Flashcards: Principes structuraux des protéines — 18 cards

Alphabet protéique — définition ?

Les acides aminés qui composent les protéines.

Zwitterion — état ?

Acide aminé porteur simultanément charge positive et negative.

Chiralité des acides aminés — origine ?

Carbone asymétrique Cα, sauf glycine.

Forme L — importance ?

Majoritaire dans les protéines.

Chaîne latérale R — rôle ?

Détermine propriétés physicochimiques.

pKa — définition ?

pH d’équilibre entre formes protonée et déprotonée.

Résidus basiques — exemple ?

Lysine, Arginine, Histidine.

Résidus acides — exemple ?

Acide aspartique, glutamique.

Liaison peptidique — caractéristique ?

Partiellement double, planéité, rigidité.

Angles dièdres — noms ?

φ (phi), ψ (psi), ω (omega).

ω — valeur favorisée ?

180° (trans), 0° (cis) en moindre proportion.

Angles chi — rôle ?

Orientation des chaînes latérales.

Hélice alpha droite — φ, ψ ?

Environ −60°, −60°.

Répétition hélice α — résidus/tour ?

Environ 3,6 résidus.

Feuillet bêta — stabilisation ?

Liaisons hydrogène entre brins.

Feuillet antiparallèle — φ, ψ ?

−150°, 135°.

Diagramme de Ramachandran — but ?

Cartographier conformations stériquement possibles.

Repliement — principe ?

Minimisation de ΔG, paysage énergétique.