Flashcards: Introduction à la protéomique — 24 cards

Protéomique — définition ?

Étude systématique des protéines d’un organisme ou tissu.

Objectif analyse protéomique

Inventorier, identifier, quantifier et localiser les protéines.

Étapes analyse protéomique

Extraction, séparation, digestion, identification, analyse.

Extraction protéines — but ?

Isoler les protéines dans un tampon adapté.

Séparation protéines — méthode ?

Chromatographie ou électrophorèse.

Outils chromatographie

Colonnes, phases stationnaires, HPLC, échange d’ions.

Electrophorèse gel — principe ?

Migration selon charge et taille dans un gel.

Spectrométrie masse — rôle ?

Déterminer masse et structure des peptides ou protéines.

Identification protéines — étape clé

Comparer spectres MS aux banques de données.

Ionisation MS — méthode ?

MALDI ou ESI pour produire des ions chargés.

Analyseurs MS — exemples

Quadripolaire, Orbitrap, FT-ICR.

MS/MS en tandem — but ?

Fragmenter les ions pour séquencer les peptides.

Protéome — définition ?

Ensemble des protéines exprimées dans un système.

Analyse protéomique — objectif principal

Étudier l’expression, modification, localisation des protéines.

Étapes clés en protéomique

Extraction, séparation, digestion, identification.

Extraction protéines — composant clé

Tampon avec détergents, agents réducteurs.

Séparation protéines — technique principale

SDS-PAGE, 2D-SDS-PAGE, chromatographie.

Outils chromatographie

Échange d’ions, affinité, HPLC.

Electrophorèse gel — support ?

Agarose ou polyacrylamide.

Spectrométrie masse — principe

Ionisation, séparation, détection selon m/z.

Identification protéines — méthode ?

Digestion, spectrométrie MS/MS, banques de données.

Ionisation MS — techniques principales

MALDI et ESI.

Analyseurs MS — rôle

Séparer ions selon m/z pour identification.

MS/MS — principe

Fragmentation contrôlée pour séquencer peptides.