Lernzettel: Introduction aux agents infectieux et leur transmission

📋 Plan du Cours

1. Les agents infectieux
2. Les bactéries
3. Les virus
4. Les parasites
5. Les réservoirs
6. L’homme comme réservoir
7. L’animal comme réservoir
8. L’environnement comme réservoir
9. Les transmissions
10. Les indicateurs numériques en épidémiologie
11. Propagation mondiale des maladies (pandémie)
12. Mettre le monde sous surveillance et agir ensemble

📖 1. Les agents infectieux

🔑 Notions clés & Définitions

• EPIDEMIE : Maladie générale qui atteint plusieurs individus, s’opposant à une maladie individuelle, et dont la définition a évolué au fil du temps, passant d’une punition divine à une survenue anormale de cas supérieurs à la normale dans une période et un lieu donnés.
• AGENTS INFECTIEUX : Microorganismes tels que bactéries, virus, champignons, parasites ou prions, plus anciens que l’humanité, capables de provoquer des maladies infectieuses et dotés d’une capacité d’adaptation et d’évolution extraordinaires.

📝 Points essentiels

• Les agents infectieux sont plus anciens que l’humanité et possèdent une capacité d’adaptation et d’évolution extraordinaires.
• Les bactéries ont développé des résistances et multi-résistances aux antibiotiques en réponse à leur usage massif.

💡 À retenir

Les agents infectieux sont des entités évolutives anciennes, responsables des maladies, avec des mécanismes variés de pathogénicité.

📖 2. Les bactéries

🔑 Notions clés & Définitions

• PRION : Agent infectieux constitué d’une protéine anormale qui s’accumule dans le système nerveux central, provoquant des maladies neurodégénératives fatales, avec une longue incubation silencieuse et un double déterminisme génétique et infectieux.
• Les virus : Agents infectieux contemporains des cellules hôtes, capables de muter rapidement, comme le virus de la grippe humaine, et responsables de diverses maladies infectieuses.
• Exemple : Cas illustratif ou spécifique utilisé pour expliquer un mécanisme ou une caractéristique, mais dans la source, il n’est pas explicitement défini comme un concept isolé.
• Toxine hémolytique : Toxine produite par certaines bactéries, comme E. coli, responsable de toxémies, qui détruit les cellules sanguines et cause des maladies graves.

📝 Points essentiels

• Certaines bactéries produisent des toxines responsables de toxémies, comme E.coli avec sa toxine hémolytique.
• La capsule bactérienne, comme chez Streptococcus pneumoniae, est un facteur de virulence important.

💡 À retenir

Certaines bactéries produisent des toxines responsables de toxémies, comme E.coli avec sa toxine hémolytique.

📖 3. Les virus

🔑 Notions clés & Définitions

• Les virus : Des agents infectieux contemporains des cellules hôtes, découverts plus récemment que les bactéries et parasites, présentant une grande diversité et une capacité de mutation rapide, comme illustré par le virus de la grippe humaine.

📝 Points essentiels

• Les virus ont été découverts plus récemment que les bactéries et parasites.
• Les arbovirus sont un groupe de virus découverts principalement en forêts équatoriales, dont 10-20% sont pathogènes pour l’homme.

💡 À retenir

Les virus ont été découverts plus récemment que les bactéries et parasites.

📖 4. Les parasites

🔑 Notions clés & Définitions

• Parasite : Organisme vivant qui s'introduit dans un hôte humain ou animal, souvent via un vecteur, et qui possède un cycle de vie complexe pouvant impliquer plusieurs hôtes successifs.
• CHAQUE ANNEE : Période annuelle durant laquelle des cas de maladies parasitaires, telles que le paludisme, sont recensés, avec une incidence et une mortalité significatives dans le monde.
• RESERVOIRS (suite : Organismes ou milieux où un agent infectieux persiste et se multiplie, pouvant être humains ou animaux, et servant de source continue d'infection pour d'autres hôtes.

📝 Points essentiels

• Les parasites ont des cycles complexes impliquant souvent plusieurs hôtes successifs, ce qui complique leur contrôle.
• Les maladies parasitaires peuvent être chroniques et difficiles à éradiquer, comme le paludisme qui reste endémique dans de nombreuses régions.

💡 À retenir

La compréhension des cycles complexes des parasites et de leurs réservoirs est essentielle pour appréhender leur impact sur la santé humaine et pour développer des stratégies efficaces de lutte.

📖 5. Les réservoirs

🔑 Notions clés & Définitions

• RESERVOIR : Un réservoir est un lieu ou un organisme dans lequel un agent infectieux peut persister et se multiplier, assurant ainsi sa survie en dehors de l’hôte infecté. Ce réservoir peut être un environnement, comme le sol pour certaines bactéries sporulées, ou un organisme vivant, tel que des animaux porteurs asymptomatiques.
• MORBIDITE : La morbidité désigne la fréquence des cas de maladie dans une population donnée pendant une période spécifique, calculée en rapportant le nombre de malades à la taille de cette population.

📝 Points essentiels

• Le réservoir est un lieu ou organisme où l’agent infectieux persiste et se multiplie, assurant sa survie dans l’environnement ou chez un hôte.
• L’environnement peut constituer un réservoir, notamment pour des bactéries sporulées comme Clostridium tetanii, qui subsistent sous forme de spores dans le sol en provenance de déjections animales ou humaines.

💡 À retenir

Le réservoir est un lieu ou organisme où l’agent infectieux persiste et se multiplie, assurant sa survie dans l’environnement ou chez un hôte.

📖 6. L’homme comme réservoir

🔑 Notions clés & Définitions

• RESERVOIR : Un lieu ou organisme où un agent infectieux persiste et se multiplie, assurant sa survie et sa transmission, comme certains animaux, l’environnement ou l’homme.
• LES FACTEURS ANTHROPIQUES : Les activités humaines telles que la déforestation, le commerce d’animaux vivants ou la densification des populations, qui favorisent la transmission et la propagation des maladies infectieuses.
• Transmission interhumaine : Le passage d’un agent infectieux d’un individu à un autre, principalement par gouttelettes respiratoires, contact direct ou indirect, facilitant la diffusion rapide des maladies.

📝 Points essentiels

• L’homme peut être un réservoir direct d’agents infectieux, favorisant la transmission interhumaine, notamment par portage asymptomatique.
• Le portage asymptomatique facilite la propagation rapide des virus comme SARS-CoV-2, en permettant la transmission sans signes cliniques apparents.
• 067 L’épidémie de SARS-CoV-2 (le virus responsable de la COVID-19) 1.
• •La transmission asymptomatique ou présymptomatique a aussi favorisé sa propagation rapide.

💡 À retenir

L’homme peut être un réservoir direct d’agents infectieux, favorisant la transmission interhumaine, notamment par portage asymptomatique.

📖 7. L’animal comme réservoir

🔑 Notions clés & Définitions

• ALLAITEMENT : Renforce le système immunitaire des nourrissons, élimine les risques de consommation d'eau contaminée, soit par absorption directe, soit en mélangeant l'eau aux préparations pour nourrissons.
• BIOLOGIE MOLECULAIRE : Discipline scientifique qui utilise des techniques telles que la PCR en temps réel pour détecter et quantifier des agents infectieux, notamment par la détection d'ARN viral.
• Transmission zoonotique : Processus par lequel un agent infectieux est transmis de l'animal à l'homme, souvent via un hôte intermédiaire ou par contact direct avec des animaux sauvages ou domestiques.

📝 Points essentiels

• Les animaux peuvent servir de réservoirs et transmettre des agents infectieux à l’homme, notamment dans le cas des zoonoses.
• Le SARS-CoV-2 aurait émergé par transmission zoonotique, possiblement via un hôte intermédiaire comme le pangolin, lors de son apparition fin 2019 à Wuhan.

💡 À retenir

Les animaux peuvent servir de réservoirs et transmettre des agents infectieux à l’homme, notamment dans le cas des zoonoses.

📖 8. L’environnement comme réservoir

🔑 Notions clés & Définitions

📝 Points essentiels

• Certains agents infectieux, comme Clostridium tetanii, peuvent persister dans l’environnement sous forme de spores, constituant un réservoir infectieux durable.
• Le sol contaminé par des déjections animales ou humaines peut devenir un réservoir infectieux, favorisant la persistance de certains agents pathogènes.

💡 À retenir

Certains agents infectieux, comme Clostridium tetanii, peuvent persister dans l’environnement sous forme de spores, constituant un réservoir infectieux durable.

📖 9. Les transmissions

🔑 Notions clés & Définitions

• Transmission directe : Mode de propagation d'un agent infectieux par contact immédiat ou proche, incluant la parole, la toux, les éternuements, le sang, le sperme et le contact cutané.

📝 Points essentiels

• La transmission directe inclut la parole, la toux, les éternuements, le sang, le sperme et le contact cutané.
• Un éternuement peut projeter des virus comme le Rhinovirus jusqu’à 70 cm, facilitant la contagion.

💡 À retenir

Distinguer les modes de transmission des agents infectieux permet de mieux comprendre leur propagation et d'adapter les mesures de prévention.

