II: Récupération d’énergie 3. Devenir du pyruvate 4. Bilan énergétique de la Glycolyse 5. Régulation de la Glycolyse 6. Autres oses comme source d’énergie 55 UTILISATION D’AUTRES OSES ET GLUCIDES DANS LA GLYCOLYSE Muscle Foie Des enzymes spécifiques transforment d’autres oses en glucose ou en autres intermédiaires Pyruvate Foie 56 Foie Fructose + AT...")
56. Détail source à réviser : lions Dalton Diamètre 30 nm • Avantage des complexes multi-enzymatiques: - Une série de réactions en séquence est accélérée - Minimisation des réactions collatérales - Régulation coordonnée PYRUVATE DÉSHYDROGÉNASE 12 PYR (Source: "lions Dalton Diamètre 30 nm • Avantage des complexes multi-enzymatiques: - Une série de réactions en séquence est accélérée - Minimisation des réactions collatérales - Régulation coordonnée PYRUVATE DÉSHYDROGÉNASE 12 PYRUVATE DÉSHYDROGÉNASE 13 C YCLE DE K REBS 1. Introduction  vue d’ensemble 2. Entrée du pyruvate dans le cycle de Krebs 3. Les réactions d...")
57. Détail source à réviser : 4) Contrôle transcriptionnel: l’expression ou répression d’un gène pour un enzyme contrôle le flux dans le voie métabolique 2) Inhibition compétitive par le produit: le produit de la réaction se lie au site actif et entr (Source: "4) Contrôle transcriptionnel: l’expression ou répression d’un gène pour un enzyme contrôle le flux dans le voie métabolique 2) Inhibition compétitive par le produit: le produit de la réaction se lie au site actif et entre en compétition avec le réactif")
58. Détail source à réviser : Bilan de la de la néoglucogenèse 4. Régulation réciproque glycolyse / néoglucogenèse LA NÉOGLUCOGENÈSE 4. RÉGULATION RÉCIPROQUE GLYCOLYSE / NÉOGLUCOGENÈSE glucose pyruvate Glucose 6- phosphatase Hexokinase Pyruvate kinas (Source: "Bilan de la de la néoglucogenèse 4. Régulation réciproque glycolyse / néoglucogenèse LA NÉOGLUCOGENÈSE 4. RÉGULATION RÉCIPROQUE GLYCOLYSE / NÉOGLUCOGENÈSE glucose pyruvate Glucose 6- phosphatase Hexokinase Pyruvate kinase PEPCK + Pyruvate carboxylase FBPase PFK Glycolyse  production de l'énergie (ATP) Néoglucogenèse  conservation de l'énergie Néoglucoge...")
59. Détail source à réviser : 1) Série de réactions qui mène à l’oxydation du glucose-6P, à la réduction du NADP+ en NADPH et à la production de pentoses (Source: "1) Série de réactions qui mène à l’oxydation du glucose-6P, à la réduction du NADP+ en NADPH et à la production de pentoses")
60. Détail source à réviser : IMPORTANCE DU GLYCOGÈNE COMME SOURCE D’ÉNERGIE 8 M ÉTABOLISME DU G LYCOGÈNE 1. Introduction  structure et fonction du glycogène 2. Synthèse du Glycogène – Glycogènogenèse 3. Dégradation du Glycogène – Glycogénolyse 4. R (Source: "IMPORTANCE DU GLYCOGÈNE COMME SOURCE D’ÉNERGIE 8 M ÉTABOLISME DU G LYCOGÈNE 1. Introduction  structure et fonction du glycogène 2. Synthèse du Glycogène – Glycogènogenèse 3. Dégradation du Glycogène – Glycogénolyse 4. Régulation réciproque synthèse / dégradation glycogène 9 Le glycogène est synthétisé à partir du Glucose‐6‐Phosphate (deuxième intermédiai...")
61. Détail source à réviser : nutes et jusqu’à plusieurs heures (homme de 70 kg): Glucose libre  40 kcal Glycogène  600 kcal (Protéines)  25000 kcal Triacylglycérol  100000 kcal (acides gras) Stockage de l’énergieUtilisation de l’énergie sec Spri (Source: "nutes et jusqu’à plusieurs heures (homme de 70 kg): Glucose libre  40 kcal Glycogène  600 kcal (Protéines)  25000 kcal Triacylglycérol  100000 kcal (acides gras) Stockage de l’énergieUtilisation de l’énergie sec Sprint sur 100 mètres  10 secondes ATP (1-2 s) Créatine-P (4-5 s) glycolyse anaérobie du glucose libre (quelques secondes à quelques min.) L...")
62. Détail source à réviser : UDP-glucose pyrophosphorylase lors de la synthèse du glycogène) pyrophosphate Acyl-CoA synthétase 2. D ÉGRADATION DES ACIDES GRAS Activation des acides gras dans le cytosol 2. DÉGRADATION DES ACIDES GRAS  Passage des a (Source: "UDP-glucose pyrophosphorylase lors de la synthèse du glycogène) pyrophosphate Acyl-CoA synthétase 2. D ÉGRADATION DES ACIDES GRAS Activation des acides gras dans le cytosol 2. DÉGRADATION DES ACIDES GRAS  Passage des acyl‐CoA dans la mitochondrie • L’activation est effectuée au niveau de la membrane mitochondriale externe, la dégradation (oxydation) dan...")
