Flashcards: Chimie combinatoire et optimisation des leads — 87 cards

Combien de temps dure en moyenne le développement d'un nouveau médicament ?

Il dure en moyenne 12 ans.

Quelle étape réglementaire est obligatoire pour commercialiser un médicament ?

L'autorisation de mise sur le marché (AMM).

Sur 10 000 molécules criblées, combien obtiennent un dépôt de brevet ?

Environ 10 molécules.

Combien de molécules deviennent finalement un médicament après tests cliniques ?

Une seule molécule.

Quelle part des coûts de recherche pharmaceutique correspond au développement ?

Environ les deux tiers des coûts.

Combien de nouveaux médicaments ont été autorisés aux États-Unis en 2023 ?

55 nouveaux médicaments.

Quelle était la moyenne annuelle d'autorisations de médicaments aux États-Unis cinq ans avant 2023 ?

49 médicaments par an en moyenne.

Quelle différence principale existe entre NMEs et BLAs ?

Les NMEs sont de petites molécules, les BLAs sont des protéines ou polysaccharides biotechnologiques.

Qu'est-ce qu'un hit en drug discovery ?

Une petite molécule de départ prometteuse identifiée pour optimisation.

Qu'est-ce qu'un lead en découverte de médicaments ?

Un hit optimisé pour ses propriétés biologiques, physiques et pharmaceutiques.

Quel est le but du processus itératif du drug discovery ?

Identifier puis optimiser une substance active.

Qu'entraîne l'optimisation du lead ?

La création d'un candidat clinique soumis à des tests précliniques in vivo.

Que permet l'approbation réglementaire par l'AMM ?

De transformer un candidat clinique en médicament.

Quelle est la progression historique de la chimie médicinale ?

Des préparations végétales brutes aux molécules conçues pour une pathologie.

Qu'est-ce que l'ethnopharmacologie ?

L'étude scientifique interdisciplinaire des matières naturelles et savoirs traditionnels thérapeutiques.

Que sont les alcaloïdes ?

Des molécules naturelles contenant surtout de l'azote avec une activité biologique marquée.

En quelle année la morphine pure a-t-elle été isolée par Sertürner ?

En 1806.

Qu'est-ce qu'un composé hémisynthétique ?

Une molécule dérivée d'un produit naturel modifiée chimiquement par synthèse.

Comment obtient-on l'acide acétylsalicylique (aspirine) ?

Par acétylation de l'acide salicylique avec de l'anhydride acétique.

Quand Bayer a-t-il commercialisé l'aspirine ?

En 1899.

Quelles sont les trois principales classes de cibles macromoléculaires des substances actives ?

Les enzymes, les récepteurs et les acides nucléiques.

Qu'est-ce que la sérendipité en pharmacologie ?

La capacité à faire par hasard des découvertes thérapeutiques heureuses.

Quelle nouvelle indication thérapeutique a été découverte pour le minoxidil ?

Le traitement de l’alopécie.

Pour quelle pathologie le sildénafil a-t-il été finalement utilisé ?

La dysfonction érectile.

Quelle molécule naturelle a servi de base à l’amphétamine et au méthylphénidate ?

L’éphédrine d’Ephedra sinica.

De quelle plante provient le paclitaxel anticancéreux ?

Taxus brevifolia.

Quelle caractéristique chimique possède la pénicilline G ?

Un squelette bêta-lactame d’origine microbienne.

Qu'est-ce qu'un ligand endogène ?

Une molécule physiologique qui se lie à une macromolécule pour initier une réponse biologique.

Comment un analogue d’un ligand endogène peut-il agir ?

Comme agoniste, antagoniste ou inhibiteur de la réponse naturelle.

Qu'est-ce qu'une bibliothèque chimique ?

Un ensemble de composés criblés pour trouver une activité biologique.

Quelle est la taille typique des bibliothèques synthétiques ?

De quelques centaines à plusieurs millions de composés.

Quelle proportion des composés d'une bibliothèque synthétique est active ?

La grande majorité est inactive lors du criblage.

Qu'est-ce qu'une bibliothèque du patrimoine ?

Un regroupement de composés synthétisés antérieurement pour tests ultérieurs.

Quel est l'exemple du topiramate dans une bibliothèque chimique ?

Un intermédiaire conservé puis identifié comme médicament antiépileptique.

Qu'est-ce qu'une bibliothèque combinatoire ?

Un ensemble de composés apparentés conçu pour accroître la diversité chimique.

Combien de composés médicamenteux théoriques existent avec C, H, N, O, F et stéréoisomères ?

Plus de 110 millions de composés potentiels.

Quel est le processus classique en chimie organique pour créer de nouvelles molécules ?

Réaction de A et B, purification, caractérisation, test, puis variation des blocs.

Quelles caractéristiques définissent les bibliothèques de composés ?

Elles sont caractérisées par leur diversité chimique.

Que contiennent les bibliothèques de composés en plus de la diversité chimique ?

Elles peuvent contenir des analogues de synthèse structurellement apparentés.

Quels atomes sont utilisés pour calculer le nombre théorique de composés médicamenteux ?

Le carbone, l’hydrogène, l’azote, l’oxygène et le fluor.

Quel est le nombre théorique de composés médicamenteux potentiels avec stéréoisomères ?

Il dépasse 110 millions.

Qu'est-ce que la chimie combinatoire ?

C’est une méthode pour synthétiser rapidement et simultanément de grandes quantités de composés différents.

Que génère la réaction simultanée de plusieurs blocs A et B qui ne réagissent pas entre eux ?

Toutes les combinaisons possibles sous forme d’une bibliothèque de molécules.