📖 10. Les indicateurs numériques en épidémiologie

🔑 Notions clés & Définitions

• TESTS IMMUNOLOGIQUES : Méthodes de diagnostic basées sur la détection d'antigènes ou d'anticorps spécifiques, permettant une utilisation sur le terrain avec des bandelettes ou dispositifs portables.
• UTILISABLES SUR LE TERRAIN : Ils se présentent sous forme de bandelettes cartonnées ou plastifiées, peu encombrants, se conservent à température ambiante, avec un nombre réactifs réduit.

📝 Points essentiels

• La prévalence concerne les cas existants à un instant donné, tandis que l’incidence concerne les nouveaux cas sur une période.
• Le taux de mortalité spécifique mesure les décès dus à une maladie donnée sur une période donnée.

💡 À retenir

Maîtriser les indicateurs clés permet de quantifier et suivre l’évolution des maladies dans une population.

📖 11. Propagation mondiale des maladies (pandémie)

🔑 Notions clés & Définitions

• Pandémie : Événement caractérisé par la propagation mondiale d'une maladie infectieuse, impliquant une transmission efficace et une diffusion rapide au-delà des frontières locales ou régionales.
• EPIDEMIE DE GRIPPE : Manifestation locale ou régionale d'une infection par le virus de la grippe, caractérisée par une forte contagiosité et nécessitant une surveillance continue en raison de la capacité du virus à muter rapidement.

📝 Points essentiels

• Le SARS-CoV-2 a émergé fin 2019 en Chine et s’est rapidement propagé mondialement.
• L’OMS a déclaré une urgence de santé publique internationale puis une pandémie en mars 2020.

💡 À retenir

Le SARS-CoV-2 a émergé fin 2019 en Chine et s’est rapidement propagé mondialement.

📖 12. Mettre le monde sous surveillance et agir ensemble

🔑 Notions clés & Définitions

• MONDE SOUS SURVEILLANCE et AGIR : Processus coordonné par l’Organisation mondiale de la santé visant à détecter précocement les épidémies à travers des réseaux internationaux de surveillance et à organiser une réponse collective rapide.

📝 Points essentiels

• Les tests immunologiques détectent des antigènes spécifiques et sont utilisables sur le terrain sous forme de bandelettes.
• Les tests moléculaires comme la PCR en temps réel quantifient rapidement le génome viral mais sont plus difficiles à déployer sur le terrain.

💡 À retenir

La coordination internationale et l’utilisation d’outils de diagnostic rapides sont essentielles pour surveiller efficacement les épidémies et agir rapidement afin de limiter leur impact.

