1. Quelle est la définition de la biochimie ?
La science qui étudie les molécules et les réactions des organismes vivants
Spiegazione
La biochimie est la chimie biologique qui étudie les molécules et les réactions des organismes vivants.
La science qui étudie les molécules et les réactions des organismes vivants
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La biochimie est la chimie biologique qui étudie les molécules et les réactions des organismes vivants.
L’anabolisme synthétise des macromolécules en consommant de l’énergie, tandis que le catabolisme les dégrade en produisant de l’énergie
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L’anabolisme construit des macromolécules à partir de molécules simples et consomme de l’énergie. Le catabolisme dégrade les macromolécules et produit de l’énergie.
Sa chaîne latérale R
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Les acides aminés possèdent en commun une fonction amine, une fonction carboxylique et un carbone alpha. C’est la chaîne latérale R qui les distingue.
Vingt
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Vingt acides aminés naturels protéogènes entrent dans la composition des peptides et des protéines.
La valine
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La valine fait partie des huit acides aminés strictement essentiels chez l’être humain, qui doivent être apportés par l’alimentation. Les autres propositions sont synthétisables par l’organisme dans ce cadre.
Les aliphatiques possèdent une chaîne ouverte, tandis que les aromatiques possèdent une chaîne cyclique
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Les acides aminés aliphatiques possèdent une chaîne carbonée ouverte, alors que les acides aminés aromatiques possèdent une chaîne cyclique.
La lysine, l’arginine et l’histidine
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La lysine, l’arginine et l’histidine sont des acides aminés dibasiques chargés positivement. Le glutamate et l’aspartate sont dicarboxyliques et chargés négativement.
Sa fonction thiol peut former un pont disulfure avec une autre cystéine
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La fonction thiol SH de la cystéine peut s’associer à celle d’une autre cystéine pour former un pont disulfure, stabilisant ainsi la conformation tridimensionnelle des protéines. La méthionine possède un thioéther et ne forme pas ce type de pont.
Les acides aminés polaires sont hydrophiles et généralement plus solubles dans l’eau que les apolaires
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Les acides aminés polaires sont hydrophiles et sont généralement plus solubles dans l’eau. Les acides aminés apolaires sont hydrophobes.
Elle ne possède pas de carbone asymétrique, tandis que les autres sont généralement de conformation L
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La glycine ne possède pas de carbone asymétrique, contrairement aux autres acides aminés. Les acides aminés naturels des eucaryotes sont majoritairement de conformation L.
La phénylalanine, la tyrosine et le tryptophane
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La phénylalanine, la tyrosine et le tryptophane sont des acides aminés aromatiques qui absorbent particulièrement les UV à 280 nm, ce qui permet de doser les protéines.
6,0
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Le point isoélectrique se calcule en faisant la moyenne des deux pK qui entourent la forme zwitterionique : pI = (2,3 + 9,7)/2 = 6,0.
Vers la cathode, car il est chargé positivement
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Lorsque le pH est inférieur au pI, l’acide aminé porte globalement une charge positive et migre vers la cathode. Il ne migre pas lorsque le pH est égal au pI.
Hydroxylation en L-DOPA, puis décarboxylation par la DOPA-décarboxylase
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La tyrosine est d’abord hydroxylée en L-DOPA. La L-DOPA est ensuite décarboxylée par la DOPA-décarboxylase pour former la dopamine.
La dopamine, la noradrénaline et l’adrénaline dérivent de la tyrosine
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La tyrosine est le précurseur des catécholamines : elle mène à la dopamine, puis à la noradrénaline et enfin à l’adrénaline. L’histamine, en revanche, dérive de l’histidine.
L’iodation de la tyrosine en MIT et DIT, suivie de leur condensation
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La thyroperoxydase iode la tyrosine pour former d’abord la MIT et la DIT. La condensation de ces dérivés permet ensuite de produire la T3 et la T4.
La transamination transfère NH2 à un autre composé, tandis que la désamination le retire en libérant de l’ammoniac
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La transamination transfère le groupement NH2 vers un autre composé. La désamination retire directement ce groupement et libère de l’ammoniac.
Le glutamate, avec formation d’ammoniac et d’alpha-cétoglutarate
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Le glutamate est le seul acide aminé directement désaminé par la glutamate déshydrogénase mitochondriale. Cette réaction produit de l’ammoniac et de l’alpha-cétoglutarate.
Un déficit en phénylalanine-hydroxylase entraînant l’accumulation de phénylalanine et de phénylpyruvate
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La phénylcétonurie résulte d’un déficit en phénylalanine-hydroxylase. La phénylalanine s’accumule et du phénylpyruvate neurotoxique est produit.