Combien de molécules obtient-on en combinant 10 blocs A avec 100 blocs B ?

On obtient 1000 molécules en une seule opération.

Comment se déroule la synthèse en phase solide dans la chimie combinatoire ?

Les fonctions chimiques sont liées à une résine, réagissent successivement, puis sont libérées par clivage.

Quand la chimie combinatoire a-t-elle été conçue pour synthétiser des peptides ?

Au milieu des années 1980.

Qu'est-ce que l'intelligence artificielle générative en conception de médicaments ?

Elle utilise de vastes données et modèles pour accélérer la génération et optimisation de composés.

Quelles qualités doit avoir un candidat médicament ?

Il doit être original, actif sur une cible, brevetable, sélectif et faiblement toxique.

Combien de temps dure le développement traditionnel d’un médicament ?

Il dépasse souvent 12 ans.

Quel est le coût moyen du développement traditionnel d’un médicament ?

Entre 1 et 3 milliards de dollars.

Que peut faire l’IA générative dans la recherche pharmaceutique ?

Elle peut extraire, analyser, prédire, générer, optimiser et identifier des composés et cibles.

Qu'est-ce que le criblage en pharmacologie?

Tester ou analyser une bibliothèque spécifique de petites molécules.

Sur quoi repose généralement le criblage haut débit?

Un test in vitro miniaturisé réalisé de manière robotisée sur microplaques.

Quelle méthode utilise le criblage haut débit pour mesurer rapidement les résultats?

Une méthode de détection du signal.

Comment est choisi l'échantillon en criblage haut débit?

Aléatoire ou ciblé selon les connaissances sur la cible biologique.

Que produit le clivage enzymatique dans un test d'intensité de fluorescence?

Un composé très fluorescent à partir d'un substrat non fluorescent.

Que signifie une fluorescence élevée dans ce test enzymatique?

Une enzyme active est présente.

Quelle est la plage de poids moléculaire des composés examinés en criblage haut débit?

Entre 300 et 600 g/mol.

Quelle est la principale limite du criblage haut débit?

Un taux potentiellement élevé de faux positifs.

Qu'est-ce qu'une molécule fragment ?

Une molécule organique de masse inférieure à 300 g/mol pouvant se lier spécifiquement à une protéine.

Comment le criblage par fragments réduit-il les faux positifs ?

Par la liaison spécifique à la protéine cible.

Quelle est la limite des fragments identifiés en criblage par fragments ?

Ils sont peu puissants et nécessitent une optimisation par synthèse.

Qu'est-ce que le criblage virtuel ?

L’analyse informatique et la prédiction de l’activité de composés réels ou virtuels.

Quel avantage principal offre le criblage virtuel ?

Analyser rapidement et à faible coût des millions de composés.

Pourquoi des tests biologiques restent-ils nécessaires après criblage virtuel ?

Pour confirmer l’activité des composés prédits.

Comment fonctionne le criblage virtuel basé sur la structure ?

Il utilise le docking pour ajuster et noter des composés dans le site de liaison d’une protéine.

Quels critères compare le criblage virtuel basé sur le ligand ?

La taille, polarité, donneur/acceptateur d’hydrogène et hydrophobicité des composés.

Qu'est-ce qu'un lead en optimisation structurale ?

Un lead est un composé efficace avec une CI50 inférieure à 1 μM, sélectif et disponible.

Comment mesure-t-on l'affinité d'un médicament pour une cible protéique ?

Par la constante de dissociation Kd.

Que signifie une constante de dissociation Kd faible ?

Le complexe médicament-protéine est fortement formé.

Quels types d'interactions lient généralement un médicament à sa cible ?

Des interactions faibles comme électrostatique, hydrophobe, van der Waals, π-π ou dipôle-dipôle.

Quel type d'interaction peut parfois lier un médicament à sa cible ?

Une interaction covalente.

Quelle est la différence d'activité entre eutomère et distomère ?

L’eutomère est l’énantiomère le plus actif, le distomère le moins actif.

Que décrit une relation structure-activité ?

Comment une modification de structure modifie l’activité biologique.

Qu'est-ce qu'un pharmacophore ?

L’ensemble des caractéristiques stériques et électroniques déterminant l’activité biologique.

Qu'est-ce que la lipophilie d'une molécule ?

L'affinité pour les liquides ou milieux apolaires.

Comment se calcule le coefficient de partage P ?

P = [SA]org / [SA]aq entre octanol et phase aqueuse.

Quel logP favorise l'absorption intestinale ?

Un logP entre 1 et 3.

Qu'est-ce que la solubilité d'un composé ?

La quantité de solide dissoute dans une solution aqueuse.

Quels sont les deux facteurs majeurs de la solubilité aqueuse ?

La polarité de la molécule et l'énergie du réseau cristallin.

Quelle limite de poids moléculaire impose la règle de Lipinski ?

Inférieur à 500 g/mol.

Quelle est la limite de poids moléculaire selon les règles des 3 pour les fragments ?

Inférieur à 300 g/mol.

Combien de liaisons rotatives recommande au plus la règle de Veber ?

Au plus 10 liaisons rotatives.

Qu'est-ce que la biotechnologie selon l'OCDE ?

L'application de principes scientifiques et d'ingénierie à la transformation de matériaux par des agents biologiques.

Quelle différence principale existe entre biotechnologies traditionnelles et contemporaines ?

Les traditionnelles n'utilisent pas d'ADN recombinant, les contemporaines utilisent des organismes génétiquement modifiés.

Que produisent les biotechnologies contemporaines ?

Des anticorps monoclonaux, des vaccins et des protéines recombinantes.

Quelle est la première protéine recombinante autorisée par la FDA en 1982 ?

L'insuline.