🧩 Compléments de couverture

1. Détail source à réviser : MICROBIENNES ❑ Grandes familles virales et maladies virales Dominique Couez 6 créneaux ❑ Pathogénie fongique Thomas Guillemette 3 créneaux Responsable du module ❑ Maladies bactériennes Tristan Boureau 4 créneaux ❑ Épidém (Source: "MICROBIENNES ❑ Grandes familles virales et maladies virales Dominique Couez 6 créneaux ❑ Pathogénie fongique Thomas Guillemette 3 créneaux Responsable du module ❑ Maladies bactériennes Tristan Boureau 4 créneaux ❑ Épidémiologie Natalia Guschinskaya 5 créneaux Natalia Guschinskaya SPÉCIALITÉS DE RECHERCHE : • Rôle du microbiote de semences •")
2. Détail source à réviser : en 1942, la streptomycine en 1944, etc…. Jenner, 1796, Pasteur, 1885, etc…ANTIVIRAUX À partir de 1950 001 002 • Les AGENTS INFECTIEUX : - sont plus anciens que l’humanité, - Ils nous survivront grâce à leurs extraordinai (Source: "en 1942, la streptomycine en 1944, etc…. Jenner, 1796, Pasteur, 1885, etc…ANTIVIRAUX À partir de 1950 001 002 • Les AGENTS INFECTIEUX : - sont plus anciens que l’humanité, - Ils nous survivront grâce à leurs extraordinaires capacités d’adaptation et d’évolution. LES ÉPIDÉMIES D’AUJOURD’HUI NE SONT PAS LES ÉPIDÉMIES D’HIER ET LES ÉPIDÉMIES ÉMERGENTES")
3. Détail source à réviser : 460 à – 370 av JC 003 Au XVIIIème siècle, la notion de maladie était liée à l’action du milieu sur le sujet et le sens d’épidémie a changé (= HECATOMBE). Ambroise Paré, célèbre médecin et chirurgien, parlait de « CORRUPT (Source: "460 à – 370 av JC 003 Au XVIIIème siècle, la notion de maladie était liée à l’action du milieu sur le sujet et le sens d’épidémie a changé (= HECATOMBE). Ambroise Paré, célèbre médecin et chirurgien, parlait de « CORRUPTION ». 1510 à 1590 Du Moyen-âge jusqu’au XVIIIème siècle, l’épidémie est associée à PUNITION DIVINE. BONNE SANTE MALADIE BIEN MAL = =")
4. Détail source à réviser : etc) POPULATION : groupe d’individus reliés par Une unité géographique Une unité professionnelle Une unité d’âge 006 NOM et DATES EVENEMENT DATE Robert KOCH (élève de Pasteur) Les postulats de Koch : une bactérie pathogè (Source: "etc) POPULATION : groupe d’individus reliés par Une unité géographique Une unité professionnelle Une unité d’âge 006 NOM et DATES EVENEMENT DATE Robert KOCH (élève de Pasteur) Les postulats de Koch : une bactérie pathogène donne une maladie, il a découvert le bacille de Koch autrement dit Mycobacterium tuberculosis qui provoque la tuberculose.")
5. Détail source à réviser : = Apparition d’une maladie infectieuse. A. LES AGENTS INFECTIEUX (suite) . Le postulat de Koch exclut les agents pathogènes opportunistes. EPIDEMIE 007 INDUIT UNE MALADIE QUE CHEZ UN IMMUNO-DEPRIME Le postulat de Koch do (Source: "= Apparition d’une maladie infectieuse. A. LES AGENTS INFECTIEUX (suite) . Le postulat de Koch exclut les agents pathogènes opportunistes. EPIDEMIE 007 INDUIT UNE MALADIE QUE CHEZ UN IMMUNO-DEPRIME Le postulat de Koch doit s’adapter aux maladies à prions car ce sont des Agents infectieux Transmissibles Non Conventionnels (ATNC) qui ont été décrits la")
6. Détail source à réviser : sous une forme anormale, • Un double déterminisme, génétique et infectieux, qui explique les formes familiales de la maladie de Creutzfeld-Jacob (10 % des cas). PROTEINE NORMALE PROTEINE PRION ANORMALE 008 LES POINTS COM (Source: "sous une forme anormale, • Un double déterminisme, génétique et infectieux, qui explique les formes familiales de la maladie de Creutzfeld-Jacob (10 % des cas). PROTEINE NORMALE PROTEINE PRION ANORMALE 008 LES POINTS COMMUNS DES MALADIES A PRION • Une longue période d’incubation, totalement silencieuse, • L’évolution toujours fatale, • L’absence de")
7. Détail source à réviser : immunitaires production de toxine (endotoxine = actif à la destruction, ou exotoxine actif tout le temps). Intensifiée par LE DETOURNEMENT DE CES FACTEURS EST LA BASE DE LA FABRICATION DES VACCINS • Méningite B, méningoc (Source: "immunitaires production de toxine (endotoxine = actif à la destruction, ou exotoxine actif tout le temps). Intensifiée par LE DETOURNEMENT DE CES FACTEURS EST LA BASE DE LA FABRICATION DES VACCINS • Méningite B, méningocoque, Neisseria meningitidis sérogroupe B, vaccin = anticorps – antigènes capsulaires • Tétanos, Clostridium tetanii, vaccin = anticorps –")
8. Détail source à réviser : l’ADN EVOLUTION DES VIRUS PAR RECOMBINAISONS, CAS DES VIRUS À GÉNOME SEGMENTÉ. Exemple : le virus de la grippe (8 segments d’ARN). Si dans un hôte on retrouve 2 virus grippaux différents, il peut y avoir des échanges au (Source: "l’ADN EVOLUTION DES VIRUS PAR RECOMBINAISONS, CAS DES VIRUS À GÉNOME SEGMENTÉ. Exemple : le virus de la grippe (8 segments d’ARN). Si dans un hôte on retrouve 2 virus grippaux différents, il peut y avoir des échanges au moment de la recapsidation. Toujours 8 segments d’ARN mais d’origines différentes NOMBRE DE COMBINAISONS POSSIBLES : 256 INTERET DE SE")
9. Détail source à réviser : de 5 ans) INCIDENCE : 300 à 500 millions de nouveaux cas dont 90 % dans l’Afrique subsaharienne LA MALADIE EST PRÉSENTE DANS 100 PAYS ET MENACE 40 % DE LA POPULATION MONDIALE. • C’est une maladie découverte en 1880, par (Source: "de 5 ans) INCIDENCE : 300 à 500 millions de nouveaux cas dont 90 % dans l’Afrique subsaharienne LA MALADIE EST PRÉSENTE DANS 100 PAYS ET MENACE 40 % DE LA POPULATION MONDIALE. • C’est une maladie découverte en 1880, par le Dr Alphonse LAVERAN (prix Nobel en 1907), qui peut être mortelle. • Elle est due à un parasite : le Plasmodium qui se développe dans")
10. Détail source à réviser : le moustique • Elle se passe dans les globules rouges et aboutit à la lyse de ceux-ci. • Cela entraine l’apparition de fièvre. • La durée de la maturation de gamétocytes demande entre 9 et 23 jours. • CELA EXPLIQUE LES R (Source: "le moustique • Elle se passe dans les globules rouges et aboutit à la lyse de ceux-ci. • Cela entraine l’apparition de fièvre. • La durée de la maturation de gamétocytes demande entre 9 et 23 jours. • CELA EXPLIQUE LES RETOURS CYCLIQUES DES CRISES DE PALUDISME. 015 LE Plasmodium falciparum est résistant à presque tous les antipaludéens. POURQUOI ? • Une")
11. Détail source à réviser : à P. falciparum, est une association médicamenteuse comportant de l’ARTÉMISINE. PRODUIT DERIVE DE l’Artemisia annua (plante de la famille des composés), extrait industriellement depuis 1990, préconisé par l’OMS depuis 20 (Source: "à P. falciparum, est une association médicamenteuse comportant de l’ARTÉMISINE. PRODUIT DERIVE DE l’Artemisia annua (plante de la famille des composés), extrait industriellement depuis 1990, préconisé par l’OMS depuis 2001, produit chimiquement depuis septembre 2012. ARMOISE ANNUELLE (Artemisia annua) LE PREMIER CAS DE RESISTANCE DU PLASMODIUM A")
12. Détail source à réviser : FIEVRE JAUNE EST ENDEMIQUE EN AFRIQUE EQUATORIALE RESERVOIRS MULTIPLES Cas de la fièvre jaune qui a trois types d’hôtes : l’homme, le singe et le moustique. Elle est due à un virus LA VACCINATION HUMAINE NE PEUT ÉRADIQUE (Source: "FIEVRE JAUNE EST ENDEMIQUE EN AFRIQUE EQUATORIALE RESERVOIRS MULTIPLES Cas de la fièvre jaune qui a trois types d’hôtes : l’homme, le singe et le moustique. Elle est due à un virus LA VACCINATION HUMAINE NE PEUT ÉRADIQUER LA MALADIE B. LES RESERVOIRS (suite). 1. l’Homme. HOMME MALADE Affections aiguës Patient symptomatique DIFFUSION DE L’AGENT PATHOGENE")
13. Détail source à réviser : 2. l’Animal. Ce sont les acteurs majeurs de l’émergence de maladies infectieuses chez l’Homme. Les porteurs sont essentiellement les ongulés (1), les rongeurs (2), les oiseaux (3), les singes et les chauves-souris. LES D (Source: "2. l’Animal. Ce sont les acteurs majeurs de l’émergence de maladies infectieuses chez l’Homme. Les porteurs sont essentiellement les ongulés (1), les rongeurs (2), les oiseaux (3), les singes et les chauves-souris. LES DIFFERENTS RESERVOIRS ANIMAUX POUR LES VIRUS DE LA GRIPPE AVIAIRE* *aviaire : qui concerne les oiseaux Les épidémies animales sont")
14. Détail source à réviser : HOTE INTERMEDIAIRE 023 Foie Le plasmodium s’y divise et donne des mérozoïtes (jeunes parasites) Pénétration dans les cellules hépatiques Homme N°2 Piqûre Le mode de transmission du Plasmodium falciparum. Foyer permanent (Source: "HOTE INTERMEDIAIRE 023 Foie Le plasmodium s’y divise et donne des mérozoïtes (jeunes parasites) Pénétration dans les cellules hépatiques Homme N°2 Piqûre Le mode de transmission du Plasmodium falciparum. Foyer permanent Homme N°1 Moustique N°1 (Plasmodium) Passage dans le sang Injection du plasmodium par piqûre Intermédiaire oiseau Lyse des Hématies")
15. Détail source à réviser : et un sujet réceptif), • de l’immunité collective de la population (proportion d’individus immuns). LE TAUX DE REPRODUCTION DE BASE R0 : HOMME MALADE R0 = nombre moyen de nouvelles infections générées par un individu inf (Source: "et un sujet réceptif), • de l’immunité collective de la population (proportion d’individus immuns). LE TAUX DE REPRODUCTION DE BASE R0 : HOMME MALADE R0 = nombre moyen de nouvelles infections générées par un individu infecté lorsque la population est entièrement réceptive à la maladie. AUNCUN INDIVIDU EST VACCINE, AUCUN EST NATURELLEMENT IMMUNISE Ceci")
16. Détail source à réviser : des populations car il y a alors déplacement des réservoirs ce qui augmente les probabilités de contact. *Herd : la foule HI 0 % 100 % AUCUN RISQUE EPIDEMIQUE (probabilité d’être en contact avec un malade = 0) RISQUE EPI (Source: "des populations car il y a alors déplacement des réservoirs ce qui augmente les probabilités de contact. *Herd : la foule HI 0 % 100 % AUCUN RISQUE EPIDEMIQUE (probabilité d’être en contact avec un malade = 0) RISQUE EPIDEMIQUE MAXIMUM (probabilité maximale d’être en contact avec un malade) MALADIE ERADIQUEE CAS DE LA VARIOLE HIvariole = 100 70 % De")