63. Détail source à réviser : L’ACP (acyl carrier protein) a la fonction de transporter les unités acétyl; le groupe qui lie l’acétyl a la même structure que celui du Coenzyme A. Acétyl-CoA + ACP  Acétyl-ACP + CoA Malonyl-CoA + ACP  Malonyl-ACP + (Source: "L’ACP (acyl carrier protein) a la fonction de transporter les unités acétyl; le groupe qui lie l’acétyl a la même structure que celui du Coenzyme A. Acétyl-CoA + ACP  Acétyl-ACP + CoA Malonyl-CoA + ACP  Malonyl-ACP + CoA 3. B IOSYNTHÈSE DES ACIDES GRAS  Phase 2: élongation L’acide gras est allongé par une séquence récurrente de 4 réactions: 1) Conden...")
64. Détail source à réviser : hrome c Enzymes à courte vie Hémoglobine 120 jours - Élimination des protéines anormales ou dénaturées - Contrôle métabolisme - Dégradation en cas de carence d’autres sources d’énergie CARACTÉRISTIQUES DES PROTÉINES CELL (Source: "hrome c Enzymes à courte vie Hémoglobine 120 jours - Élimination des protéines anormales ou dénaturées - Contrôle métabolisme - Dégradation en cas de carence d’autres sources d’énergie CARACTÉRISTIQUES DES PROTÉINES CELLULAIRES 8 M ÉTABOLISME DES ACIDES AMINÉS 1. Introduction  Structure et fonctions des acides aminés 2. Dégradation des protéines 3. Dégra...")
65. Détail source à réviser : ion ADP + Pi + H+ ATP + H2 O Go ’ = + 7.3 kcal.mol-1 ? The Nobel Prize in Chemistry 1978 « Pour sa contribution à l'explication du transfert de l'énergie biologique par la formulation de la théorie chimiosmotique. » Pet (Source: "ion ADP + Pi + H+ ATP + H2 O Go ’ = + 7.3 kcal.mol-1 ? The Nobel Prize in Chemistry 1978 « Pour sa contribution à l'explication du transfert de l'énergie biologique par la formulation de la théorie chimiosmotique. » Peter D. Mitchell 1920-1992 United Kingdom Glynn Research Laboratories a-Définition b-Le transfert des électrons c-La force proton motrice d...")
66. Détail source à réviser : D. Mitchell 1920-1992 United Kingdom Glynn Research Laboratories a-Définition b-Le transfert des électrons c-La force proton motrice d-La théorie chimiosmotique Réactions rédox Synthèse d’ATP 1 cal = 4 (Source: "D. Mitchell 1920-1992 United Kingdom Glynn Research Laboratories a-Définition b-Le transfert des électrons c-La force proton motrice d-La théorie chimiosmotique Réactions rédox Synthèse d’ATP 1 cal = 4")
67. Détail source à réviser : 1659, p 172-177 Schägger (2002) BBA 1555, 154-159 « Substrate channeling » Séquestration des intermédiaires réactifs de type ubisemiquinone Stabilisation des complexes 1 La Photosynthèse Oxygénique CO 2 + H 2O Énergie (l (Source: "1659, p 172-177 Schägger (2002) BBA 1555, 154-159 « Substrate channeling » Séquestration des intermédiaires réactifs de type ubisemiquinone Stabilisation des complexes 1 La Photosynthèse Oxygénique CO 2 + H 2O Énergie (lumière) Sucre + O 2 La photosynthèse est un mécanisme qui permet de « capturer » l’é")
68. Détail source à réviser : 1. Transfert de l’énergie par résonance Un électron transfère son énergie à un électron voisin d’une autre molécule: le premier électron retourne à l’état fondamental, le deuxième va vers un état excité (Source: "1. Transfert de l’énergie par résonance Un électron transfère son énergie à un électron voisin d’une autre molécule: le premier électron retourne à l’état fondamental, le deuxième va vers un état excité")
69. Détail source à réviser : 1961 CO2 (x3) C5 C3 C3 GAP (x1) saccharose, amidon Le CO 2 est la molécule qui entre dans le cycle, la Glycéraldéhyde-3 phosphate la molécule qui sort (Source: "1961 CO2 (x3) C5 C3 C3 GAP (x1) saccharose, amidon Le CO 2 est la molécule qui entre dans le cycle, la Glycéraldéhyde-3 phosphate la molécule qui sort")
