Typage bactérien en hygiène hospitalière

📋 Plan du Cours

1. Typage épidémiologique
2. Méthodes moléculaires
3. Marqueurs génétiques
4. Techniques de séquençage
5. Analyse de la transmission
6. Applications en hygiène
7. Objectifs du typage
8. Critères de performance

📖 1. Typage épidémiologique

🔑 Notions clés & Définitions

• Typage épidémiologique : Ensemble de méthodes permettant d’identifier et de différencier les souches bactériennes pour suivre leur transmission, leur évolution et leur prévalence dans une population, afin d’orienter les mesures de contrôle (voir objectifs en hygiène hospitalière et hors hygiène).
• Clone bactérien : Groupe de souches bactériennes issues d’une même origine, présentant des caractères phénotypiques et génotypiques très proches, définissant une unité épidémiologique en épidémiologie (d’après Davin-Régli et Bollet, 2000).
• Épidémie plasmidique : Phénomène où la diffusion de résistances ou de caractères virulents se fait principalement par transfert horizontal de plasmides entre différentes souches ou clones, plutôt que par propagation d’un clone unique (voir transmission plasmidique).
• Objectifs du typage en hygiène hospitalière : Déterminer l’existence et l’extension d’une épidémie, identifier les réservoirs, sources, modes de transmission, et suivre la prévalence de types bactériens pour planifier des mesures préventives (voir objectifs spécifiques).
• Surveillance épidémiologique locale et nationale : Recueil systématique…