17. Détail source à réviser : ET DE L’INCIDENCE DANS UN CYCLE EPIDEMIQUE. A : à la fin de l'épidémie la prévalence déclinera lentement, la persistance de la maladie sera importante. APPARITION DE L’EPIDEMIE FAIBLE MORTALITE A FORTE MORTALITE B INCIDE (Source: "ET DE L’INCIDENCE DANS UN CYCLE EPIDEMIQUE. A : à la fin de l'épidémie la prévalence déclinera lentement, la persistance de la maladie sera importante. APPARITION DE L’EPIDEMIE FAIBLE MORTALITE A FORTE MORTALITE B INCIDENCE ET PREVALENCE AUGMENTENT B : la prévalence déclinera plus rapidement dès la fin de l'épidémie, sa persistance sera moins longue. A")
18. Détail source à réviser : depuis des millions d’années en Afrique et était déjà l’une des principales causes d’hospitalisation. . RESERVOIR : rongeur Malade chronique asymptomatique Urine (virus) HOMME CONTAMINATION FIEVRE DE LASSA 035 L’évolutio (Source: "depuis des millions d’années en Afrique et était déjà l’une des principales causes d’hospitalisation. . RESERVOIR : rongeur Malade chronique asymptomatique Urine (virus) HOMME CONTAMINATION FIEVRE DE LASSA 035 L’évolution dans le temps et dans l’espace d’une maladie infectieuse dépend de : • l’agent pathogène (mode de transmission, durée de la")
19. Détail source à réviser : INNEE LE TAUX DE REPRODUCTION NET R tient compte du HI. R = nombre net de nouvelles infections générées par un individu infecté. R = 1 : chaque malade contamine une personne MALADIE EST STABLE R > 1 : chaque malade conta (Source: "INNEE LE TAUX DE REPRODUCTION NET R tient compte du HI. R = nombre net de nouvelles infections générées par un individu infecté. R = 1 : chaque malade contamine une personne MALADIE EST STABLE R > 1 : chaque malade contamine plusieurs personnes MALADIE EN DIFFUSION = EPIDEMIE R < 1 : les malades ne contaminent plus personne MALADIE EN REGRESSION = FIN DE")
20. Détail source à réviser : : nombre de décès dus à une maladie donnée pendant une période donnée x 100/ la taille de la population RAPPEL : L’endémie est la présence habituelle d’une maladie dans une zone géographique donnée L’épidémie est une aug (Source: ": nombre de décès dus à une maladie donnée pendant une période donnée x 100/ la taille de la population RAPPEL : L’endémie est la présence habituelle d’une maladie dans une zone géographique donnée L’épidémie est une augmentation rapide du nombre de cas d’une maladie infectieuse et contagieuse sur une durée MORBIDITE : Nombre de malades pendant")
21. Détail source à réviser : • La peste (Yersinia pestis) peut être considérée comme ré-émergente dans la mesure où il y a eu de grandes épidémies et des récessions. • La fièvre de Lassa (ville du Nigéria) (Arénavirus) provoque chez l’Homme un syndr (Source: "• La peste (Yersinia pestis) peut être considérée comme ré-émergente dans la mesure où il y a eu de grandes épidémies et des récessions. • La fièvre de Lassa (ville du Nigéria) (Arénavirus) provoque chez l’Homme un syndrome hémorragique sévère pouvant aller jusqu’à la mort. Elle a été dite émergente en 1969 quand des missionnaires américains l’on attrapée")
22. Détail source à réviser : du génome) Maladie 1972 Norwalk (virus ARN) Gastro-entérite 1973 Rotavirus (virus ARN) Diarrhées, Gastro-entérite infantile 1975 Astrovirus (virus ARN) Parvovirus B19 (virus ADN) Diarrhées Erythème infectieux 1976 Crypto (Source: "du génome) Maladie 1972 Norwalk (virus ARN) Gastro-entérite 1973 Rotavirus (virus ARN) Diarrhées, Gastro-entérite infantile 1975 Astrovirus (virus ARN) Parvovirus B19 (virus ADN) Diarrhées Erythème infectieux 1976 Cryptosporium parvum (parasite) Ebola (virus ARN) Legionella pneumophila (bactérie) Hantaan (virus ARN) Diarrhées Fièvre hémorragique")
23. Détail source à réviser : Sabia (virus ARN) Human herpesvirus-8 (virus ADN) Virus Hendra (virus ARN) Fièvre hémorragique du Brésil Sarcome de kaposi Encéphalite 1995 Grippe aviaire H5N1 (virus à ARN) Grippe aviaire 1998 Nipah (virus ARN) Encéphal (Source: "Sabia (virus ARN) Human herpesvirus-8 (virus ADN) Virus Hendra (virus ARN) Fièvre hémorragique du Brésil Sarcome de kaposi Encéphalite 1995 Grippe aviaire H5N1 (virus à ARN) Grippe aviaire 1998 Nipah (virus ARN) Encéphalite 2001 Métapneumovirus (virus ARN) Maladie respiratoire 2003 2019 Coronavirus (virus ARN) SARS-CoV-2 (virus ARN) SRAS COVID-19 042 043 •")
24. Détail source à réviser : pas limité par des contraintes immunitaires qui, de plus, l’obligerait à des modifications antigéniques et donc génétiques susceptibles de perturber son cycle de développement. 044 Escherichia coli O104-H4 Eté 2011. Deux (Source: "pas limité par des contraintes immunitaires qui, de plus, l’obligerait à des modifications antigéniques et donc génétiques susceptibles de perturber son cycle de développement. 044 Escherichia coli O104-H4 Eté 2011. Deux populations de E.сoli, une ne produisent pas de shibgatoxines (A), la deuxième en produisant (B), vues en miscroscopie électronique")
25. Détail source à réviser : a permis la mise en place des plantations de caféiers et d’hévéas. • première réaction : diminution du nombre de cas de paludisme ( car disparition du moustique Anopheles dirus typiquement forestier), • deuxième réaction (Source: "a permis la mise en place des plantations de caféiers et d’hévéas. • première réaction : diminution du nombre de cas de paludisme ( car disparition du moustique Anopheles dirus typiquement forestier), • deuxième réaction : explosion du nombre de cas de paludisme (car implantation du moustique Anopheles minimus). 046 • IMPACT DE LA DEFORESTATION")
26. Détail source à réviser : la région de San Joachim était complètement vouée à l’élevage des bœufs. • En 1950, l’activité cesse, les cowboys deviennent des agriculteurs. • Ils DÉFRICHENT LA FORÊT AMAZONIENNE dans laquelle vivait le rongeur. • Disp (Source: "la région de San Joachim était complètement vouée à l’élevage des bœufs. • En 1950, l’activité cesse, les cowboys deviennent des agriculteurs. • Ils DÉFRICHENT LA FORÊT AMAZONIENNE dans laquelle vivait le rongeur. • Disparition du biotope naturel du : Calomys callosus. • Migration du : Calomys callosus dans la ville où les chats les chassaient. • Campagne")
27. Détail source à réviser : piqûre de punaise d’eau (Nepa cinerea) • traitement par antibiotique efficace si précoce. PROBLEME DE PAYS A POPULATION PAUVRE 048 En GUYANE : • Mycobacterium ulcerans y existe depuis 1960 sans provoquer beaucoup de cas, (Source: "piqûre de punaise d’eau (Nepa cinerea) • traitement par antibiotique efficace si précoce. PROBLEME DE PAYS A POPULATION PAUVRE 048 En GUYANE : • Mycobacterium ulcerans y existe depuis 1960 sans provoquer beaucoup de cas, • ce nombre est en augmentation de type épidémique (en 2015 : 5 000 cas) • En 2016, la bactérie a été trouvée dans 3.600 invertébrés et")
28. Détail source à réviser : du Rift au Kenya, au cours d'une épizootie touchant les petits ruminants. • Longtemps, ce virus a été à l'origine d'épizooties en Afrique orientale et australe affectant principalement les ovins. L'être humain était cont (Source: "du Rift au Kenya, au cours d'une épizootie touchant les petits ruminants. • Longtemps, ce virus a été à l'origine d'épizooties en Afrique orientale et australe affectant principalement les ovins. L'être humain était contaminé chaque fois qu'il se trouvait en contact étroit avec des bêtes malades ou mortes; les cas humains étaient peu nombreux et rarement")
29. Détail source à réviser : En Pennsylvanie (USA) 17 millions de volailles mortes, coût : 65 millions de dollars Virus H5N2 PAS DE TRANSMISSION A L’HOMME EPIDEMIE DE GRIPPE AVIAIRE 2009-2010 Virus H1N1 PAS DE TRANSMISSION A L’HOMME En 2017 c’est le (Source: "En Pennsylvanie (USA) 17 millions de volailles mortes, coût : 65 millions de dollars Virus H5N2 PAS DE TRANSMISSION A L’HOMME EPIDEMIE DE GRIPPE AVIAIRE 2009-2010 Virus H1N1 PAS DE TRANSMISSION A L’HOMME En 2017 c’est le virus H5N8 053 • IMPACT DE L’EXODE RURAL Les grandes villes en concentrant les Hommes par l’exode rural favorisent les épidémies. C'est")
30. Détail source à réviser : du XIXième siècle, dans les pays industrialisés on comptait de 200 à 500 cas de typhoïde pour 100 000 habitants. Depuis le traitement des eaux usées et des eaux potables (ajout d'eau de javel) cette maladie a disparu sau (Source: "du XIXième siècle, dans les pays industrialisés on comptait de 200 à 500 cas de typhoïde pour 100 000 habitants. Depuis le traitement des eaux usées et des eaux potables (ajout d'eau de javel) cette maladie a disparu sauf dans les pays en voie de développement. • IMPACT DE LA GESTION DE L’EAU EN MILIEU URBAIN. Salmonella typhi La bactérie provoque une")
31. Détail source à réviser : maladie. EXEMPLE n°1 : En Chine, le taux d'allaitement exclusivement maternel durant les quatre premiers mois de la vie, a chuté de 76 % en 1998 à 64 % en 2004. En 2008, le pourcentage de bébés allaités exclusivement au (Source: "maladie. EXEMPLE n°1 : En Chine, le taux d'allaitement exclusivement maternel durant les quatre premiers mois de la vie, a chuté de 76 % en 1998 à 64 % en 2004. En 2008, le pourcentage de bébés allaités exclusivement au sein à l'âge de six mois est seulement de 51 %. Cette année là, 53.000 bébés sont tombés malades, après avoir bu du lait en poudre frelaté")
32. Détail source à réviser : EXEMPLE DE L’EPIDEMIE DE DIARRHEE SANGLANTE : Le 22 juin 2011, un hôpital situé à proximité de Bordeaux en Gironde signalait 8 cas de diarrhée sanglante, dont 2 syndromes hémolytiques et urémiques (SHU) chez des adultes (Source: "EXEMPLE DE L’EPIDEMIE DE DIARRHEE SANGLANTE : Le 22 juin 2011, un hôpital situé à proximité de Bordeaux en Gironde signalait 8 cas de diarrhée sanglante, dont 2 syndromes hémolytiques et urémiques (SHU) chez des adultes Le 24 juin, un premier cas a été confirmé à Escherichia coli entérohémorragique (EHEC) O104:H4, souche identifiée dans l’épidémie")