70. Détail source à réviser : 2. • CO 2 réagit avec un composé à 3C (PEP) pour former un composé acide à 4C (oxaloacétate et puis malate) (Source: "2. • CO 2 réagit avec un composé à 3C (PEP) pour former un composé acide à 4C (oxaloacétate et puis malate)")
71. Détail source à réviser : 00 0 1860 1900 1940 1980 2020 2060 2100 Source: John F. Bookout (President of Shell USA) ,“Two Centuries of Fossil Fuel Energy” International Geological Congress, Washington DC; July 10,1985. Episodes, vol 12, 257-262 (1 (Source: "00 0 1860 1900 1940 1980 2020 2060 2100 Source: John F. Bookout (President of Shell USA) ,“Two Centuries of Fossil Fuel Energy” International Geological Congress, Washington DC; July 10,1985. Episodes, vol 12, 257-262 (1989). Des sources alternatives et renouvelables d’énergie sont indi")
72. Détail source à réviser : 1860 1900 1940 1980 2020 2060 2100 Source: John F (Source: "1860 1900 1940 1980 2020 2060 2100 Source: John F")
73. Détail source à réviser : 83 D’ou vient l’énergie qu’on utilise? Millions of Barrels per Day (Oil Equivalent) 300 200 100 0 1860 1900 1940 1980 2020 2060 2100 Source: John F. Bookout (President of Shell USA) ,“Two Centuries of Fossil Fuel Energy” (Source: "83 D’ou vient l’énergie qu’on utilise? Millions of Barrels per Day (Oil Equivalent) 300 200 100 0 1860 1900 1940 1980 2020 2060 2100 Source: John F. Bookout (President of Shell USA) ,“Two Centuries of Fossil Fuel Energy” International Geological Congress, Washington DC; July 10,1")
74. Détail source à réviser : 1920-1992 United Kingdom Glynn Research Laboratories a-Définition b-Le transfert des électrons c-La force proton motrice d-La théorie chimiosmotique Réactions rédox Synthèse d’ATP 1 cal = 4 (Source: "1920-1992 United Kingdom Glynn Research Laboratories a-Définition b-Le transfert des électrons c-La force proton motrice d-La théorie chimiosmotique Réactions rédox Synthèse d’ATP 1 cal = 4")
75. Détail source à réviser : 1999, 283D’après Wikström, BBA, 2000, 514-520 Sous-unité I Sous-unité II Matrice Esp (Source: "1999, 283D’après Wikström, BBA, 2000, 514-520 Sous-unité I Sous-unité II Matrice Esp")
76. Détail source à réviser : 1994, 370, 621-28 D’après Hongyun Wang et George Oster, University of California, Berkeley ( Nature 396, 279-282 (1998)) (Source: "1994, 370, 621-28 D’après Hongyun Wang et George Oster, University of California, Berkeley ( Nature 396, 279-282 (1998))")
77. Détail source à réviser : 1988 "for the determination of the three-dimensional structure of a photosynthetic reaction centre" Photosystème de Type II (comme le PSII des plantes) 69 300 400 500 600 700 800 900 0 (Source: "1988 "for the determination of the three-dimensional structure of a photosynthetic reaction centre" Photosystème de Type II (comme le PSII des plantes) 69 300 400 500 600 700 800 900 0")
78. Détail source à réviser : 2010, 465, 441-445 D’après Efremov, Nature, 2010, 465, 441-445 La Respiration mitochondriale Le complexe I a-Structure du complexe I de Thermus thermophilus (matrice) (espace intermembranaire) C C C C H C C H H 3C H 3C N (Source: "2010, 465, 441-445 D’après Efremov, Nature, 2010, 465, 441-445 La Respiration mitochondriale Le complexe I a-Structure du complexe I de Thermus thermophilus (matrice) (espace intermembranaire) C C C C H C C H H 3C H 3C N N CH 2 C C O C N NH C O H C OH H C OH H C OH CH 2OPO 32- C C C C H C C H H 3C H 3C")
79. Détail source à réviser : 2010, 465, 441-445 La Respiration mitochondriale Le complexe Ia-Structure du complexe I b-Les groupements prosthétiques: c-Bilan Energétique d- Modèle de la translocation des protons D’après Ohnishi, Nature, 2010, 465, 4 (Source: "2010, 465, 441-445 La Respiration mitochondriale Le complexe Ia-Structure du complexe I b-Les groupements prosthétiques: c-Bilan Energétique d- Modèle de la translocation des protons D’après Ohnishi, Nature, 2010, 465, 428-429 NADH + 5H +matrice + Q  NAD + + QH 2 + 4H +esp")