Transformer l’ammoniac en urée grâce au cycle de l’urée
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L’uréogenèse hépatique transforme l’ammoniac toxique en urée grâce au cycle de l’urée. Au cours de ce cycle, l’arginase clive l’arginine en ornithine et en urée.
Entre le carboxyle de l’un et l’amine de l’autre, avec élimination d’eau
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La liaison peptidique est une liaison covalente entre le carboxyle d’un acide aminé et l’amine d’un autre, avec formation du groupement —CONH et élimination d’une molécule d’eau.
La liaison C–N est rigide, tandis que les articulations entre plans peptidiques peuvent tourner
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Le caractère partiellement double de la liaison peptidique la rend rigide et impose une géométrie fixe. La rotation se fait plutôt au niveau des articulations entre les plans peptidiques.
De l’extrémité N-terminale vers l’extrémité C-terminale
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Par convention, l’ordre des acides aminés d’une séquence protéique se note de l’extrémité N-terminale vers l’extrémité C-terminale.
3,6 résidus par tour, avec des liaisons hydrogène entre un carbonyle et l’amide situé quatre résidus plus loin
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L’hélice α compte environ 3,6 résidus par tour. Elle est stabilisée par des liaisons hydrogène entre le carbonyle d’un résidu et l’amide situé quatre résidus plus loin.
La proline
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La proline casse les hélices α en imposant un coude à la chaîne. À l’inverse, des acides aminés hydrophobes comme la méthionine, l’alanine et la leucine peuvent favoriser cette structure.
Un assemblage de brins β stabilisé par des liaisons hydrogène, pouvant être parallèle, antiparallèle ou mixte
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Le feuillet β résulte de l’association de brins β maintenus par des liaisons hydrogène. Ces brins peuvent être disposés parallèlement, antiparallèlement ou selon une organisation mixte.
L’organisation tridimensionnelle globale d’une chaîne polypeptidique
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La structure tertiaire correspond au repliement tridimensionnel global d’une protéine, déterminé par sa séquence primaire et stabilisé par des interactions covalentes et non covalentes. L’assemblage de plusieurs chaînes relève de la structure quaternaire.
Les interactions hydrophobes au cœur et les interactions ioniques souvent en surface au contact du solvant
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Les interactions hydrophobes contribuent principalement à l’organisation du cœur de la protéine. Les interactions ioniques et les liaisons hydrogène sont fréquentes en surface, où elles peuvent interagir avec le solvant.
C’est une unité structurale capable de se replier indépendamment du reste de la chaîne
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Un domaine est une unité structurale d’une protéine qui peut acquérir son repliement indépendamment du reste de la chaîne. Il ne correspond pas nécessairement à une extrémité ni à un seul type de structure secondaire.
La N-glycosylation concerne l’asparagine et débute dans le réticulum endoplasmique, tandis que l’O-glycosylation concerne la sérine ou la thréonine et se poursuit dans l’appareil de Golgi.
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La N-glycosylation vise l’asparagine et commence dans le réticulum endoplasmique. L’O-glycosylation vise la sérine ou la thréonine et se poursuit dans l’appareil de Golgi.
L’ajout covalent d’un phosphate sur une tyrosine, une sérine ou une thréonine par une kinase utilisant l’ATP.
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La phosphorylation est l’ajout covalent d’un phosphate sur une tyrosine, une sérine ou une thréonine. La kinase utilise l’ATP comme donneur de phosphate, tandis qu’une phosphatase retire généralement le phosphate.
Un polypeptide de 51 acides aminés comprenant une chaîne α de 21 acides aminés et une chaîne β de 30 acides aminés reliées par deux ponts disulfure interchaînes.
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L’insuline possède 51 acides aminés répartis entre une chaîne α de 21 résidus et une chaîne β de 30 résidus. Ces chaînes sont reliées par deux ponts disulfure interchaînes.
C’est un tétramère formé de deux chaînes α de 141 acides aminés et de deux chaînes β de 146 acides aminés, chacune contenant un hème Fe²⁺.
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L’hémoglobine est un tétramère constitué de deux chaînes α et de deux chaînes β. Chaque chaîne contient un groupement hème avec du fer Fe²⁺ qui participe au transport de l’oxygène.
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Qu'est-ce que la biochimie étudie?
Les molécules et réactions des organismes vivants.
Quels éléments composent principalement les molécules organiques?
Le carbone, l’hydrogène et l’oxygène.
Quel pourcentage du poids humain les molécules organiques représentent-elles avec l'eau?
96 % du poids du corps humain.
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