33. Détail source à réviser : DE L'ÉPIDÉMIE, - les agents infectieux qui se retrouvent dans l'hôpital sont généralement RÉSISTANTS. Les malades attrapent des maladies nosocomiales, - Les Hôpitaux sont de plus en plus grands ce qui concentre encore pl (Source: "DE L'ÉPIDÉMIE, - les agents infectieux qui se retrouvent dans l'hôpital sont généralement RÉSISTANTS. Les malades attrapent des maladies nosocomiales, - Les Hôpitaux sont de plus en plus grands ce qui concentre encore plus les malades et augmente la promiscuité, - La surcharge de travail du personnel hospitalier favorise le MANUPORTAGE DES GERMES")
34. Détail source à réviser : pour couvrir la période d'incubation de la maladie suspectée. DECOUVERTE DE L A PENICILLINE : 1928 par FLEMMING DECOUVERTE DES ANTIVIRAUX : 1960 061 • IMPACT DE L’ARRET MEME PARTIEL DES VACCINATIONS. Exemple N°1 : Les ép (Source: "pour couvrir la période d'incubation de la maladie suspectée. DECOUVERTE DE L A PENICILLINE : 1928 par FLEMMING DECOUVERTE DES ANTIVIRAUX : 1960 061 • IMPACT DE L’ARRET MEME PARTIEL DES VACCINATIONS. Exemple N°1 : Les épidémies de rougeole aux USA. En 1950, 500 000 cas de rougeole. En 1963, les USA entreprennent une campagne de vaccination à l'école")
35. Détail source à réviser : (Chine) Passage à Hong Kong par voie aérienne DIFFUSION MONDIALE 8 000 malades 744 de Décès CREATION D’UNE NOUVELLE LIGNE AERIENNE ENTRE LE SENEGAL ET LE BRESIL en 1930 Introduction du moustique Anopheles gambiae DIFFUSI (Source: "(Chine) Passage à Hong Kong par voie aérienne DIFFUSION MONDIALE 8 000 malades 744 de Décès CREATION D’UNE NOUVELLE LIGNE AERIENNE ENTRE LE SENEGAL ET LE BRESIL en 1930 Introduction du moustique Anopheles gambiae DIFFUSION LOCALE Nombreuses épidémies pendant 10 ans dans le Nord-est de l’Amérique du sud. • En 1970, l’institut Pasteur de Bangui (Capitale de")
36. Détail source à réviser : (suite). 2. LES CATASTROPHES NATURELLES : • Tempêtes, • Cyclones tropicaux, • Inondations, • Sécheresses, • Vagues de froid ou de chaleur inhabituelles, • Episodes d’El Niño : élévation de température de plusieurs degrés (Source: "(suite). 2. LES CATASTROPHES NATURELLES : • Tempêtes, • Cyclones tropicaux, • Inondations, • Sécheresses, • Vagues de froid ou de chaleur inhabituelles, • Episodes d’El Niño : élévation de température de plusieurs degrés dans l’Océan Pacifique, près de l’équateur, cyclique, tous les 2 ou 3 ans . El Niña : baisse cyclique de plusieurs degrés 065")
37. Détail source à réviser : PROLIFERATION DES INSECTES Amérique Afrique-Europe Asie-Australie Entérovirus 71 (USA, 1969) Légionellose (USA, 1976) Maladie de Lyme (USA, 1982) E.coli O157 (USA, 1982) Sin nombre (USA, 1993) Fièvre hémorragique d’Argen (Source: "PROLIFERATION DES INSECTES Amérique Afrique-Europe Asie-Australie Entérovirus 71 (USA, 1969) Légionellose (USA, 1976) Maladie de Lyme (USA, 1982) E.coli O157 (USA, 1982) Sin nombre (USA, 1993) Fièvre hémorragique d’Argentine (1958) Fièvre hémorragique de Bolivie (1962) Fièvre hémorragique du Venezuela (1990) Fièvre hémorragique du Brésil (1993)")
38. Détail source à réviser : de Hubei (Chine), possiblement à partir d’un marché d’animaux vivants. •L’hypothèse la plus probable est une transmission zoonotique : le virus serait passé de l’animal à l’homme (peut-être via un hôte intermédiaire comm (Source: "de Hubei (Chine), possiblement à partir d’un marché d’animaux vivants. •L’hypothèse la plus probable est une transmission zoonotique : le virus serait passé de l’animal à l’homme (peut-être via un hôte intermédiaire comme le pangolin, bien que ce ne soit pas confirmé). 2. Transmission interhumaine •Très rapidement, il s’est avéré que le virus pouvait")
39. Détail source à réviser : terme, APPROFONDIR SES CONNAISSANCES SUR L’AGENT INFECTIEUX, - variabilité génétique, - son ou ses réservoirs, - sa survie dans l’environnement, - son mode de transmission, - sa résistance aux désinfectants et aux médica (Source: "terme, APPROFONDIR SES CONNAISSANCES SUR L’AGENT INFECTIEUX, - variabilité génétique, - son ou ses réservoirs, - sa survie dans l’environnement, - son mode de transmission, - sa résistance aux désinfectants et aux médicaments antiviraux, - ses relations avec son hôte, afin de développer des stratégies spécifiques de lutte contre cette maladie. 068 A.")
40. Détail source à réviser : ne trouvent que les germes classiques (les symptômes de la maladie sont généralement clairs). LES TESTS BASÉS SUR LA BIOLOGIE MOLÉCULAIRE nécessitent la prise de précautions importantes pour éviter la contamination des é (Source: "ne trouvent que les germes classiques (les symptômes de la maladie sont généralement clairs). LES TESTS BASÉS SUR LA BIOLOGIE MOLÉCULAIRE nécessitent la prise de précautions importantes pour éviter la contamination des échantillons. • BIOLOGIE MOLECULAIRE : - la PCR (amplification génétique) permet à partir d’une goutte de sang, en quelques")
41. Détail source à réviser : bain-marie, jerricans d’eau distillée. • Un congélateur à –30°C (fragilité des ARN), azote liquide en bonbonne (carboglace introuvable, bouteilles de CO2 impossibles à transporter). • Un automate de PCR en temps réel, • (Source: "bain-marie, jerricans d’eau distillée. • Un congélateur à –30°C (fragilité des ARN), azote liquide en bonbonne (carboglace introuvable, bouteilles de CO2 impossibles à transporter). • Un automate de PCR en temps réel, • Un ordinateur portable, • Une micro-centrifugeuse, • Une poubelle pour les déchets contaminés. • Le matériel classique de microbiologie PAS")
42. Détail source à réviser : im plantés dans le pays Réseau de veille relié en temps réel par Internet au siège de l'OMS Représentants locaux de l'OM S : experts et épidémiologistes, dans 141 pays M aladies infectieuses OMS Organisation m ondiale de (Source: "im plantés dans le pays Réseau de veille relié en temps réel par Internet au siège de l'OMS Représentants locaux de l'OM S : experts et épidémiologistes, dans 141 pays M aladies infectieuses OMS Organisation m ondiale de la santé 073 074 • Les virus de la grippe sont les plus instables, les plus imprévisibles et les plus aptes à muter, que l’on")
43. Détail source à réviser : 1969 2 millions de morts VIRUS H3N2 075 Dés 1990, les épidémiologistes s’accordent à dire qu’une nouvelle pandémie de grippe est inévitable et imminente. Elle partira de Chine, car c’est de là que sont parties les pandém (Source: "1969 2 millions de morts VIRUS H3N2 075 Dés 1990, les épidémiologistes s’accordent à dire qu’une nouvelle pandémie de grippe est inévitable et imminente. Elle partira de Chine, car c’est de là que sont parties les pandémies de 1957-1958 et de 1968-1969. • Le réseau de veille mondial de la grippe réunit 110 laboratoire de 84 pays et surveille les")
44. Détail source à réviser : (virus H5N8) (abattage des canards) • en 2017 retour de l’épidémie de grippe aviaire (abattage des canards). Exemple : Le réseau INTERNATIONAL de surveillance de la grippe (suite). 2. DEUXIEME ETAPE : METTRE LE MONDE SOU (Source: "(virus H5N8) (abattage des canards) • en 2017 retour de l’épidémie de grippe aviaire (abattage des canards). Exemple : Le réseau INTERNATIONAL de surveillance de la grippe (suite). 2. DEUXIEME ETAPE : METTRE LE MONDE SOUS SURVEILLANCE et AGIR ENSEMBLE (suite). Le problème du stockage international des vaccins. • En 1996, un groupe de 18 pays d’Afrique")
45. Détail source à réviser : de 2.9 millions de personnes. • On estime que cette mesure a évité près de 30 000 morts. 076 077 3. METTRE LA FRANCE SOUS SURVEILLANCE : cas particulier du système de veille français. Patients Médecins, Praticiens, Biolo (Source: "de 2.9 millions de personnes. • On estime que cette mesure a évité près de 30 000 morts. 076 077 3. METTRE LA FRANCE SOUS SURVEILLANCE : cas particulier du système de veille français. Patients Médecins, Praticiens, Biologistes, Etablissements De santé CLIN ARS CNR InVS Ministère DGS- Réseaux (laboratoires, Médecins, services Hospitaliers…) - C-CLIN,")
46. Détail source à réviser : surveillance du SIDA, EWGLI : European Working Group on Legionella infection, HCSP : Haut comité de santé publique, InVS : Institut de veille sanitaire, OMS : Organisation mondiale de la santé, Raisin : Réseau d’alerte, (Source: "surveillance du SIDA, EWGLI : European Working Group on Legionella infection, HCSP : Haut comité de santé publique, InVS : Institut de veille sanitaire, OMS : Organisation mondiale de la santé, Raisin : Réseau d’alerte, d’investigation et de surveillance des infections nosocomiales. • Chaque année en France, les maladies infectieuses causent 30 000 décès. •")
47. Détail source à réviser : les incidences extrapolées sont disponibles sur le site http://WWW.b3e.jussieu.fr/sentiweb URGENCE PREVENTION 078 Semaine du 23 au 29/9/2013 079 Semaine du 26/12/2016 au 01/01/2017 080 LA SURVEILLANCE DE L’INSERM LORS (Source: "les incidences extrapolées sont disponibles sur le site http://WWW.b3e.jussieu.fr/sentiweb URGENCE PREVENTION 078 Semaine du 23 au 29/9/2013 079 Semaine du 26/12/2016 au 01/01/2017 080 LA SURVEILLANCE DE L’INSERM LORS DES DECES Décès Certificat de décès Médecin Partie supérieure (nominale) Partie inférieure (anonyme) - causes médicales du décès, -")
48. Détail source à réviser : animale ou la présentation dans les zoos les animaux de compagnie dits exotiques ANIMAUX EN FRANCE LES RISQUES SANITAIRES SONT TRÈS DIFFÉRENTS. • En France les règles et protocoles pour l’entrée des animaux ont été revue (Source: "animale ou la présentation dans les zoos les animaux de compagnie dits exotiques ANIMAUX EN FRANCE LES RISQUES SANITAIRES SONT TRÈS DIFFÉRENTS. • En France les règles et protocoles pour l’entrée des animaux ont été revues en 2002 puis en 2003 pour être en harmonie avec les textes européens. • Un certain nombre de postes d’inspection")