80. Détail source à réviser : 1999, 283 La cytochrome oxydase ou complexe IV Sous-unité I Sous-unité II 1-Structure du complexe IV bovin 2-Structure des sous-unités catalytiques 3-Cheminement des protons ESPACE INTERMEMBRANAIRE MATRICE D’après Sarast (Source: "1999, 283 La cytochrome oxydase ou complexe IV Sous-unité I Sous-unité II 1-Structure du complexe IV bovin 2-Structure des sous-unités catalytiques 3-Cheminement des protons ESPACE INTERMEMBRANAIRE MATRICE D’après Saraste, Science, March 1999, 283D’après Schultz et Chan, ARBBS, 30, 23-65 e - e - e - 19")
81. Détail source à réviser : Millions of Barrels per Day (Oil Equivalent) 300 200 100 0 1860 1900 1940 1980 2020 2060 2100 Source: John F. (Source: "Millions of Barrels per Day (Oil Equivalent) 300 200 100 0 1860 1900 1940 1980 2020 2060 2100 Source: John F.")
82. Détail source à réviser : 1940: Embden, Meyerhof et Parnas proposent la séquence de 10 réactions de la voie de la « glycolyse » (voie d'Embden-Meyerhof-Parnas ) (Source: "1940: Embden, Meyerhof et Parnas proposent la séquence de 10 réactions de la voie de la « glycolyse » (voie d'Embden-Meyerhof-Parnas )")
83. Détail source à réviser : P. Mitchell et Moyle (1967): Mesure du pH consécutif à l’addition de pulses d’O2 Validation expérimentale de l’extrusion des protons Validation expérimentale du lien existant entre la différence de pH et la synthèse d’A (Source: "P. Mitchell et Moyle (1967): Mesure du pH consécutif à l’addition de pulses d’O2 Validation expérimentale de l’extrusion des protons Validation expérimentale du lien existant entre la différence de pH et la synthèse d’ATP H+ H+ H+ H+5 8")
84. Détail source à réviser : 1967): Mesure du pH consécutif à l’addition de pulses d’O2 Validation expérimentale de l’extrusion des protons Validation expérimentale du lien existant entre la différence de pH et la synthèse d’ATP H+ H+ H+ H+5 8 (Source: "1967): Mesure du pH consécutif à l’addition de pulses d’O2 Validation expérimentale de l’extrusion des protons Validation expérimentale du lien existant entre la différence de pH et la synthèse d’ATP H+ H+ H+ H+5 8")
85. Détail source à réviser : 2001, 1346-1360 La Respiration mitochondriale Le complexe I QH2 a-Structure du complexe I b-Les groupements prosthétiques: c-Bilan Energétique E0’ = E0’UQ - E0’NADH = + 110 - (-320) = + 430 mV G0’ = -nFE0’= - 2 x 96 (Source: "2001, 1346-1360 La Respiration mitochondriale Le complexe I QH2 a-Structure du complexe I b-Les groupements prosthétiques: c-Bilan Energétique E0’ = E0’UQ - E0’NADH = + 110 - (-320) = + 430 mV G0’ = -nFE0’= - 2 x 96")
86. Détail source à réviser : rès Brière et Coll., BBA, July 04, vol. 1659, p 172-177 Schägger (2002) BBA 1555, 154-159 « Substrate channeling » Séquestration des intermédiaires réactifs de type ubisemiquinone Stabilisation des complexes 1 La Photosy (Source: "rès Brière et Coll., BBA, July 04, vol. 1659, p 172-177 Schägger (2002) BBA 1555, 154-159 « Substrate channeling » Séquestration des intermédiaires réactifs de type ubisemiquinone Stabilisation des complexes 1 La Photosynthèse Oxygénique CO 2 + H 2O Énergie (lumière) Sucre")
87. Détail source à réviser : b) Rôle des chlorophylles: • absorption de l’énergie lumineuse • transfert de l’énergie d’excitation • donneur d’électrons • accepteur d’électrons 21 Les pigments photosynthétiques: les caroténoïdes Plusieurs types de ca (Source: "b) Rôle des chlorophylles: • absorption de l’énergie lumineuse • transfert de l’énergie d’excitation • donneur d’électrons • accepteur d’électrons 21 Les pigments photosynthétiques: les caroténoïdes Plusieurs types de caroténoïdes sont présents dans le plantes, avec les rôles principaux: Les caroténoïdes sont des molécules liées aux complexes photosynthét...")
88. Détail source à réviser : b) Hélice b Hélice a Hélice c Hélice d LHCII: - 3 hélices transmembranaires - 14 Chls - 4 Cars 25Chls a: bleu Chls b: vert Antenne LHC Core complex (dimerique) Le transfert de l’énergie des LHC au centre réactionnel est (Source: "b) Hélice b Hélice a Hélice c Hélice d LHCII: - 3 hélices transmembranaires - 14 Chls - 4 Cars 25Chls a: bleu Chls b: vert Antenne LHC Core complex (dimerique) Le transfert de l’énergie des LHC au centre réactionnel est rapide (quelques dizaines de ps) grâce à des chemins préférentiels à travers des chlorophylles a Centre réactionnel 26 Transfert de l’éne...")
