UPGMA — définition ?
Méthode hiérarchique de regroupement en phylogénie.
Distances génétiques — rôle ?
Quantifier la divergence entre séquences moléculaires.
Phylogénie moléculaire — principe ?
Comparer séquences pour reconstruire l’histoire évolutive.
Classification phylogénétique — objectif ?
Organiser selon relations de parenté réelles.
Groupe monophylétique — composition ?
Ancêtre commun + tous ses descendants.
Groupe paraphylétique — différence ?
Inclut un ancêtre mais pas tous ses descendants.
Homologie — définition ?
Caractère partagé par héritage d’un ancêtre commun.
Homoplasie — phénomène ?
Ressemblance indépendante, convergence évolutive.
Caractère dérivé — autre nom ?
Apomorphie.
Méthodes probabilistes — base ?
Modèles statistiques pour inférer phylogénies.
Biodiversité — composantes ?
Espèces, gènes, écosystèmes.
Arbre ultramétrique — caractéristique ?
Branches de même longueur, reflétant une horloge.
Alignement — but ?
Comparer séquences pour estimer différences.
Synapomorphie — rôle ?
Définir groupes monophylétiques.
Homologie — importance en phylogénie ?
Identifier relations de parenté réelles.
Distance génétique — formule ?
Nombre de substitutions / sites alignés.
Méthode de vraisemblance — principe ?
Maximiser la probabilité d’observer les données.
Biodiversité — niveaux ?
Espèces, gènes, habitats.
Groupe paraphylétique — exemple ?
Vertébrés sans certains descendants.
Caractère ancestral — autre nom ?
Symplésiomorphie.
Test your knowledge with 10 questions on Introduction à la phylogénie moléculaire.
1. En quoi la méthode UPGMA diffère-t-elle d'une méthode probabiliste en phylogénie moléculaire ?
2. En quelle année la méthode UPGMA a-t-elle été publiée par Sokal et Michener ?
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