Flashcards: Biochimie moléculaire et métabolisme — 69 cards

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1Question

Quelles fonctions chimiques possède un acide aminé ?

Answer

Une fonction carboxylique et une fonction amine primaire.

2Question

Qu'est-ce qu'un acide aminé en termes de solubilité et charge ?

Answer

C'est un ampholyte soluble dans l'eau.

3Question

Quels acides aminés ont une chaîne radicale polaire ionisable ?

Answer

L'aspartate, le glutamate, la lysine, l'arginine et l'histidine.

4Question

Quelle propriété ont les chaînes radicales des acides aminés polaires ionisables ?

Answer

Elles sont polaires et très hydrophiles.

5Question

Quels acides aminés polaires non ionisables peuvent établir des liaisons hydrogène ?

Answer

La sérine, la thréonine, l'asparagine, la glutamine, la cystéine et la tyrosine.

6Question

Quels groupes permettent aux acides aminés polaires non ionisables de lier l'eau ?

Answer

Les groupes OH ou SH.

7Question

Quels acides aminés ont une chaîne radicale apolaire ?

Answer

La glycine, la valine, l'isoleucine, la leucine, l'alanine, la proline, le tryptophane, la méthionine et la phénylalanine.

8Question

Qu'est-ce que le point isoélectrique d'une molécule ?

Answer

Le pH où la charge globale est nulle.

9Question

Qu'est-ce que la liaison peptidique ?

Answer

Une liaison entre la fonction COOH d'un acide aminé et la fonction NH2 d'un autre.

10Question

Qu'impose la décarboxylation sur un acide aminé ?

Answer

La perte du groupement COOH.

11Question

Qu'est-ce que la transamination ?

Answer

L'échange d'une fonction amine primaire entre un acide α-aminé et un α-cétoacide.

12Question

Sur quels acides aminés la phosphorylation ajoute-t-elle un phosphate ?

Answer

Sur les hydroxyles de la sérine, thréonine ou tyrosine.

13Question

Qu'ajoute l'acétylation sur les lysines ?

Answer

Un groupement acétyl COCH3 sur le NH2.

14Question

Qu'est-ce que la structure primaire d'une protéine ?

Answer

L'enchaînement de ses acides aminés.

15Question

Quels éléments composent la structure secondaire d'une protéine ?

Answer

Les hélices α, feuillets β, boucles et coudes.

16Question

De quoi dépend la structure tertiaire d'une protéine ?

Answer

De sa séquence primaire.

17Question

Quelle est l'importance de la structure tertiaire ?

Answer

Elle est essentielle au fonctionnement de la protéine.

18Question

Qu'est-ce que la structure quaternaire d'une protéine ?

Answer

L'association de plusieurs sous-unités par des liaisons faibles ou covalentes.

19Question

Quelle est la différence entre un oligopeptide et un polypeptide ?

Answer

Un oligopeptide contient moins de 10 à 20 acides aminés, un polypeptide jusqu'à 100.

20Question

Combien d'acides aminés contient une protéine ?

Answer

Plus de 100 acides aminés.

21Question

Qu'est-ce que la dénaturation d'une protéine ?

Answer

Une modification de la forme d’une protéine pouvant entraîner son inactivité.

22Question

Quel effet a une concentration d'urée à 8 M sur une protéine ?

Answer

Elle provoque une dénaturation réversible par rupture des liaisons hydrogène et des interactions hydrophobes.

23Question

Comment agit le β-mercaptoéthanol sur une protéine ?

Answer

Il provoque une dénaturation réversible en rompant les ponts disulfures.

24Question

De quoi est composée l'hémoglobine ?

Answer

De deux chaînes α et de deux chaînes β.

25Question

Que peut transporter chaque chaîne de l'hémoglobine ?

Answer

Un O2.

26Question

Comment le pH et la PaCO2 influencent-ils l'affinité de l'hémoglobine dans les poumons ?

Answer

Un pH plus élevé et une PaCO2 plus faible augmentent son affinité pour l’oxygène.

27Question

Comment le pH et la PaCO2 influencent-ils l'affinité de l'hémoglobine dans les organes ?

Answer

Un pH plus faible et une PaCO2 plus élevée diminuent son affinité pour l’oxygène.

28Question

Quel phénomène correspond à la libération d’oxygène par l’hémoglobine liée au pH et à la PaCO2 ?

Answer

L’effet Bohr.

29Question

Quelles sont les six classes d’enzymes ?

Answer

Oxydoréductases, transférases, hydrolases, lyases, isomérases et ligases.

30Question

Que décrit le modèle de Fischer pour l'interaction enzyme-substrat ?

Answer

Une complémentarité de type clé-serrure entre substrat et site actif.

31Question

Que décrit le modèle de Koshland concernant la liaison du substrat ?

Answer

Un ajustement induit par la liaison du substrat.

32Question

Quel rôle ont les acides aminés de contact dans une enzyme ?

Answer

Ils se lient au substrat et réalisent la catalyse.

33Question

Quel rôle ont les auxiliaires dans une enzyme ?

Answer

Ils réalisent l’ajustement induit.

34Question

Quel rôle ont les collaborateurs dans une enzyme ?

Answer

Ils stabilisent le site actif.