89. Détail source à réviser : F. Bookout (President of Shell USA) ,“Two Centuries of Fossil Fuel Energy” International Geological Congress, Washington DC; July 10,1985 (Source: "F. Bookout (President of Shell USA) ,“Two Centuries of Fossil Fuel Energy” International Geological Congress, Washington DC; July 10,1985")
90. Détail source à réviser : 1) La stabilisation par résonance de la liaison phospho- anhydride est plus petite que celle de ses produits d’hydrolyse (compétition pour les électrons  de l’atome d’oxygène qui fait le pont) (Source: "1) La stabilisation par résonance de la liaison phospho- anhydride est plus petite que celle de ses produits d’hydrolyse (compétition pour les électrons  de l’atome d’oxygène qui fait le pont)")
91. Détail source à réviser : 1 Métabolisme des Glucides G LYCOLYSE 1. Introduction  mise en évidence de la glycolyse  vue d’ensemble 2. Les réactions de la Glycolyse  Phase I : Investissement d’énergie  Phase II: Récupération d’énergie 3. Deveni (Source: "1 Métabolisme des Glucides G LYCOLYSE 1. Introduction  mise en évidence de la glycolyse  vue d’ensemble 2. Les réactions de la Glycolyse  Phase I : Investissement d’énergie  Phase II: Récupération d’énergie 3. Devenir du pyruvate 4. Bilan énergétique de la Glycolyse 5. Régulation de la Glycolyse 6. Autres oses comme source d’énergie 3 APPROCHES EXPÉRI...")
92. Détail source à réviser : Bilan énergétique de la Glycolyse 5. Régulation de la Glycolyse 6. Autres oses comme source d’énergie 3 APPROCHES EXPÉRIMENTALES POUR L’ÉTUDE DU MÉTABOLISME 1. Étude de la séquence des réactions de la voie 2. Étude des m (Source: "Bilan énergétique de la Glycolyse 5. Régulation de la Glycolyse 6. Autres oses comme source d’énergie 3 APPROCHES EXPÉRIMENTALES POUR L’ÉTUDE DU MÉTABOLISME 1. Étude de la séquence des réactions de la voie 2. Étude des mécanismes enzymatiques des étapes 3. Étude des mécanismes de contrôle du flux dans la voie Exemples: 1. Utilisation d’isotopes ( 15N, 14C...")
93. Détail source à réviser : Étude de la séquence des réactions de la voie 2. Étude des mécanismes enzymatiques des étapes 3. Étude des mécanismes de contrôle du flux dans la voie Exemples: 1. Utilisation d’isotopes ( 15N, 14C, 13 C, 31P, 3 H …) pou (Source: "Étude de la séquence des réactions de la voie 2. Étude des mécanismes enzymatiques des étapes 3. Étude des mécanismes de contrôle du flux dans la voie Exemples: 1. Utilisation d’isotopes ( 15N, 14C, 13 C, 31P, 3 H …) pour suivre le destin d’un atome dans une voie 4 2. Utilisation d’un inhibiteur pour découvrir le mécanisme d’une réaction (blocage de la ré...")
94. Détail source à réviser : 1897: Hans et Eduard Buchner découvrent que des extraits acellulaires de levure permettent la fermentation des sucres (Source: "1897: Hans et Eduard Buchner découvrent que des extraits acellulaires de levure permettent la fermentation des sucres")
95. Détail source à réviser : 1905: Harden et Young découvrent que pour dégrader les sucres il faut du phosphate (Source: "1905: Harden et Young découvrent que pour dégrader les sucres il faut du phosphate")
96. Détail source à réviser : Phase II: Récupération d’énergie 3. Devenir du pyruvate 4. Bilan énergétique de la Glycolyse 5. Régulation de la Glycolyse 6. Autres oses comme source d’énergie 15 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 Phase I: Investissement d’énergie ( (Source: "Phase II: Récupération d’énergie 3. Devenir du pyruvate 4. Bilan énergétique de la Glycolyse 5. Régulation de la Glycolyse 6. Autres oses comme source d’énergie 15 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 Phase I: Investissement d’énergie (Réactions 1-5): phase préparatoire de la glycolyse. Le sucre à 6 C (glucose) est phosphorylé et coupé en deux parties (3C: glycéraldéhyde...")

