Introduction à l'écologie microbienne

📋 Plan du Cours

1. Microbes environnement
2. Fonctions microbiennes
3. Abondance bactéries
4. Organisation du vivant
5. Niveaux écologie microbienne
6. Méthodes d'étude
7. Interactions microbiennes
8. Cycles biogéochimiques
9. Rôles écologiques
10. Microbiote humain

📖 1. Microbes environnement

🔑 Notions clés & Définitions

• Microorganismes environnementaux : organismes microscopiques présents dans divers milieux naturels (sol, eau, air) qui jouent un rôle essentiel dans la dynamique écologique (Anthony Ranchou-Peyruse).
• Métagénome : ensemble de l'ADN de tous les micro-organismes d’un environnement donné, représentant une énorme diversité génétique (~5 x 10^30 procaryotes sur Terre) et fonctions potentielles (Anthony Ranchou-Peyruse).
• Valence écologique : capacité d'une espèce à occuper différents milieux en fonction des variations des facteurs écologiques, notamment la tolérance aux conditions environnementales (Dajoz, 1975).
• Organotrophes et lithotrophes : groupes fonctionnels de microbes se différenciant par leur source d’énergie et de carbone ; les premiers utilisent des composés organiques, les seconds des minéraux (Anthony Ranchou-Peyruse).
• Phototrophes oxygéniques et anoxygéniques : microbes capables de réaliser la photosynthèse avec ou sans oxygène, utilisant la lumière comme source d’énergie ; les premiers utilisent la chlorophylle, les autres des bactériochlorophylles (Anthony Ranchou-Peyruse).
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