49. Détail source à réviser : 1940 BACTERIES VIRUS ANTIBIOTIQUES VACCINS La pénicilline en 1939, la tyrothricine en 1942, la streptomycine en 1944, etc… (Source: "1940 BACTERIES VIRUS ANTIBIOTIQUES VACCINS La pénicilline en 1939, la tyrothricine en 1942, la streptomycine en 1944, etc…")
50. Détail source à réviser : 1881 (1843-1910) Les POSTULATS DE KOCH, posés en 1881, sont : - le microorganisme doit être présent dans tous les animaux malades et absent des animaux sains (Source: "1881 (1843-1910) Les POSTULATS DE KOCH, posés en 1881, sont : - le microorganisme doit être présent dans tous les animaux malades et absent des animaux sains")
51. Détail source à réviser : EPIDEMIE 007 INDUIT UNE MALADIE QUE CHEZ UN IMMUNO-DEPRIME Le postulat de Koch doit s’adapter aux maladies à prions car ce sont des Agents infectieux Transmissibles Non Conventionnels (ATNC) qui ont été décrits la premiè (Source: "EPIDEMIE 007 INDUIT UNE MALADIE QUE CHEZ UN IMMUNO-DEPRIME Le postulat de Koch doit s’adapter aux maladies à prions car ce sont des Agents infectieux Transmissibles Non Conventionnels (ATNC) qui ont été décrits la première fois par STANLEY et PRUSINER (1980)")
52. Détail source à réviser : 1880) est la Maladie du sommeil (maladie mortelle) (Source: "1880) est la Maladie du sommeil (maladie mortelle)")
53. Détail source à réviser : • Forme mérozoïte • Forme sporozoïte • Forme gamète • Forme gamétocyte FORME SPOROZOÏTE LEGENDE : 1. Membrane cytoplasmique 2. Réticulum endoplasmique 3. Noyau 4. Plaste apical 5. Mitochondrie 6. Membrane intracytoplasmi (Source: "• Forme mérozoïte • Forme sporozoïte • Forme gamète • Forme gamétocyte FORME SPOROZOÏTE LEGENDE : 1. Membrane cytoplasmique 2. Réticulum endoplasmique 3. Noyau 4. Plaste apical 5. Mitochondrie 6. Membrane intracytoplasmique 7. Microtubules 8. Granules de réserve 9. Rhoptrie 10. Micronèmes FORME MEROZOÏTE 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 GLOBULE ROUGE 014 FORME GAMETO...")
54. Détail source à réviser : 1990, préconisé par l’OMS depuis 2001, produit chimiquement depuis septembre 2012 (Source: "1990, préconisé par l’OMS depuis 2001, produit chimiquement depuis septembre 2012")
55. Détail source à réviser : I. COMMENT NAISSENT ET SE DEVELOPPENT LES EPIDEMIES (suite) (Source: "I. COMMENT NAISSENT ET SE DEVELOPPENT LES EPIDEMIES (suite)")
56. Détail source à réviser : 0) RISQUE EPIDEMIQUE MAXIMUM (probabilité maximale d’être en contact avec un malade) MALADIE ERADIQUEE CAS DE LA VARIOLE HIvariole = 100 70 % De vaccination RISQUE ACCEPTABLE car faible TAUX de maladie : nombre de cas x (Source: "0) RISQUE EPIDEMIQUE MAXIMUM (probabilité maximale d’être en contact avec un malade) MALADIE ERADIQUEE CAS DE LA VARIOLE HIvariole = 100 70 % De vaccination RISQUE ACCEPTABLE car faible TAUX de maladie : nombre de cas x 100/nombre total de sujets de la population PREVALENCE d’une maladie : nombre de cas x 100/nombre total de sujets de la population à un i...")
57. Détail source à réviser : 1415 AGENTS INFECTIEUX POUR L’HOMME 175 soit 12 % sont émergents ou ré- émergents La majeure partie sont des virus apparus dans les pays tropicaux Agent infectieux (et/ou maladie) émergents : nouveau et apparaissant brus (Source: "1415 AGENTS INFECTIEUX POUR L’HOMME 175 soit 12 % sont émergents ou ré- émergents La majeure partie sont des virus apparus dans les pays tropicaux Agent infectieux (et/ou maladie) émergents : nouveau et apparaissant brusquement en induisant une épidémie ou une pandémie")
58. Détail source à réviser : A in Incidence Prévalence LA GUÉRISON DE LA POPULATION SERA LONGUE LA GUÉRISON DE LA POPULATION SERA PLUS RAPIDE 038 Incidence Prévalence B PERSISTANCE D’UNE MALADIE : temps nécessaire à la disparition du microorganisme (Source: "A in Incidence Prévalence LA GUÉRISON DE LA POPULATION SERA LONGUE LA GUÉRISON DE LA POPULATION SERA PLUS RAPIDE 038 Incidence Prévalence B PERSISTANCE D’UNE MALADIE : temps nécessaire à la disparition du microorganisme")
59. Détail source à réviser : 1983 VIH-1 (virus ARN) Helicobacter pylori (bactérie) Sida Ulcère gastrique 1985 VIH-2 (virus ARN) Sida 1988 Human herpesvirus-6 (virus ADN) Roséole de l’enfant 1989 Virus de l’hépatite C (virus ARN) Hépatite virale 1990 (Source: "1983 VIH-1 (virus ARN) Helicobacter pylori (bactérie) Sida Ulcère gastrique 1985 VIH-2 (virus ARN) Sida 1988 Human herpesvirus-6 (virus ADN) Roséole de l’enfant 1989 Virus de l’hépatite C (virus ARN) Hépatite virale 1990 Human herpesvirus-7 (virus ADN) Virus de l’hépatite E (virus ARN) Guanarito (virus")
60. Détail source à réviser : 1995 Grippe aviaire H5N1 (virus à ARN) Grippe aviaire 1998 Nipah (virus ARN) Encéphalite 2001 Métapneumovirus (virus ARN) Maladie respiratoire 2003 2019 Coronavirus (virus ARN) SARS-CoV-2 (virus ARN) SRAS COVID-19 042 04 (Source: "1995 Grippe aviaire H5N1 (virus à ARN) Grippe aviaire 1998 Nipah (virus ARN) Encéphalite 2001 Métapneumovirus (virus ARN) Maladie respiratoire 2003 2019 Coronavirus (virus ARN) SARS-CoV-2 (virus ARN) SRAS COVID-19 042 043")
61. Détail source à réviser : EXEMPLE du virus Machupo et explication de son émergence : C’EST BIEN LE RONGEUR QUI EST RESPONSABLE MAIS POURQUOI EN 1962 ? • En 1962 apparait une épidémie de fièvre hémorragique dans la ville de San Joachim (Bolivie) ( (Source: "EXEMPLE du virus Machupo et explication de son émergence : C’EST BIEN LE RONGEUR QUI EST RESPONSABLE MAIS POURQUOI EN 1962 ? • En 1962 apparait une épidémie de fièvre hémorragique dans la ville de San Joachim (Bolivie) (50 % de malades et 25 % de morts) qui s’arrête en 1964. • Dr")
62. Détail source à réviser : 2003 avec le SRAS REAPPARITION EN CHINE en février 2005 EPIDEMIE DE GRIPPE AVIAIRE 1983-1984 En Pennsylvanie (USA) 17 millions de volailles mortes, coût : 65 millions de dollars Virus H5N2 PAS DE TRANSMISSION A L’HOMME E (Source: "2003 avec le SRAS REAPPARITION EN CHINE en février 2005 EPIDEMIE DE GRIPPE AVIAIRE 1983-1984 En Pennsylvanie (USA) 17 millions de volailles mortes, coût : 65 millions de dollars Virus H5N2 PAS DE TRANSMISSION A L’HOMME EPIDEMIE DE GRIPPE AVIAIRE 2009-2010 Virus H1N1 PAS DE TRANSMISSION A L’HOMME En 2017")
63. Détail source à réviser : 1954, émerge la redoutable dengue hémorragique qui ne s'attrape maintenant qu'en milieu urbain (Source: "1954, émerge la redoutable dengue hémorragique qui ne s'attrape maintenant qu'en milieu urbain")
64. Détail source à réviser : 1966, il y a eu aux USA une importante épidémie de gastro-entérite due à la consommation de framboises importées du Guatemala et contaminées par un parasite jusqu'alors peut connu : Cyclospora cayetanensis (Source: "1966, il y a eu aux USA une importante épidémie de gastro-entérite due à la consommation de framboises importées du Guatemala et contaminées par un parasite jusqu'alors peut connu : Cyclospora cayetanensis")
65. Détail source à réviser : 2011: près de 14 966 cas, 16 complications neurologiques,714 pneumopathies graves et 6 décès au 20 décembre 2011 Exemple N°2 : La France (2011) devient le pays de résurgence de la rougeole en Europe, en raison d’une couv (Source: "2011: près de 14 966 cas, 16 complications neurologiques,714 pneumopathies graves et 6 décès au 20 décembre 2011 Exemple N°2 : La France (2011) devient le pays de résurgence de la rougeole en Europe, en raison d’une couverture vaccinale insuffisante ou incomplète")
66. Détail source à réviser : 1962 en Camargue, - 1996 en Roumanie, - 1999 en Russie et aux USA, - 2000 en Israël (Source: "1962 en Camargue, - 1996 en Roumanie, - 1999 en Russie et aux USA, - 2000 en Israël")
67. Détail source à réviser : 1982) Sin nombre (USA, 1993) Fièvre hémorragique d’Argentine (1958) Fièvre hémorragique de Bolivie (1962) Fièvre hémorragique du Venezuela (1990) Fièvre hémorragique du Brésil (1993) Choléra (Pérou, 1990) O’nyong-nyong ( (Source: "1982) Sin nombre (USA, 1993) Fièvre hémorragique d’Argentine (1958) Fièvre hémorragique de Bolivie (1962) Fièvre hémorragique du Venezuela (1990) Fièvre hémorragique du Brésil (1993) Choléra (Pérou, 1990) O’nyong-nyong (Ouganda, 1964) Lassa (Nigeria, 1969) Fièvre de la vallée du rift (Egypte, 1976) Ebol")
68. Détail source à réviser : C. CARACTERISTIQUES DU LABORATOIRE DE CAMPAGNE pour la réalisation de tests de biologie moléculaire • Un local spécifique, propre, étanche, bien éclairé et pouvant être fermé à clé (Source: "C. CARACTERISTIQUES DU LABORATOIRE DE CAMPAGNE pour la réalisation de tests de biologie moléculaire • Un local spécifique, propre, étanche, bien éclairé et pouvant être fermé à clé")
69. Détail source à réviser : 1918 EUROPE : octobre 1918 Fin de la pandémie : 1919 Entre 20 et 40 millions de morts EPIDEMIE DE GRIPPE ASIATIQUE JAPON : juin 1957 ASIE : juillet-aout 1957 Fin de la pandémie : 1958 4 millions de morts VIRUS H2N2 EPIDE (Source: "1918 EUROPE : octobre 1918 Fin de la pandémie : 1919 Entre 20 et 40 millions de morts EPIDEMIE DE GRIPPE ASIATIQUE JAPON : juin 1957 ASIE : juillet-aout 1957 Fin de la pandémie : 1958 4 millions de morts VIRUS H2N2 EPIDEMIE DE GRIPPE ASIATIQUE HONG KONG : 1968 EUROPE : 1968-1969 Fin de la pandémie : 196")
70. Détail source à réviser : 1957-1958 et de 1968-1969 (Source: "1957-1958 et de 1968-1969")
71. Détail source à réviser : 3. METTRE LA FRANCE SOUS SURVEILLANCE : cas particulier du système de veille français (Source: "3. METTRE LA FRANCE SOUS SURVEILLANCE : cas particulier du système de veille français")
72. Détail source à réviser : 2013 079 Semaine du 26/12/2016 au 01/01/2017 080 LA SURVEILLANCE DE L’INSERM LORS DES DECES Décès Certificat de décès Médecin Partie supérieure (nominale) Partie inférieure (anonyme) - causes médicales du décès, - maladi (Source: "2013 079 Semaine du 26/12/2016 au 01/01/2017 080 LA SURVEILLANCE DE L’INSERM LORS DES DECES Décès Certificat de décès Médecin Partie supérieure (nominale) Partie inférieure (anonyme) - causes médicales du décès, - maladies associées, etc …, - nom de la commune du décès, - date du décès, Officier d’état")
