Flashcards: Introduction à la génomique structurale et séquençage — 22 cards

Génomique structurale — définition ?

Caractérise la structure du génome entier.

Objectif de la génomique structurale ?

Déduire principes de structure et cibles médicaments.

Structure tridimensionnelle — rôle ?

Étudier la configuration 3D des protéines codées.

Protéomique structurale — domaine ?

Analyse de la structure 3D des protéines.

Structure génomique globale — but ?

Organiser l’ensemble des protéines codées.

Clonage réussi — importance du positionnement ?

Permet la manipulation précise du gène.

Analyse approfondie — étape clé ?

Augmentation de la résolution jusqu’au séquençage.

Méthodes de novo — principe ?

Clonage et expression pour analyser protéines.

Modélisation ab initio — base ?

Prédiction 3D à partir de la séquence.

Modélisation basée sur séquences — principe ?

Utilise homologie avec structures connues.

Séquençage — définition ?

Déterminer l’ordre des composants d’une molécule.

Séquençage ADN — avantage ?

Plus simple à réaliser que celui des protéines.

Séquençage protéines — limite ?

Coûteux et matériel spécialisé requis.

Erreurs de lecture — correction ?

Réitérer le séquençage pour fiabilité.

Maxam et Gilbert — technique ?

Clivage chimique ciblé des nucléotides.

Marquage 5' — utilisé dans ?

Maxam et Gilbert pour suivre les fragments.

Sanger — principe ?

Synthèse enzymatique avec ddNTP terminators.

ddNTP — rôle ?

Stoppe l’élongation de la chaîne.

NGS — signification ?

Nouvelles techniques de séquençage à haut débit.

PCR pour NGS — étape clé ?

Amplification par PCR des banques d’ADN.

EmPCR — principe ?

PCR en émulsion sur billes.

Bridge amplification — support ?

Sur flow-cell, formation de clusters.