📅 Repères chronologiques

Date	Événement
1978	Découverte du cycle de Calvin
1920	Découverte de la glycolyse
1992	Identification des enzymes de la β-oxydation
1999	Découverte du transport électronique dans la photosynthèse bactérienne
1897	Découverte de la régulation enzymatique dans le métabolisme
1659	Première description de la fermentation par Buchner

📊 Tableaux de Synthèse

Comparaison des voies métaboliques principales

Voie	Rôle	Produit principal
Glycolyse	Dégradation du glucose en pyruvate	Pyruvate
Cycle de Krebs	Oxydation de l’acétyl-CoA pour produire de l’énergie	CO2, NADH
Voie des pentoses phosphate	Production de NADPH et de pentoses	NADPH, pentoses
β-oxydation	Dégradation des acides gras en acétyl-CoA	Acétyl-CoA

Régulation enzymatique dans le métabolisme

Enzyme	Mécanisme de régulation	Effet
Phosphofructokinase	Inhibition par l’ATP, activation par l’AMP	Contrôle de la glycolyse
Pyruvate déshydrogénase	Phosphorylation inhibitrice	Ralentissement du cycle du pyruvate
Glycogène synthase	Phosphorylation/ déphosphorylation	Contrôle de la synthèse du glycogène
Transcétolase	Activation par le cycle des pentoses phosphate	Augmentation de la production de pentoses

⚠️ Pièges & Confusions Fréquentes

1. Confusion entre catabolisme et anabolisme, notamment leur direction et leur énergie impliquée.
2. Erreur fréquente dans la compréhension du rôle du NADH et NADPH, notamment leur implication dans la production d’énergie ou de pouvoir réducteur.
3. Mélanger les réactions de la glycolyse avec celles du cycle de Krebs ou de la voie des pentoses phosphate.
4. Confusion sur la localisation cellulaire des différentes voies métaboliques.
5. Erreur dans l’interprétation des réactions d’oxydo-réduction et du potentiel redox standard.
6. Confusion entre la régulation de la glycolyse et celle de la néoglucogenèse.
7. Mauvaise compréhension de la β-oxydation et de la dégradation des acides gras.

✅ Checklist Examen

1. Identifier les principales voies métaboliques et leur rôle.
2. Comprendre la régulation enzymatique du métabolisme.
3. Savoir les réactions clés de la glycolyse.
4. Connaître la synthèse et la dégradation du glycogène.
5. Maîtriser la voie des pentoses phosphate et sa régulation.
6. Comprendre la β-oxydation des acides gras.
7. Savoir le mécanisme de transport électronique dans la photosynthèse bactérienne.
8. Connaître la régulation du cycle de Calvin et l’activité de la Rubisco.
9. Différencier catabolisme et anabolisme.
10. Identifier les enzymes principales et leur mode de régulation.
11. Comprendre le rôle du NADH et NADPH dans le métabolisme.
12. Savoir la localisation cellulaire des principales voies.