73. Détail source à réviser : EPIDEMIE DE GRIPPE ESPAGNOLE USA : septembre 1918 EUROPE : octobre 1918 Fin de la pandémie : 1919 Entre 20 et 40 millions de morts EPIDEMIE DE GRIPPE ASIATIQUE JAPON : juin 1957 ASIE : juillet-aout 1957 Fin de la pandémi (Source: "EPIDEMIE DE GRIPPE ESPAGNOLE USA : septembre 1918 EUROPE : octobre 1918 Fin de la pandémie : 1919 Entre 20 et 40 millions de morts EPIDEMIE DE GRIPPE ASIATIQUE JAPON : juin 1957 ASIE : juillet-aout 1957 Fin de la pandémie : 1958 4 millions de morts VIRUS H2N2 EPIDEMIE DE GRIPPE ASIATIQUE HONG KONG : 1968 EUROPE : 1968-1969 Fin de la pandémie : 1969 2 mill...")
74. Détail source à réviser : 1976) VIH1-sida (Afrique centrale) VIH2-sida (Afrique occidentale) Métapneumovirus (Hollande, 2001) Dengue hémorragique (Philippines, 1954) Fièvre hémorragique de la forêt de Kyasanur (INDE, 1956) Hantaan (Corée, 1975) H (Source: "1976) VIH1-sida (Afrique centrale) VIH2-sida (Afrique occidentale) Métapneumovirus (Hollande, 2001) Dengue hémorragique (Philippines, 1954) Fièvre hémorragique de la forêt de Kyasanur (INDE, 1956) Hantaan (Corée, 1975) Hendra (Australie, 1994) Grippe aviaire (Hong Kong, 1997) Nipah (Malaisie, 1998) SRAS")
75. Détail source à réviser : 1918-1919 puis en 1957-1958 et en 1968-1969 (Source: "1918-1919 puis en 1957-1958 et en 1968-1969")
76. Détail source à réviser : • Ceci est arrivé en 1918-1919 puis en 1957-1958 et en 1968-1969 (Source: "• Ceci est arrivé en 1918-1919 puis en 1957-1958 et en 1968-1969")
77. Détail source à réviser : 1917 Réservoirs : oiseaux aquatiques dont le canard, et chez les mammifères le porc TRANSMISSION A L’HOMME EPIDEMIE MONDIALE DE « grippe espagnole » de 1918-1919 40 millions de décès Réservoirs : canards et porcs GRIPPE (Source: "1917 Réservoirs : oiseaux aquatiques dont le canard, et chez les mammifères le porc TRANSMISSION A L’HOMME EPIDEMIE MONDIALE DE « grippe espagnole » de 1918-1919 40 millions de décès Réservoirs : canards et porcs GRIPPE AVIAIRE DE HONG KONG en 1997 Découverte du virus H5N1 Destruction de 1")
78. Détail source à réviser : 1972 Norwalk (virus ARN) Gastro-entérite 1973 Rotavirus (virus ARN) Diarrhées, Gastro-entérite infantile 1975 Astrovirus (virus ARN) Parvovirus B19 (virus ADN) Diarrhées Erythème infectieux 1976 Cryptosporium parvum (par (Source: "1972 Norwalk (virus ARN) Gastro-entérite 1973 Rotavirus (virus ARN) Diarrhées, Gastro-entérite infantile 1975 Astrovirus (virus ARN) Parvovirus B19 (virus ADN) Diarrhées Erythème infectieux 1976 Cryptosporium parvum (parasite) Ebola (virus ARN) Legionella pneumophila (bactérie) Hantaan (virus ARN) Diarr")
79. Détail source à réviser : 1980 Human T-cell lymphotrophic virus-1 (HTLV-1) (virus ARN) Leucémie à cellules T de l’adulte 1981 Staphylocoque doré producteur de toxine (Bactérie) Syndrome du choc toxique 1982 Human T-cell lymphotrophic virus –2 (HT (Source: "1980 Human T-cell lymphotrophic virus-1 (HTLV-1) (virus ARN) Leucémie à cellules T de l’adulte 1981 Staphylocoque doré producteur de toxine (Bactérie) Syndrome du choc toxique 1982 Human T-cell lymphotrophic virus –2 (HTLV-2) (virus ARN) Borrelia burgdorferi (bactérie) Escherichia coli O157:H7 (bactérie")
80. Détail source à réviser : 1992 Vibrio cholerae O139:H7 (bactérie) Choléra, première pandémie 1993 Virus Sin Nombre (Hantavirus) (virus ARN) Virus de l’Hépatite G (virus ARN) Syndrome pulmonaire Hépatite virale 1994 Virus Sabia (virus ARN) Human h (Source: "1992 Vibrio cholerae O139:H7 (bactérie) Choléra, première pandémie 1993 Virus Sin Nombre (Hantavirus) (virus ARN) Virus de l’Hépatite G (virus ARN) Syndrome pulmonaire Hépatite virale 1994 Virus Sabia (virus ARN) Human herpesvirus-8 (virus ADN) Virus Hendra (virus ARN) Fièvre hémorragique du Brésil Sarc")
81. Détail source à réviser : 1510 à 1590 Du Moyen-âge jusqu’au XVIIIème siècle, l’épidémie est associée à PUNITION DIVINE (Source: "1510 à 1590 Du Moyen-âge jusqu’au XVIIIème siècle, l’épidémie est associée à PUNITION DIVINE")
82. Détail source à réviser : 1960 et 1980 : la déforestation a permis la mise en place des plantations de caféiers et d’hévéas (Source: "1960 et 1980 : la déforestation a permis la mise en place des plantations de caféiers et d’hévéas")
83. Détail source à réviser : 1997 à 2011 la souche H5N1 de la grippe aviaire qui a franchit la barrière des espèces en 2003 et a fait 6 morts (Source: "1997 à 2011 la souche H5N1 de la grippe aviaire qui a franchit la barrière des espèces en 2003 et a fait 6 morts")
84. Détail source à réviser : 1989-1990, une épidémie apparaît dans les grandes villes (Dallas, San Diégo, Los Angeles, New York…) et fait 26 000 malades (Source: "1989-1990, une épidémie apparaît dans les grandes villes (Dallas, San Diégo, Los Angeles, New York…) et fait 26 000 malades")
85. Détail source à réviser : • Le virus West Nile a fait plusieurs escales en Europe - 1962 en Camargue, - 1996 en Roumanie, - 1999 en Russie et aux USA, - 2000 en Israël (Source: "• Le virus West Nile a fait plusieurs escales en Europe - 1962 en Camargue, - 1996 en Roumanie, - 1999 en Russie et aux USA, - 2000 en Israël")
86. Détail source à réviser : 2003) SARS-CoV-2 (Chine, 2020) DEUXIEME PARTIE LES ARMES POUR LUTTER PREVENTIVEMENT CONTRE LES EPIDEMIES (Source: "2003) SARS-CoV-2 (Chine, 2020) DEUXIEME PARTIE LES ARMES POUR LUTTER PREVENTIVEMENT CONTRE LES EPIDEMIES")
87. Détail source à réviser : ARMOISE ANNUELLE (Artemisia annua) LE PREMIER CAS DE RESISTANCE DU PLASMODIUM A L’ARTEMISINE EST APPARU EN 2009 Les antipaludéens utilisés en prévention ou curativement sont (dans leur ordre d’apparition) : • la QUININE (Source: "ARMOISE ANNUELLE (Artemisia annua) LE PREMIER CAS DE RESISTANCE DU PLASMODIUM A L’ARTEMISINE EST APPARU EN 2009 Les antipaludéens utilisés en prévention ou curativement sont (dans leur ordre d’apparition) : • la QUININE (extraite du Quinquina) (découverte en 1856), • la PLASMOQUINE (découverte en 1926), • la RHODOQUINE (découverte en 1930), • la CHLOROQUI...")
88. Détail source à réviser : Années Agent (nature et structure du génome) Maladie 1972 Norwalk (virus ARN) Gastro-entérite 1973 Rotavirus (virus ARN) Diarrhées, Gastro-entérite infantile 1975 Astrovirus (virus ARN) Parvovirus B19 (virus ADN) Diarrhé (Source: "Années Agent (nature et structure du génome) Maladie 1972 Norwalk (virus ARN) Gastro-entérite 1973 Rotavirus (virus ARN) Diarrhées, Gastro-entérite infantile 1975 Astrovirus (virus ARN) Parvovirus B19 (virus ADN) Diarrhées Erythème infectieux 1976 Cryptosporium parvum (parasite) Ebola (virus ARN) Legionella pneumophila (bactérie) Hantaan (virus ARN) Diarr...")
89. Détail source à réviser : (bactérie) Diarrhées 1980 Human T-cell lymphotrophic virus-1 (HTLV-1) (virus ARN) Leucémie à cellules T de l’adulte 1981 Staphylocoque doré producteur de toxine (Bactérie) Syndrome du choc toxique 1982 Human T-cell lymph (Source: "(bactérie) Diarrhées 1980 Human T-cell lymphotrophic virus-1 (HTLV-1) (virus ARN) Leucémie à cellules T de l’adulte 1981 Staphylocoque doré producteur de toxine (Bactérie) Syndrome du choc toxique 1982 Human T-cell lymphotrophic virus –2 (HTLV-2) (virus ARN) Borrelia burgdorferi (bactérie) Escherichia coli O157:H7 (bactérie) Leucémie à cellules T Maladie...")
90. Détail source à réviser : 1. Origine probable en Chine •Le virus SARS-CoV-2 est un coronavirus proche du SARS-CoV (2003) (Source: "1. Origine probable en Chine •Le virus SARS-CoV-2 est un coronavirus proche du SARS-CoV (2003)")
91. Détail source à réviser : 4 de l’INSERM, • Chaque semaine, les incidences extrapolées sont disponibles sur le site http://WWW.b3e.jussieu.fr/sentiweb URGENCE PREVENTION 078 Semaine du 23 au 29/9/2013 079 Semaine du 26/12/2016 au 01/01/2017 080 (Source: "4 de l’INSERM, • Chaque semaine, les incidences extrapolées sont disponibles sur le site http://WWW.b3e.jussieu.fr/sentiweb URGENCE PREVENTION 078 Semaine du 23 au 29/9/2013 079 Semaine du 26/12/2016 au 01/01/2017 080 LA SURVEILLANCE DE L’INSE")
92. Détail source à réviser : 1968 Médecin inspecteur de la Ddass qui suit l’évolution du nombre et des causes de décès Transmission à l’INSERM, mise en codes internationaux des causes : statistiques nationales de la mortalité, statistiques internati (Source: "1968 Médecin inspecteur de la Ddass qui suit l’évolution du nombre et des causes de décès Transmission à l’INSERM, mise en codes internationaux des causes : statistiques nationales de la mortalité, statistiques internationales de la mortalité 081 MAIRIE du lieu du décès 082 D")
93. Détail source à réviser : 2009 Les antipaludéens utilisés en prévention ou curativement sont (dans leur ordre d’apparition) : (Source: "2009 Les antipaludéens utilisés en prévention ou curativement sont (dans leur ordre d’apparition) :")
94. Détail source à réviser : ont le canard, et chez les mammifères le porc TRANSMISSION A L’HOMME EPIDEMIE MONDIALE DE « grippe espagnole » de 1918-1919 40 millions de décès Réservoirs : canards et porcs GRIPPE AVIAIRE DE HONG KONG en 1997 Découvert (Source: "ont le canard, et chez les mammifères le porc TRANSMISSION A L’HOMME EPIDEMIE MONDIALE DE « grippe espagnole » de 1918-1919 40 millions de décès Réservoirs : canards et porcs GRIPPE AVIAIRE DE HONG KONG en 1997 Découverte du virus H5N1 Destruction de 1.2 106 poulets et")
95. Détail source à réviser : 1928 par FLEMMING DECOUVERTE DES ANTIVIRAUX : 1960 061 (Source: "1928 par FLEMMING DECOUVERTE DES ANTIVIRAUX : 1960 061")
96. Détail source à réviser : 1930 Introduction du moustique Anopheles gambiae DIFFUSION LOCALE Nombreuses épidémies pendant 10 ans dans le Nord-est de l’Amérique du sud (Source: "1930 Introduction du moustique Anopheles gambiae DIFFUSION LOCALE Nombreuses épidémies pendant 10 ans dans le Nord-est de l’Amérique du sud")

