Un ARNt initiateur portant une N-formyl méthionine
Spiegazione
Chez les procaryotes, l’ARNt initiateur porte une N-formyl méthionine et participe à l’initiation au site P. Il ne s’agit pas d’un ARNt aminoacylé par n’importe quel acide aminé.
Le ribosome peut ignorer un AUG peu favorable et démarrer plus loin
Spiegazione
Le leaky scanning permet au ribosome de dépasser un AUG dans un contexte défavorable et d’initier la traduction sur un site plus distal. Cela constitue une modulation de l’initiation eucaryote.
La séparation du polypeptide du peptidyl-ARNt
Spiegazione
La terminaison aboutit à la libération de la chaîne polypeptidique du peptidyl-ARNt, sous l’action des facteurs de libération. Elle ne correspond pas à l’entrée d’un nouvel ARNt.
La chaîne peptidique passe du site P au site A
Spiegazione
La liaison peptidique transfère la chaîne portée au site P vers l’ARNt situé au site A. C’est une étape de catalyse du centre peptidyl-transférase.
Le ribosome démarre à partir de l’extrémité 5’ coiffée
Spiegazione
En initiation coiffe-dépendante, la traduction démarre à partir de l’extrémité 5’ portant la coiffe, qui guide la reconnaissance du premier site d’initiation accessible. Le démarrage ne se fait pas sur un codon stop ni à l’extrémité 3’.
Le centre peptidyl-transférase
Spiegazione
La liaison peptidique est formée par le centre peptidyl-transférase, porté par l’ARN ribosomique 23S. Le centre de décodage, lui, contrôle l’appariement codon-anticodon.
EF-G
Spiegazione
EF-G pilote la translocation et provoque le déplacement du ribosome d’un codon, soit trois nucléotides. EF-Tu intervient avant, dans la sélection de l’ARNt chargé.
Parce qu’elle mime un ARNt et provoque l’arrêt de l’élongation
Spiegazione
La puromycine est un exemple de mimétisme moléculaire : elle ressemble à un ARNt, entre dans le site A et entraîne l’arrêt de la synthèse en se liant à la chaîne peptidique. Elle n’agit pas sur l’ADN ni sur la coiffe.
La troisième position
Spiegazione
La tolérance wobble concerne surtout la troisième position du codon, tandis que les deux premières doivent rester correctement appariées. C’est ce qui permet la reconnaissance de codons synonymes.
EF-Tu
Spiegazione
EF-Tu, lié au GTP, vérifie l’appariement codon-anticodon avant de positionner l’ARNt au site A. EF-G intervient plus tard dans la translocation.
Pour permettre une traduction plus rapide
Spiegazione
Les gènes fortement exprimés tendent à éviter les codons rares afin d’assurer une traduction rapide et efficace. Les codons rares ralentissent au contraire l’élongation.
Les codons stop
Spiegazione
Les facteurs de libération reconnaissent les codons stop et déclenchent la libération du polypeptide. Il n’existe pas d’ARNt correspondant aux codons stop.
L’ajout de la séquence CCA en 3’
Spiegazione
Les ARNt acquièrent un bras accepteur se terminant par la séquence CCA, qui sert de site de fixation à l’acide aminé. La coiffe 5’ et la queue polyA concernent les ARNm.
Fixer l’acide aminé sur l’ARNt
Spiegazione
Le bras accepteur se termine par CCA, qui constitue le site d’attachement chimique de l’acide aminé. Il ne reconnaît pas les codons stop et ne participe pas à l’épissage.
Trois cadres de lecture
Spiegazione
Sur un brin donné, il existe trois cadres de lecture possibles : +1, +2 et +3. Les trois autres cadres correspondent à l’autre brin.
Le site A
Spiegazione
Le site A accueille l’ARNt porteur du nouvel acide aminé. Le site P contient l’ARNt portant la chaîne peptidique et le site E libère l’ARNt déchargé.
À positionner l’ARNm pour l’initiation de la traduction
Spiegazione
La séquence Shine-Dalgarno sert de repère d’alignement pour le ribosome et favorise l’initiation. Elle n’intervient pas dans la terminaison ni dans le chargement des ARNt.
Une reconnaissance de plusieurs codons synonymes par un même ARNt
Spiegazione
L’effet wobble autorise une tolérance au niveau de la troisième position du codon, ce qui permet à un même ARNt de reconnaître plusieurs codons synonymes. Il ne rend pas l’appariement strictement identique sur les trois bases.
Il se place au site P pour installer le premier acide aminé
Spiegazione
L’ARNt initiateur s’installe au site P dès l’initiation et porte le premier acide aminé. Les codons stop sont reconnus par des facteurs de libération, pas par cet ARNt.
L’ARNt du site A passe au site P et l’ARNm avance de trois nucléotides
Spiegazione
Lors de la translocation, l’ARNt du site A rejoint le site P, l’ARNt du site P rejoint le site E, et l’ARNm avance de trois nucléotides. Cela expose le codon suivant pour le cycle d’élongation.
Il ralentit la traduction quand l’ARNm contient des codons rares
Spiegazione
Quand un ARNm contient des codons rares, les ARNt correspondants sont moins abondants et la traduction ralentit. Le biais codonique n’empêche pas la transcription et ne transforme pas les codons.
Une suite de codons comprise entre deux codons stop
Spiegazione
Un ORF correspond à une suite de codons délimitée par deux codons stop. Il ne désigne pas une région non traduite ni une séquence de démarrage située après la fin de la traduction.
La petite ou la grande sous-unité ribosomique
Spiegazione
Certains antibiotiques ciblent la sous-unité 30S ou la sous-unité 50S du ribosome bactérien et bloquent différentes étapes de la traduction. Ils ne ciblent pas la coiffe 5’ eucaryote.
La boucle anticodon
Spiegazione
La boucle anticodon contient la séquence qui s’apparie au codon de l’ARNm. Le bras accepteur CCA sert, lui, à fixer l’acide aminé.
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ARNm polycistronique — définition ?
ARNm chez les procaryotes portant plusieurs séquences codantes.
ARNm monocistronique — rôle ?
ARNm chez les eucaryotes contenant une seule séquence codante.
Coiffe 5’ — fonction ?
Structure facilitant le transfert de l’ARNm dans le cytoplasme.
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