Introduction à la génomique fonctionnelle

📋 Plan du Cours

1. Définition de la génomique fonctionnelle
2. Problématique des omiques
3. Technologies et analyse des données
4. PCR en temps réel
5. Puces à ADN
6. Séquençage de nouvelle génération
7. Séquençage de l’ARN
8. Interprétation de l’expression génique
9. Génotypage et variations génétiques
10. Épigénétique et interactions ADN-protéines

📖 1. Définition de la génomique fonctionnelle

🔑 Notions clés & Définitions

• Génomique fonctionnelle : La génomique fonctionnelle étudie la relation entre le génotype et le phénotype à l’échelle du génome en intégrant plusieurs données moléculaires.
• Échelle du génome : L’échelle du génome correspond à l’étude simultanée de nombreuses portions du génome pour relier séquences et fonctions cellulaires.
• Gènes, transcrits et protéines : Gènes, transcrits et protéines sont les niveaux d’information combinés pour reconstituer comment l’ADN produit des fonctions complexes en cellule.

📝 Points essentiels

• Les études visent à comprendre une relation complexe génotype–phénotype à l’échelle du génome.
• Elles utilisent des essais à grande échelle et à haut débit pour suivre de nombreux gènes ou protéines en parallèle.
• L’approche combine des informations de gènes, de transcrits et de protéines pour découvrir des fonctions de régions du génome.

💡 Astuce mémo

Génotype → fonction : on relie ADN à gènes/transcrits/protéines à l’échelle du génome.

📖 2. Problématique des omiques