35Question

Qu'est-ce qu'une holoenzyme ?

Answer

Une enzyme catalytiquement active.

36Question

Quelle est la différence entre exopeptidase et endopeptidase ?

Answer

L'exopeptidase coupe aux extrémités, l'endopeptidase au sein de la chaîne.

37Question

Quelle extrémité coupe l'aminopeptidase ?

Answer

L'aminopeptidase coupe à l'extrémité N-terminale.

38Question

Quelle extrémité coupe la carboxypeptidase ?

Answer

La carboxypeptidase coupe à l'extrémité C-terminale.

39Question

Avant quel acide aminé la pepsine coupe-t-elle ?

Answer

La pepsine coupe avant un acide aminé aromatique.

40Question

Après quel acide aminé la trypsine coupe-t-elle ?

Answer

La trypsine coupe après un acide aminé basique.

41Question

Après quels acides aminés la chymotrypsine coupe-t-elle ?

Answer

La chymotrypsine coupe après un acide aminé aromatique, la leucine et la méthionine.

42Question

Après quel acide aminé l'élastase coupe-t-elle ?

Answer

L'élastase coupe après un acide aminé aliphatique.

43Question

Qu'est-ce qu'une isoenzyme ?

Answer

Une isoenzyme est une enzyme avec plusieurs formes mais la même activité, comme la LDH.

44Question

Qu'est-ce que la cyclisation en chimie des glucides ?

Answer

C'est la réaction entre la fonction aldéhyde ou cétone et un hydroxyle de la même molécule.

45Question

Quel carbone est appelé carbone anomérique dans un ose cyclique ?

Answer

Le carbone qui portait la fonction aldéhyde ou cétone, souvent le C1.

46Question

Que relie une liaison osidique entre deux oses ?

Answer

L'hydroxyle du carbone anomérique d'un ose à l'hydroxyle d'un autre ose.

47Question

Quelle liaison osidique implique deux hydroxyles anomériques ?

Answer

La liaison osido-oside.

48Question

Quel type de composé donne une liaison osido-oside ?

Answer

Un composé non réducteur.

49Question

Quelle liaison osidique implique un seul hydroxyle anomérique ?

Answer

La liaison osido-ose.

50Question

Quel type de composé donne une liaison osido-ose ?

Answer

Un composé réducteur.

51Question

Qu'est-ce que la glycolyse en termes de lieu et nombre de réactions ?

Answer

La glycolyse est une voie anaérobie cytoplasmique de 10 réactions.

52Question

Quel est le bilan global de la glycolyse ?

Answer

1 glucose + 2 NAD⁺ + 2 ADP + 2 Pi → 2 pyruvates + 2 NADH,H⁺ + 2 ATP + 2 H₂O.

53Question

Quelles réactions de la glycolyse sont régulées et par quelles enzymes ?

Answer

Les réactions 1, 3 et 10 sont régulées par l’hexokinase, la phosphofructokinase I et la pyruvate kinase.

54Question

Que devient le pyruvate en anaérobiose ?

Answer

Le pyruvate est fermenté en lactate avec régénération du NAD⁺.

55Question

Que devient le pyruvate en aérobiose ?

Answer

Le pyruvate entre dans la mitochondrie et devient de l’acétyl-CoA.

56Question

Qu'est-ce que le cycle de Krebs ?

Answer

Une voie aérobie mitochondriale de huit réactions oxydant l’acétyl-CoA.

57Question

Que produit le cycle de Krebs pour un acétyl-CoA ?

Answer

2 CO₂, 3 NADH,H⁺, 1 FADH₂ et 1 GTP.

58Question

Qu'est-ce que la phosphorylation oxydative ?

Answer

La conversion des coenzymes réduits en ATP via la chaîne respiratoire mitochondriale.

59Question

Combien d'ATP équivaut un NADH,H⁺ selon le cours ?

Answer

3 ATP.

60Question

Combien d'ATP équivaut un FADH₂ selon le cours ?

Answer

2 ATP.

61Question

Quel est le rendement total en ATP par glucose ?

Answer

36 ou 38 ATP selon le transport des NADH,H⁺.

62Question

De quoi est constitué un nucléotide ?

Answer

D'un nucléoside et d'un groupement phosphate.

63Question

Quelles sont les bases pyrimidiques ?

Answer

La cytosine, l’uracile et la thymine.

64Question

Quelles sont les bases puriques ?

Answer

L’adénine et la guanine.

65Question

Qu'associe un nucléoside ?

Answer

Une base azotée et un pentose par une liaison N-osidique.

66Question

Comment sont liés les nucléotides dans un acide nucléique ?

Answer

Par des liaisons phosphodiesters entre le groupement 3’ et le phosphate 5’.

67Question

Quelle est la polarité d’un brin d’acide nucléique ?

Answer

Elle va de l’extrémité 5’ à l’extrémité 3’.

68Question

Quelle est la structure de l’ADN ?

Answer

Une double hélice de deux brins complémentaires et antiparallèles.

69Question

Quelle est la structure primitive de l’ARN ?

Answer

Un brin linéaire pouvant former des motifs en double brin.

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1. Pourquoi la structure tertiaire est-elle essentielle pour une protéine ?

2. Comment définir une holoenzyme ?

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