1. Quelle est la conséquence principale de la création de plusieurs versions des données par ré-échantillonnage lors de la phase ascendante dans la reconstruction d'arbre ?
2. À quelle fréquence une nouvelle version de la base de données GenBank est-elle publiée ?
3. Quel est le rôle principal de la méthode du Neighbour Joining (NJ) en phylogénie ?
Matrice de divergence — définition ?
Proportion de sites différents entre deux séquences.
Alignement multiple — rôle ?
Comparer plusieurs séquences pour détecter homologues et relations évolutives.
Matrice des alignements par paires — fonction ?
Compiler distances ou scores entre chaque paire de séquences.
Arbre des distances — base ?
Construite à partir d'une matrice de distances entre séquences.
Alignement progressif — principe ?
Ajouter les séquences moins similaires selon leur similarité croissante.
UPGMA — hypothèse clé ?
Taux d’évolution constant (horloge moléculaire).
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