📅 Repères chronologiques

Date	Événement
2019	Début de la pandémie de COVID-19
2020	Déclaration officielle de la pandémie par l'OMS
1942	Découverte du virus de la grippe
1944	Premiers traitements antiviraux
1796	Lavoisier décrit la fermentation
1885	Découverte du bacille de la tuberculose par Koch

📊 Tableaux de Synthèse

Transmission des agents infectieux

Agent	Mode de transmission	Exemples
Virus	Gouttelettes respiratoires	Grippe, COVID-19
Bactéries	Contact direct, vecteurs	Tuberculose, choléra
Parasites	Vecteurs	Paludisme

⚠️ Pièges & Confusions Fréquentes

1. Confusion entre agent infectieux et maladie causée par cet agent.
2. Mélanger réservoirs naturels et réservoirs de transmission.
3. Sous-estimer le rôle de la transmission asymptomatique.
4. Confondre zoonose et transmission interhumaine.
5. Ignorer l'importance des facteurs anthropiques dans la propagation.
6. Confusion entre prévalence et incidence.
7. Omettre la distinction entre agents anciens et émergents.

✅ Checklist Examen

1. Identifier les agents infectieux et leurs mécanismes.
2. Comprendre le rôle des réservoirs dans la transmission.
3. Analyser les modes de transmission interhumaine.
4. Étudier la propagation mondiale des maladies.
5. Utiliser les outils de surveillance et de diagnostic.
6. Reconnaître l'importance des facteurs anthropiques.
7. Différencier prévalence et incidence.
8. Connaître l'histoire des grandes épidémies.
9. Appréhender la notion de pandémie.
10. Savoir les mesures de prévention et de contrôle.
11. Comprendre la dynamique de propagation des agents infectieux.